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文檔簡介
1、背景和目的
原癌基因Bmi-1(B-cell specific moloney leukemia virus insertion site1,Bmi-1)屬于轉(zhuǎn)錄抑制因子Polycomb家族,人類Bmi-1基因定位于10p11.23,由10個外顯子組成,cDNA全長3568bp,位于640~1620bp之間的開放閱讀框編碼一個含326個氨基酸,相對分子量為45kD的核蛋白質(zhì)。序列同源性對比顯示,人和小鼠的Bmi-1在DNA
2、水平和氨基酸水平上同源性分別為86%和98%。Bmi-1蛋白有氨基端環(huán)指結(jié)構(gòu)和中心區(qū)H-T-H結(jié)構(gòu)域,這對細胞復(fù)制壽命的延長和對抑制p16INK4a是必須的。實驗證實INK4a/ARF位點是Bmi-1基因的下游調(diào)控位點,直接受Bmi-1的負調(diào)控而影響細胞增殖和衰老。當Bmi-1高表達時,p16 INK4a表達下調(diào),促進cyclinD與CDK4/6形成復(fù)合物,通過p16 INK4a/cyclin D/Rb通路,促進細胞的生長和增殖;Bmi
3、-1高表達還抑制p19ARF,通過p19ARF/MDM2/p53通路,阻止細胞周期停滯和細胞凋亡。研究發(fā)現(xiàn)在許多腫瘤中存在Bmi-1基因的高表達,Bmi-1高表達提示預(yù)后不良。研究表明Bmi-1是通過作用于INK4a/ARF基因位點而影響細胞增殖及衰老的,并且,Bmi-1基因的表達水平還與腫瘤的侵襲、轉(zhuǎn)移密切相關(guān)。因此,本實驗擬利用RNA干擾技術(shù),沉默胃癌BGC823細胞Bmi-1基因的表達,觀察這種沉默對胃癌BGC823細胞衰老和轉(zhuǎn)移
4、的影響。
實驗方法
根據(jù)RNA干擾目標序列的選取原則,利用Dharmacon公司提供的RNA干擾設(shè)計軟件siDESIGN Center,(http://www.dharmacon.com/designcenter/designcenterpage.aspx)對Bmi-1序列進行設(shè)計。經(jīng)過BLAST同源性分析,確定RNA干擾靶序列。合成2對Bmi-1基因靶向RNA干擾序列的DNA單鏈,退火成雙鏈發(fā)卡樣DNA;利
5、用BamHI和XhoI酶切位點,將其重組入RNA干擾載體pRNAT-U6.2;利用pRNAT-U6.2的插入鑒定引物進行PCR擴增篩選得到重組子pRNAT-U6.2-si1104和pRNAT-U6.2-si1356;對重組子的插入序列進行DNA序列測定,并與設(shè)計序列做同源性比較。利用脂質(zhì)體LipofectAmineTM2000包裹,將pRNAT-U6.2-si1104和pRNAT-U6.2-si1356轉(zhuǎn)入人胃癌BGC823細胞中,同時
6、設(shè)立空載體對照組(轉(zhuǎn)染空載體pRNAT-U6-2的胃癌BGC823細胞)和空白對照組(未轉(zhuǎn)染人胃癌BGC823細胞);RT-PCR和Western-Blot方法檢測各組細胞Bmi-1 mRNA和蛋白表達水平;細胞衰老染色和Transwell實驗分別檢測沉默BGC823細胞Bmi-1表達對細胞衰老和對細胞浸潤轉(zhuǎn)移能力的影響。
實驗結(jié)果
1.進過篩選優(yōu)化設(shè)計,確定B-cell specific moloney l
7、eukemia virus insertion site1,Bmi-1(NM_005180)1104-1122位(GGAGGAGGTGAATGATAAA)、1356-1364位(GAGAGATGGACTGACAAAT)為Bmi-1 RNA干擾的靶序列。
2.PCR擴增篩選得到重組子pRNAT-U6.2-si1104和pRNAT-U6.2-si1356,測序分析其插入序列與設(shè)計的RNA干擾發(fā)卡樣DNA序列完全一致。
8、 3.實驗1組(轉(zhuǎn)染pRNAT-U6.2-si1104的胃癌BGC823細胞)、實驗2組(轉(zhuǎn)染pRNAT-U6.2-si1356的胃癌BGC823細胞)細胞Bmi-1 mRNA的相對表達量分別為0.062±0.009和0.114±0.013;空載體對照組和空白對照組細胞Bmi-1mRNA的相對表達量分別為0.314±0.041和0.321±0.038。實驗1、2組細胞Bmi-1 mRNA的相對表達量與2個對照組相比,Bmi-1 mR
9、NA的相對表達量顯著降低,統(tǒng)計學(xué)分析差異有顯著性(P<0.05)。
4.未轉(zhuǎn)染的胃癌BGC823細胞和轉(zhuǎn)染空載體pRNAT-U6.2的細胞中Bmi-1蛋白呈現(xiàn)高表達;而轉(zhuǎn)染靶向Bmi-1(pRNAT-U6.2-si1104和pRNAT-U6.2-si1356)的實驗組胃癌細胞中,Bmi-1蛋白表達被顯著抑制,其中轉(zhuǎn)染pRNAT-U6.2-si1104的胃癌BGC823細胞中Bmi-1蛋白表達幾乎完全被抑制。
10、5.實驗1、2組的平均細胞衰老率分別為28.3%±3.9%和25.9%±4.3%,空載體對照組和空白對照組的平均細胞衰老率分別為15.6%±2.7%和17.2%±3.1%;實驗1、2組與2個對照組相比平均細胞衰老率顯著增加,差異有非常顯著性(P<0.01)。
6.實驗1、2組穿透Matrigel的平均細胞數(shù)分別為22.4±4.2和33.6±5.5;空載體對照組和空白對照組分別為74.7±9.3和68.9±10.1。實驗1、
11、2組與2個對照組相比,穿透Matrigel的平均細胞數(shù)顯著減少,差異有顯著性(P<0.01)。
結(jié)論
1.Bmi-1(NM_005180)1104-1122位(GGAGGAGGTGAATGATAAA)、1356-1364位(GAGAGATGGACTGACAAAT)為RNA干擾的靶序列,構(gòu)建的RNA干擾載體pRNAT-U6.2-si1104和pRNAT-U6.2-si1356,轉(zhuǎn)染人胃癌BGC823細胞能顯著降
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