高粱MAPK基因的識別與分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、MAPKs級聯(lián)反應是真核生物普遍存在的信號轉(zhuǎn)導途徑,在植物生長發(fā)育、細胞周期調(diào)控和各種逆境脅迫信號轉(zhuǎn)導過程中發(fā)揮重要的作用。MAPKs級聯(lián)反應由保守蘇氨酸和酪氨酸的連續(xù)磷酸化來激活。高粱是一種高產(chǎn)量的谷類作物,也被作為是C4的模式植物,對各種非生物脅迫逆境具有很高的耐受性。隨著高粱基因組測序的完成,人們可以在全基因組水平上計算識別出高粱 MAPKs和MAPKKs基因,并進行鹽堿脅迫、冷脅迫和干旱脅迫等逆境脅迫下表達模式的研究,從而探索M

2、APKs級聯(lián)反應是如何參與高粱逆境脅迫條件下信號傳導的。
  本研究以高粱為材料,對已公布的植物MAPKs和MAPKKs蛋白序列進行多序列比,構(gòu)建隱馬可夫模型(HMMER),搜索本地蛋白數(shù)據(jù)庫。用 MEGA的 NJ方法構(gòu)建進化樹,研究MAPKs和MAPKKs基因家族成員的進化關系。利用計算識別技術和實時定量PCR技術對高粱MAPKs和MAPKKs基因家族成員進行計算識別、系統(tǒng)發(fā)生和非生物脅迫下的表達分析。
  結(jié)果表明高粱M

3、APKs基因家族共有16個成員,分為ABCD4組。ABC3組中各有2個基因,具備TDY模式;D組中有10個基因,具備TEY模式;高粱MAPKKs基因家族共有12個成員。在高粱 MAPKs基因家族成員中,NaCl脅迫下,所有MAPKs基因都表達上調(diào);Na2CO3脅迫下,SbMPK3、SbMPK10和SbMPK13表達上調(diào);冷脅迫下,SbMPK1、SbMPK3、SbMPK7、SbMPK10、SbMPK13和SbMPK14表達上調(diào);干旱脅迫下

4、,SbMPK1、SbMPK3、SbMPK8和SbMPK13表達上調(diào);其中SbMPK13在4中脅迫下都表達上調(diào)。在高粱MAPKKs基因家族成員中,NaCl脅迫下,所有MAPKKs基因都表達上調(diào);Na2CO3脅迫下,SbMPKK1、SbMPKK3和SbMPKK8表達上調(diào);冷脅迫下,SbMPKK7、SbMPKK8和SbMPKK9表達上調(diào);干旱脅迫下,SbMPKK5、SbMPKK7和SbMPKK8表達上調(diào);其中SbMPKK8在4中脅迫下都表達上

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