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文檔簡介
1、在真核生物中,MAP激酶(促分裂原活化蛋白激酶)級聯(lián)途徑是高度保守的重要的信號傳導途徑,三種逐級磷酸化的蛋白激酶 MAPKKK、MAPKK和 MAPK組成了 MAP激酶級聯(lián)信號傳導系統(tǒng)(MAPKs)。植物的生長發(fā)育、脅迫響應以及抗病反應等過程的調(diào)控都有MAPKs信號傳導途徑的參與。鑒于目前尚不全面了解棉花MAPKs各家族成員的組成和特征,并且對棉花MAPKs信號傳導系統(tǒng)在抗黃萎病中的功能和作用也缺乏細致的研究。為此,本文利用現(xiàn)已公布的雷
2、蒙德氏棉和亞洲棉的基因組數(shù)據(jù),并從 NCBI數(shù)據(jù)庫中收集陸地棉的MAPKs氨基酸序列,運用同源比對的方法對三種棉花(陸地棉、雷蒙德氏棉、亞洲棉)的MAPK、MAPKK和MAPKKK的氨基酸序列進行了聚類分析。結(jié)果顯示:棉花中MAPK家族具有特征性結(jié)構(gòu)TEY磷酸化位點或TDY磷酸化位點,依據(jù)其氨基酸序列可將其劃分為A、B、C和D族4個族,其中TEY類包含A、B和C族,TDY類只包含D族;棉花MAPKK家族具有特征性保守區(qū)域S/T-X5-S
3、/T和活性部位基序 D(I/L/V)K,依據(jù)其氨基酸序列可將其劃分為 A、B、C和 D4個族;棉花MAPKKK家族具有MEKK的特征性保守區(qū)域G(T/S)PX(W/Y)MAPEV和Raf的特征性保守區(qū)域GTXX(W/Y)MAPE(L/V),可將其分為MEKK類和Raf類兩組。
依據(jù)以上聚類分析的結(jié)果,從MAPK家族的A、B、C和D各族中選擇部分成員。通過采用VIGS(virus induced gene silencing)技
4、術(shù),即病毒誘導的基因沉默技術(shù),來研究以上這些MAPK基因在調(diào)控棉花抗黃萎病中的功能和作用。所選編碼MAPK的基因分別為:A族的ADI52626.1G.hirsutum、Gorai.3g139900.1、ADT65136.1G.hirsutum、Gorai.5g011100.1;B族的Gorai.1g158800.5、Gorai.1g158800.1、A32714、ADI52627.1G.hirsutum; C族的ABA00652.1G.
5、hirsutum、 Gorai.5g109500.1、Gorai.7g050000.1、ADI52622.1G.hirsutum;D族的ADI52623.1G.hirsutum、A01430、A37089、A25334、A24541、 A22593、AHW85276.1G.hirsutum、AET36534.1G.hirsutum、A22570、A07602。研究結(jié)果表明:基因ADI52623.1G.hirsutum(D族)、A0143
6、0(D族)、A37089(D族)、A25334(D族)、A24541(D族)、AET36534.1G.hirsutum(D族)、ADI52627.1G.hirsutum(B族)、ADI52626.1G.hirsutum(A族)和Gorai.3g139900.1(A族)沉默后,棉花對黃萎病菌的抗性未受到明顯的影響;而基因AHW85276.1G.hirsutum(D族)、A22593(D族)、A07602(D族)、A22570(D族)、Go
7、rai.7g050000.1(C族)、ADI52622.1G.hirsutum(C族)、Gorai.5g109500.1(C族)、ABA00652.1G.hirsutum(C族)、Gorai.1g158800.5(B族)、Gorai.1g158800.1(B族)、A32714(B族)、ADT65136.1G.hirsutum(A族)和Gorai.5g011100.1(A族)沉默后,棉花對黃萎病菌表現(xiàn)更為敏感,也表明了這13個MAPK基因
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