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文檔簡介
1、本實(shí)驗(yàn)室多年來從事華支睪吸蟲功能基因組學(xué)的研究,成功建立了華支睪吸蟲cDNA質(zhì)粒文庫,為深入探討華支睪吸蟲與膽管癌的相互關(guān)系打下了基礎(chǔ)?;阡\脂蛋白在部分癌癥發(fā)生發(fā)展中的作用,本文從華之睪吸蟲成蟲cDNA質(zhì)粒文庫中篩選出一個MYND型鋅指蛋白(MYND-ZF)基因,深入探討其結(jié)構(gòu)和功能,以期為華支睪吸蟲在膽管癌致病機(jī)制的系統(tǒng)研究中奠定一定的基礎(chǔ)。
研究目的:
從華支睪吸蟲成蟲的cDNA文庫中篩選出MYND-Z
2、F基因,通過生物信息學(xué)相關(guān)分析軟件預(yù)測MYND型鋅指蛋白的結(jié)構(gòu)和功能特征。
利用基因工程技術(shù)對該基因進(jìn)行原核克隆、表達(dá),獲得重組MYND-ZF蛋白,制備特異性抗體。
確定華支睪吸蟲MYND-ZF蛋白(CsMYND-ZF)的組織定位,初步推測其可能的生物學(xué)功能。
研究方法:
1 CsMYND-ZF基因生物信息學(xué)的分析
利用BLASTx方法搜索GenBank中的其他物種同
3、源蛋白序列,從華支睪吸蟲成蟲的cDNA文庫中識別出MYND-ZF基因,并進(jìn)行多序列的同源性比對,分析該蛋白在進(jìn)化過程中的規(guī)律。利用生物信息學(xué)相關(guān)軟件如SignalP、Motifscan、TargetP、Predictprotein等對MYND-ZF進(jìn)行結(jié)構(gòu)和功能的分析,對CsMYND-ZF的空間結(jié)構(gòu)和功能進(jìn)行預(yù)測。
2 CsMYND-ZF基因的重組、蛋自純化和免疫特性分析
2.1 CsMYND-ZF基因的重組
4、
依據(jù)目的基因的開放閱讀框(ORF)和質(zhì)粒pET-28a(+)酶切位點(diǎn)特點(diǎn),通過PCRdesign和DNAClub兩個軟件設(shè)計(jì)引物,PCR擴(kuò)增出MYND-ZF基因,利用限制性內(nèi)切酶BamHⅠ、XhoⅠ對PCR產(chǎn)物和空質(zhì)粒pET-28a(+)雙酶切,利用T4連接酶連接。然后PCR、雙酶切和測序鑒定重組質(zhì)粒。
2.2 CsMYND-ZF蛋白的表達(dá)和純化
將重組質(zhì)粒pET-28a(+)-CsMYND-
5、ZF轉(zhuǎn)化到大腸桿菌BL21/DE3,在IPTG的誘導(dǎo)下表達(dá)融合蛋白His-CsMYND-ZF,經(jīng)SDS-PAGE鑒定后,利用His柱進(jìn)行融合蛋白的純化。
2.3重組蛋白CsMYND-ZF的免疫特性分析
2.3.1免疫大鼠血清的制備
用純化后的重組蛋白(rCsMYND-ZF)免疫SD大鼠,制備含有抗rCsMYND-ZF抗體的免疫血清,并對大鼠血清進(jìn)行預(yù)吸附。
2.3.2感染華支睪吸蟲
6、血清的制備
從麥穗魚中收集華支睪吸蟲囊蚴,通過灌胃感染SD大鼠,成功后取血,分離的血清于-80C保存?zhèn)溆谩?br> 2.33檢測SD大鼠產(chǎn)生抗體的趨勢
通過ELISA方法,檢測rCsMYND-ZF免疫SD大鼠產(chǎn)生特異性抗體的動態(tài)變化。
2.3.4 CsMYND-ZF的免疫特性分析
利用Western Blotting方法,以rCsMYND-ZF免疫大鼠血清和華支睪吸蟲感染病人
7、的血清為一抗,對純化的rCsMYND-ZF的免疫原性和免疫反應(yīng)性進(jìn)行分析。
2.3.5 CsMYND-ZF對華之睪吸蟲病的診斷價值
利用ELISA方法,隨機(jī)選取30份華支睪吸蟲感染者的血清,20份日本血吸蟲感染者的血清,14份感染肺吸蟲感染者的血清,30份健康人的血清,比較rCsMYND-ZF與成蟲粗抗原在診斷上的敏感性,以及與日本血吸蟲和肺吸蟲感染者血清的交叉反應(yīng)。
3 CsMYND-ZF在華
8、支睪吸蟲發(fā)育不同時期表達(dá)和定位的研究
通過提取囊蚴、蟲卵及成蟲階段的總RNA,反轉(zhuǎn)錄成cDNA,然后以cDNA為模板利用特異引物擴(kuò)增目的基因,了解目的基因在不同時期的表達(dá)情況。以抗rCsMYND-ZF大鼠血清作為一抗,對華支睪吸蟲的成蟲、囊蚴石蠟組織切片進(jìn)行蛋白的組織定位。
4華支睪吸蟲MYND-ZF的真核細(xì)胞表達(dá)
4.1 CsMYND-ZF的真核重組及鑒定
從成蟲cDNA文庫當(dāng)中
9、擴(kuò)增目的基因,構(gòu)建真核表達(dá)質(zhì)粒pEGFP-N1-CsMYND-ZF。經(jīng)PCR、雙酶切及測序鑒定重組質(zhì)粒。
4.2 CsMYND-ZF的真核表達(dá)和鑒定
通過脂質(zhì)體法將pEGFP-N1-CsMYND-ZF轉(zhuǎn)染HeLa細(xì)胞,利用倒置熒光顯微鏡觀察培養(yǎng)24 h和48 h的表達(dá)情況,比較與空載體pEGFP-N1細(xì)胞表達(dá)的差異。通過RT-PCR檢測轉(zhuǎn)染重組質(zhì)粒pEGFP-N1-CsMYND-ZF的HeLa細(xì)胞中CsMYN
10、D-ZF基因在mRNA水平的轉(zhuǎn)錄情況。利用膜蛋白提取試劑盒提取重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)染的細(xì)胞的膜蛋白,以CsMYND-ZF免疫大鼠血清為一抗,二抗為羊抗大鼠IgG-HRP,利用Western Blotting鑒定蛋白水平的表達(dá)情況。
研究結(jié)果:
1 CsMYND-ZF基因生物信息學(xué)的分析
該基因全長1,847bp,Blastx分析其具有完整的開放閱讀框(ORF),ORF為21位開始至第1,460位,起始密碼
11、為ATG,終止密碼為TAA,編碼479個氨基酸。等電點(diǎn)和理論分子量分別是6.35和54.8kDa。PredictProtein預(yù)測推測蛋白序列二級結(jié)構(gòu)中β折疊(E)、α螺旋(H)和無規(guī)則卷曲(L)的比例分別是4.18%、56.37%、39.46%。拓?fù)鋵W(xué)結(jié)構(gòu)分析該蛋白含有一個跨膜區(qū):S102FPIYTLLYHELLVANLL119,N端位于膜內(nèi)(i),C端位于膜外(o)。Motifscan預(yù)測推測蛋白可能含有cAMP/cGMP依賴的蛋白
12、激酶磷酸化位點(diǎn),酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位點(diǎn),蛋白激酶C磷酸化位點(diǎn)和酪氨酸激酶磷酸化位點(diǎn)。InterProScan顯示該蛋白鏈中aa434~aa470屬于MYND型鋅指結(jié)構(gòu)域,推測其是鋅指蛋白家族中的一員。
2 CsMYND-ZF基因克隆、表達(dá)及免疫特性分析
通過特異性引物從成蟲cDNA中擴(kuò)增出目的基因片段,通過電泳鑒定DNA條帶在1,500bp左右。重組原核表達(dá)質(zhì)粒pET-28a(+)-CsMYND-ZF經(jīng)PCR
13、、雙酶切及測序后證實(shí)構(gòu)建成功。含有重組質(zhì)粒的大腸桿菌在IPTG誘導(dǎo)下表達(dá)重組蛋白,經(jīng)SDS-PAGE證實(shí)表達(dá)的融合蛋白與理論預(yù)測的分子量相符,目的蛋白經(jīng)親和層析純化后獲得。
ELISA檢測大鼠血清中抗體變化的趨勢,證實(shí)該重組蛋白能夠刺激大鼠產(chǎn)生特異性抗體,具有良好的免疫原性。
Western Blotting鑒定蛋白免疫特性的結(jié)果表明,重組蛋白可分別被免疫大鼠血清、感染華支睪吸蟲的人血清識別,進(jìn)一步證實(shí)重組蛋
14、白能夠刺激大鼠免疫系統(tǒng)產(chǎn)生相應(yīng)的特異性抗體,具有免疫原性。同時證實(shí)重組蛋白具有免疫反應(yīng)性,具有一定的免疫學(xué)價值。
以重組蛋白CsMYND-ZF和成蟲粗抗原為包被抗原,應(yīng)用ELISA方法檢測30份華支睪吸蟲感染者、20份日本血吸蟲感染者和14份肺吸蟲感染者血清的總IgG。結(jié)果提示,CsMYND-ZF對華支睪吸蟲感染者血清的檢出率為33.3%;粗抗原的檢出率為83.3%,與日本血吸蟲和肺吸蟲感染者的血清均存在交叉反應(yīng)。
15、 3 CsMYND-ZF在華支睪吸蟲發(fā)育不同階段表達(dá)和定位的研究
提取華支睪吸蟲囊蚴、蟲卵及成蟲的總RNA并反轉(zhuǎn)錄成相應(yīng)的cDNA,采用RT-PCR對CsMYND-ZF編碼蛋白在發(fā)育不同時期的表達(dá)進(jìn)行分析。結(jié)果顯示,CsMYND-ZF基因在成蟲和囊蚴階段有表達(dá),在蟲卵中沒有表達(dá)。
以制備的抗rCsMYND-ZF大鼠血清為一抗,對華支睪吸蟲的成蟲、囊蚴石蠟組織切片進(jìn)行CsMYND-ZF的免疫組織化學(xué)定位。
16、結(jié)果提示,CsMYND-ZF主要定位在成蟲和囊蚴幼蟲的體表。
4華支睪吸蟲MYND-ZF的細(xì)胞表達(dá)
通過上述分子克隆技術(shù)將目的基因定向克隆至真核表達(dá)質(zhì)粒pEGFP-N1中,經(jīng)PCR、雙酶切及測序鑒定證實(shí)真核重組質(zhì)粒構(gòu)建成功。pEGFP-N1-CsMYND-ZF轉(zhuǎn)染HeLa細(xì)胞培養(yǎng)24 h后,在顯微鏡下可觀察到綠色熒光分布于除細(xì)胞核以外的胞質(zhì)中,而48 h后胞質(zhì)中的熒光減弱,在部分細(xì)胞的細(xì)胞膜上可見稍強(qiáng)的綠色熒
17、光;而轉(zhuǎn)染空質(zhì)粒的HeLa細(xì)胞在24 h和48 h綠色熒光均勻分布于整個細(xì)胞內(nèi)。經(jīng)檢測,在轉(zhuǎn)染重組質(zhì)粒的HeLa細(xì)胞中CsMYND-ZF基因在mRNA水平和蛋白質(zhì)水平均有轉(zhuǎn)錄和表達(dá)。
研究結(jié)論:
1.從華支睪吸蟲成蟲cDNA文庫中識別出了CsMYND-ZF基因,CsMYND-ZF全長1,440個核苷酸,編碼479個氨基酸,等電點(diǎn)和理論分子量分別是6.35和54.8kDa。拓?fù)鋵W(xué)結(jié)構(gòu)分析該蛋白含有一個跨膜區(qū):S
18、102FPIYTLLYHELLVANLL119,N端位于膜內(nèi)(i),C端位于膜外(o)。含有MYND結(jié)構(gòu)域。
2.構(gòu)建了原核表達(dá)載體pET-28a(+)-CsMYND-ZF,大腸桿菌經(jīng)過IPTG誘導(dǎo)表達(dá)出重組融合蛋白,并純化得到了重組蛋白。ELISA顯示rCsMYND-ZF能夠刺激大鼠產(chǎn)生特異性抗體。Western Blotting結(jié)果表明rCsMYND-ZF具有較強(qiáng)的免疫原性和免疫反應(yīng)性。但診斷效果不佳。
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