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文檔簡介
1、溶菌酶是一種能水解由N-乙酰葡萄糖胺(NAG)和N-乙酰胞壁酸(NAMA)形成的β-1,4糖苷鍵的酶,在免疫反應(yīng)中有重要作用。本研究以日本鰻鱺(Anguilla japonica)為研究對象,根據(jù)日本鰻鱺基因組數(shù)據(jù)庫,預(yù)測并擴增出2類,共5個溶菌酶基因,其中1個C-型溶菌酶,4個G-型溶菌酶,分別命名為AJLysC、AJLysG1、AJLysG2、AJLysG3、AJLysG4。它們的cDNA全長分別為811、749、1352、1175
2、和733 bp,分別編碼143、193、185、185和187aa。經(jīng)SignalP預(yù)測,AJLysC和AJLysG1的N-端分別包括15和19aa的信號肽,另外3種溶菌酶不具有信號肽?;蚪M分析顯示,AJLysC,AJLysG2,AJLysG3,AJLysG4的基因結(jié)構(gòu)和其他魚類相似,C-型溶菌酶具有4個外顯子,G-型則具有5個。但是,AJLysG1的基因結(jié)構(gòu)與其他魚類G-型溶菌酶的不同,具有6個外顯子,這是魚類中首次發(fā)現(xiàn)有6個外顯子
3、的G-型溶菌酶基因。與其他魚類的溶菌酶比對發(fā)現(xiàn),AJLysG1缺失其他G-型溶菌酶通常認定的第2個酶活性位點氨基酸,Asp。AJLysC與其他很多物種的C-型溶菌酶具有較高的同一性,如與牙鲆的同一性為72.7%; G-型溶菌酶中AJLysG2,AJLysG3,AJLysG4彼此之間以及與其他物種G-型溶菌酶的同一性相對較高,而AJLysG1與其他物種以及如前所述3種G-型溶菌酶的同一性均不高,并且都在50%以下。
組織表達分析
4、顯示,所有5個溶菌酶基因在12種檢測的組織中均有表達。其中C-型溶菌酶在胃及免疫相關(guān)的組織表達量較高;G-型溶菌酶在在各組織/器官中的表達則差異較大,例如,AJLysG1在皮膚和肌肉中的表達量最高,AJLysG2在免疫組織/器官如血液、頭腎、體腎和鰓中表達量較高。經(jīng)遲緩愛德華氏菌刺激48小時后,這5個溶菌酶基因在大部分組織/器官中的表達量均有上調(diào),其中在血液,腸道和頭腎等組織的上調(diào)較為顯著。此外,本研究還構(gòu)建了AJLysG2,AJLys
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