人天然免疫基因BCL10的豬同源物的識別、克隆與初步表達分析.pdf

1、先天性免疫是機體防御病原體感染的第一道防線，而BCL10(B cell lymophoma-10)是先天性免疫系統(tǒng)的一個重要功能基因。體外細胞轉(zhuǎn)染試驗證實該蛋白具有激活NF-κB蛋白家族的信號傳導分子通路和誘導細胞凋亡的活性。BCL10蛋白的正常生理水平表達可以通過激活NF-κB信號通路促進B細胞的發(fā)育成熟，從而促進免疫因子的產(chǎn)生，增強機體的先天免疫和抵御細菌類病原體感染的能力；相反，BCL10蛋白的過量產(chǎn)生會促生一系列免疫抑制因子，可

2、能導致淋巴瘤等多種疾病的發(fā)生。為探討B(tài)CL10基因在豬體內(nèi)的功能，本研究結(jié)合生物信息學方法和分子生物學實驗，依照人BCL10基因序列克隆到BCL10蛋白的豬體同源性基因，并對該基因編碼蛋白質(zhì)的功能進行了系統(tǒng)的基因組學分析，同時對其表達規(guī)律和特點進行了初探，獲得了以下結(jié)果。 1.根據(jù)基因存在論(Gene Ontology)與同源比對算法，以已獲得的人BCL10基因為線索，根據(jù)豬基因表達序列標簽(Expressed sequence

3、 tag，EST)與豬基因組數(shù)據(jù)庫資料，電子克隆獲得了豬的同源基因。并對獲得的新基因進行了開放閱讀框(ORF)的尋找、全長cDNA的識別及基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控基序分析。分子生物學試驗驗證了該基因的存在，其ORF共702個核苷酸，編碼233個氨基酸。序列5'端富含GC序列，最大ORF第一個起始密碼子為ATG，緊鄰ACC序列，具典型的Kozak序列，符合真核細胞RNA有效轉(zhuǎn)錄的需要。同時，將克隆到的新基因序列提交至GenBank進行驗證，獲得注冊號

4、：ELJ088132。 2.利用生物信息學方法對豬BCL10蛋白遺傳進化特點及功能結(jié)構(gòu)域進行了系統(tǒng)的基因組學分析，推測其二級結(jié)構(gòu)以螺旋為主，不含有跨膜區(qū)，很可能是核內(nèi)蛋白。并將其定位于豬的4號染色體(chromosome 4)上，確定存在3個外顯子。其編碼的氨基酸含有一個CARD結(jié)構(gòu)域，從而推測其在細胞凋亡中扮演著重要角色。為對其功能的深入研究指明方向。 3.采用半定量PCR檢測了豬在正常情況下7個重要組織(心臟、腎臟、

5、脾臟、胸腺、大腦、肝臟和下頜淋巴結(jié)組織)中BCL10基因mRNA表達豐度，利用SPSS11.5軟件進行單因素試驗統(tǒng)計分析與顯著性檢驗。研究結(jié)果表明，BCL10基因mRNA在脾臟中表達最高，胸腺、大腦和下頜淋巴結(jié)表達次之，肝臟只有微量表達，腎臟沒有檢測到表達。初步掌握了該基因在豬體內(nèi)的表達特點。 4.將BCL10基因與高效的帶有綠色熒光標記的真核表達載體pEGFP-C1相連，構(gòu)建了重組質(zhì)粒pEGFP-BCL10。利用 Lipofe

6、ctamine 2000 Regent轉(zhuǎn)染pEGFP-BCL10和pEGFP-C1質(zhì)粒于PK-15細胞中，由最佳G418濃度抗性篩選在12 d后分別得到轉(zhuǎn)染pEGFP-BCL10與pEGFP-C1的陽性細胞。顯微鏡下觀察到典型的帶有綠色熒光標記的細胞形態(tài)，進一步用RT-PCR方法驗證BCL10基因得到了成功表達。同時，構(gòu)建了表達BCL10蛋白的原核表達載體pET-BCL10。將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化BL21(DE3)宿主菌，用IPTG進行誘導表達