藏雞三個基因的SNPs檢測及其與生長性狀的關(guān)聯(lián)分析和金水烏雞資源群體的構(gòu)建.pdf

1、藏雞是我國青藏高原在原始飼養(yǎng)狀態(tài)下保存下來的珍貴家禽品種。藏雞具有耐寒、抗病、抗缺氧、肉質(zhì)鮮美、藥用價值較高,耐粗放和可觀賞性強(qiáng)等優(yōu)良特性,同時也有生長速度慢、產(chǎn)蛋率低的缺點(diǎn)。如何在保存好這一珍貴遺傳資源的同時,通過經(jīng)濟(jì)雜交和產(chǎn)品開發(fā)利用好藏雞就成為當(dāng)前重要的研究課題。
　　 本研究以我室所建的藏雞與隱性白羽群體為材料,通過利用生物信息學(xué)分析方法,利用分子生物學(xué)技術(shù)克隆和分離與藏雞生長性狀有關(guān)的基因,為分子標(biāo)記輔助選擇提供分子基

2、礎(chǔ)。主要取得了如下結(jié)果:
　　 1.根據(jù)雞SNPs數(shù)據(jù)庫信息設(shè)計(jì)引物,通過PCR方法對MSTN基因進(jìn)行SNPs篩查,發(fā)現(xiàn)第1外顯子上有2個同義突變位點(diǎn)A2100G,A2109G。對于2個位點(diǎn),G等位基因均占優(yōu)勢,每個位點(diǎn)的3種基因型頻率在2個品種間均沒有顯著差異。與藏雞的部分生長性狀的關(guān)聯(lián)結(jié)果表明,A2100G位點(diǎn)與16周齡體重存在顯著相關(guān)(P<0.01);A2109G位點(diǎn)與初生脛長、4周齡管圍存在極顯著的相關(guān)(P<0.01)。

3、
　　 2.根據(jù)雞SNPs數(shù)據(jù)庫信息設(shè)計(jì)引物,通過PCR方法對CMYA3基因進(jìn)行SNPs篩查,發(fā)現(xiàn)第4外顯子上有4個同義突變位點(diǎn),T1182C,A4950G,A7776G,A8140G。對于T1182C位點(diǎn),T等位基因占優(yōu)勢；A4950G,A等位基因占優(yōu)勢;A7776G,A8140G,G等位基因均占優(yōu)勢;每個位點(diǎn)的3種基因型頻率在2個品種間均沒有顯著差異。與藏雞的部分生長性狀的關(guān)聯(lián)結(jié)果表明,T1182C位點(diǎn)與2周齡體重存在顯著的

4、相關(guān)(P<0.05)；A4950G位點(diǎn)與2周齡體重和4周齡脛長呈相關(guān)趨勢；A7776G位點(diǎn)與初生脛長顯著相關(guān)(P<0.05)；A8140G位點(diǎn)與16周齡體重極顯著相關(guān)(P<0.01)。
　　 3.根據(jù)雞SNPs數(shù)據(jù)庫信息設(shè)計(jì)引物,通過PCR方法對CMYA5基因進(jìn)行SNPs篩查,發(fā)現(xiàn)第2外顯子上有2個錯義突變位點(diǎn)T1541G(Ser-Cys),T1618C(Val-Gly)。對于2個位點(diǎn),T等位基因占優(yōu)勢,每個位點(diǎn)的3種基因型頻率