ghsr基因三個snp位點與雞生產(chǎn)性狀的關(guān)聯(lián)性分析

1、廣東 農(nóng)業(yè) 科學(xué) 2 0 1 0年第 8 期 G H S R基因三個 S N P位點與雞生產(chǎn)性狀的關(guān)聯(lián)性分析 陳 宇， 方梅 霞， 徐 海平 ， 謝 亮， 張 德 祥 ，聶 慶 華 f 1 ． 華 南農(nóng) 業(yè) 大學(xué) 動物科 學(xué)學(xué) 院 ， 廣東 廣 州 5 1 0 6 4 2 ； 2 ． 暨南大 學(xué) 醫(yī)學(xué)院 實驗 動物 管理 中心 ， 廣 東 廣州 5 1 0 6 3 2 )摘 要 ： 根據(jù) 已發(fā)表 的雞 G H S R 基 因 S N

2、 P位 點 ， 利用 P C R — R F L P技術(shù) 檢測 該基 兇 C 一 1 8 9 6 A、 C 一 1 4 5 9 T和 A — l 0 2 2 C3個 S N P位 點在 華 南農(nóng)業(yè) 大學(xué) 杏花 雞X 隱性 白洛克雞 全 同胞 F代 資源 群體 中 的多態(tài)性 ， 并 構(gòu)建 單倍 型 ， 進 行方 差分 析 。結(jié) 果表 明 ， 這 3個 S N P位點 與 其生 長 、 屠體 性 狀都 不 相關(guān) ( P > 0 ． 0

3、 5 ) 。所 構(gòu)建 的 單倍 型 與 單個 S N P的分 析結(jié) 果 一致 ， 也 與各 生 長 、 屠體 性狀 都 不 相關(guān) (P >0 ． 0 5 )表 明這 3個 S N P不是雞 生 長和 屠體性 狀 的重要 分子 標(biāo)記 。關(guān)鍵 詞 ： 雞 ； G H S R基 因 ； 生 長性狀 ； 屠體 性 狀 ； 關(guān) 聯(lián)分 析 中 圖分 類號 ： $ 8 3 1 ； Q 7 8 9文獻標(biāo) 識碼 ： A文章編 號 ： 1 0 0 4

4、 — 8 7 4 x( 2 0 1 0 ) 0 8 — 0 0 0 9 — 0 4An a l y s i so na s s o c i a t i o n so ft h r e eS NPa tGh r e l i nr e c e p t o r( G HS R)g e n ewi t hc h i c k e np r o d u c t i o nt r a i t sC H E NY u ’ ， F A N GM e i

5、- x i a， X UH a i — p i n g， X I EL i a n g ’ ， Z H A N GD e - x i a n g， N I EQ i n g - h u a( 1 ． C o l l e g eo f A n i m dS c i e n c e ， S o u t hC h i n a A g r i c u h u r a lU n i v e r s i t ) ' , G u a n g

6、z h o u5 1 0 6 4 2 ， C h i n a ；2 ． D e p a r t m e n to f L ( d o o r a t o r yA n i m a lS c i e n c e ， M e d i c a lC o l l e g eo f nU n i v e r s i t y , G u a n g z h o u5 1 0 6 3 2 ， C h i n a )A b s t r a c t ：

7、A c c o r d i n gt ot h es i n g l en u c l e o t i d ep o l y m o r p h i s m ( S N P ) o fG h r e l i nr e c e p t o r( G) g e n e ， t h ep r i m e r sw e r ed e s i g n e df o rg e n o t y p i n gt h r e eS N Po fG H

8、S Rg e n e( C 一 1 8 9 6 A， C 一 1 4 5 9 Ta n dA 一 1 0 2 2 C ) ． T h e s ep o l y m o r p h i s m so fG H S Rg e n ew e r eg e n o t y p e db yP C R —RF L Pi naF ，f u l 1s i bc h i c k e np o p u l a t i o nt oi n v e s t

9、i g a t et h e i ra s s o c i a t i o n sw i t hp r o d u c t i o nt r a i t s ． T h er e s u l t ss h o w e dt h a tn os i g n i f i c a n ta s s o c i a t i o no ft h e s et h r e eS N Pw i t ha n yg r o w t ha n dc a

10、r c a s st r a i t sw a sf o u n df P > 0 ． 0 5 ) ． A s s o c i a t i o na n a l y s i so fh a p l o t y p e si n d i c a t e ds i m i l a rr e s u l t swi t ht h a to fS NP ．I tw a sc o n c l u d e dt h a tC— l8 9 6

11、A ． C一1 4 5 9 Ta n dA 一10 2 2 Co ft h eGS Rg e n ew e r en o ti mp o r t a n tmo l e c u l a rma r k e r sf orc h i c k e ng r o w t ha n dc a r c a s st r a i t s ．Ke ywo r d s ： C h i c k e n ； G HS Rg e n e ； g r o w

12、t ht r a i t s ； c a r c a s st r a i t s ； a s s o c i a t i o na n a l y s i s早期人們認為 ， 生長激 素( G r o w t hH o r m o n e ， G H) 的釋 放 主要受 下丘 腦 分 泌 的——生 長激 素 釋放 激 素 ( G r o w t hH o r m o n eR e l e a s i n gH o r m o n e

13、， G H R H)和 生 長 抑 素 ( S o m a t o s t a t i n ， S S 或 S R I F ) 的 正 負 調(diào) 控 。隨 著研 究 的 深入 ，越 來 越 多 的研 究 表 明 ， 生 長 素 ( G h r e l i n ) 同 樣 具 白 促 進 生 長 激 素 釋 放 的 功 能 ， 并 且 能 影 響食 欲 、 調(diào) 節(jié) 代 跚 及 能 量 平 衡 ， 進而對機體 生長發(fā)育發(fā)揮重 要作用l l1

14、。但 G h r e l i n功 能 的正 常 發(fā) 揮 是 通 過 與 其 受 體 G 日 5 R ( G r o w t hH o r m o n eS e c r e t a g o g u eR e c e p t o ro rG h r e l i nr e c e p t o r )結(jié) 合 開 始 的 。因此 ， G H S R 的 生 物 學(xué) 功 能 受 到 了越 來 越 多 的 重 視 基 因敲 除 研 究 也 證 實

15、． G H S R 基 因 敲 除 的 大 鼠與 對 照 組 相 比 ．每 日攝人量 、 體重和脂肪沉積都 降低【； G H S R基 因敲除的 小 鼠 與 對 照 鼠相 比 ．其 食 欲 、體 重 和 脂 肪 的 積 累也 降 低 了， 而且能優(yōu)先利 用脂肪作 為能量來源 ． 敲除同時還影 響 了小 鼠的運動活性 和血糖水平同 。由此可 見 ． G H S R 是調(diào)節(jié) 機 體 體 重 和 能 量 平 衡 的 一 個 重 要 組 成 部

16、 分 。 與 哺 乳 動 物 不 同的是 ， 禽類 ( 或鳥類 ) 中 G H R H對 G H 的促 釋放作 用 比較微 弱 ， 甚至 有人認為 G H R H基 因在禽類 ( 鳥類 ) 中并 不 存 在 。因 此 ， 研 究 G H S R 對 于禽 類 的生 長 調(diào)控 可 能具 有 重 要 的 意 義 。由于 G H S R基 因的重 要作用 ，近 年來對 該基因 的結(jié) 收稿 日期 ： 2 0 1 0 — 0 1 ～ 0 6基金

17、項 目： 國家 “ 8 6 3 ” 重大 專項 ( 2 0 1 0 A A 1 0 A 1 0 2 )作者 簡介 ： 陳宇 ( 1 9 8 5 一 ) ， 男 ， E - m a i l ： e h e n y u 1 9 8 5 @1 6 3 ． c o r n通訊作 者 ： 聶慶 華 ( 1 9 7 5 一 ) ， 男 ， 博士 ， 副教 授 ， E - m a i l ： n q l n g h u a @s c a u ． e

18、d u ． a n9構(gòu) 和基 因轉(zhuǎn) 錄調(diào)控等研究越來越 多 ． 基 因的多態(tài)性與機體 生 長 、 脂 肪 沉 積 的相 關(guān) 性 研 究 也 成 為 熱 點 。 G H S — R屬 螺 旋 7次跨膜 的 G蛋 白偶聯(lián)受體l， 研究表 明 G H S R基因編 碼 區(qū) 的 S N P ( 1 7 1 T ／ C ) 可 能 與 肥 胖 相 關(guān) l } 1 ， 在 日本 人 群 中該 位 點 的 C C基 因 型 是 導(dǎo) 致 神 經(jīng) 性 易

19、 餓病 的 一 個 因素 1 9 1 。此 外 ， P a n t e l 等I。 I 對 2個身 高矮 小家族 的研究 發(fā)現(xiàn) ， G H S R基 因 外 顯 子 1 上 的 6 1 l C > A( A 2 0 4 E ) 減 少 了細 胞 表 面 受體 的 表達 ， 選擇性損害 G H S R 活性導(dǎo)致機體的生長障礙。 在家畜 的 研 究 中發(fā) 現(xiàn) ． G H S R基 因 外 顯 子 的 2個 完 全 連 鎖 的 S N

20、Pn t 4 5 6 ( G ／ A 1和 n t 6 6 7 ( C F F ) 與 6月齡南 陽牛 體重和 日增重顯 著相關(guān) ? J 。家禽 的研 究 顯示 ， G HS R基 因外顯 子 1上 的G1 8 7 9 0 0 3 6 A 位 點 變 異 與 雞 皮 下 脂 肪 帶 寬 度 極 顯 著 相 關(guān) 。 內(nèi)含 子 上 的 c ． 7 3 9 + 7 2 6 T > C位 點 與 雞 生 長 和 屠 體 性 狀 顯 著 相

21、 關(guān) _ l 3 1高 等真核生物基 因表達調(diào)控 涉及 的順式元件 多是位 于非編碼 區(qū)的 D N A調(diào)控 序列 ， 如啟 動子 、 增強子 等 ， 也是 反式作用 因子的 D N A特異結(jié)合部位I · 4 1 。因此 ， 非編碼 區(qū)的 序列 變異生 物學(xué) 意義或許更 為重要 。Ma g e r 等 In s ] 認為 ，G 日啟 動 子 區(qū) 的 多 態(tài) 性 可 能 會 通 過 長 期 干 預(yù) 和 改 變 G H S R基 因

22、表達 ， 調(diào) 控 G h r e l i n 受體 信號 ， 從而影 響體重的 變化 。本研究選擇 G5 尺基 因作 為影響雞 生長和屠體 性 狀 的候 選基 因 ， 根據(jù) F a n g 等 對該 基 因 S N P位 點篩選 的 結(jié)果 ， 研究該 基因 5側(cè)翼 區(qū)部分 變異在 “ 杏花雞× 隱性 白洛克雞 ”全 同胞 F資源群 體中與雞生長和屠體性狀 的關(guān) 聯(lián)性 ， 為研究 G H S R基 因功能及標(biāo)記輔助選擇 ( M

23、A S ) 提 高 雞 生 產(chǎn) 性 能 提 供 參 考 。圖 2 雞不 同基 因型 個體 P C R產(chǎn) 物的 測序 結(jié)果 表 2S N P位點在 群體 中 的基 因型頻 率 和基 因頻 率 表 3 雞 G H S R 基因 S N P s 對 生長和 屠體 性狀 的效 應(yīng)分 析 S N P位點 基 因型 頻率 ( ％)等位 基 兇頻率 ( ％)值 因型( 1 ． 9 8 ％) 、 C等位基因頻率( 1 0 ． 4 9 ％) 較低 ，

24、 | ) ( 2 值為 4 ． 0 5 。當(dāng) 自由度 d f 為 1 時 ，曬 “3 ． 8 4 。C 一 1 8 9 6 A、 C 一 1 4 5 9 T和 A 一 1 0 2 2 C位點 值 ( 表 2 ) 均大 于 ， 故 P0 ． 0 5 )2 ． 3 ． 2G 日 5基 因 單 倍 型 與 雞 生 長 、屠 體 性 狀 的 關(guān) 聯(lián) 性 C 一 1 8 9 6 A、 C 一 1 4 5 9 T 和 A 一 1 0 2 2 C在

25、 華 南 農(nóng) 業(yè) 大 學(xué) 杏 花 雞 x隱性 白洛克雞資源群 F代群體 中存在 6 種單倍型 ， 分別 為 H l ( A T A， 0 ． 1 0 7 9 ) 、 H 2 ( A C A， 0 ． 0 0 5 0 ) 、 H 3 ( C T A， 0 ． 6 4 8 9 ) 、 H 4( C C A， 0 ． 1 1 2 9 ) 、 H 5 ( A T C， 0 ． 1 0 5 5 ) 、 H 6 ( C T C ， 0 ． 0 1