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文檔簡介
1、目的:胰島素樣生長因子結(jié)合蛋白7(IGFBP7)是胰島素樣生長因子結(jié)合蛋白超家族(IGFBPs)中的一員。最初是因其在腦脊膜瘤中差異表達(dá)而被克隆出來。其在人體正常器官組織及多種腫瘤組織中均有表達(dá),并參與組織細(xì)胞的增殖、分化、衰老、凋亡等過程。本實驗通過病例-對照研究,討論IGFBP7上rs11133472和rs1718848兩個位點的基因多態(tài)性與結(jié)直腸癌(Colorectal Cancer CRC)發(fā)病之間的關(guān)系,以求為結(jié)直腸癌的篩查和
2、診斷提供新的標(biāo)志物,為預(yù)防、干預(yù)結(jié)直腸癌提供理論依據(jù)。
方法:本實驗共選取2012年2月-2014年2月,就診于河北醫(yī)科大學(xué)第四醫(yī)院病人,其中結(jié)腸癌病人68例,直腸癌病人143例,正常人群132例,本實驗采用病例-對照研究。對于符合本實驗條件的對象在其知情同意的情況下,采集靜脈血5ml,同時還收集患者年齡、性別、吸煙史、飲酒史等一般情況和家族性腫瘤疾病史等信息。采用蛋白酶K消化-飽和氯化鈉鹽析法提取白細(xì)胞中DNA,采用聚合酶鏈
3、反應(yīng)-連接酶檢測反應(yīng)(Polymerase Chain Reaction-ligase detection reaction, PCR-LDR)方法對IGFBP7基因的rs11133472、rs1718848兩個單核苷酸多態(tài)性(SNP)位點等位基因及基因型進(jìn)行分析。
實驗結(jié)果使用SPSS13.0版軟件包(SPSS Company,Chicago,Illinois,USA)進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析。對直腸癌組、結(jié)腸癌組和正常對照組年齡之間
4、差異進(jìn)行t檢驗;并分別對兩組的性別差異、等位基因分布頻率及基因型分布頻率進(jìn)行x2檢驗。并利用Hardy-Weinberg對三個組別基因型頻率的分布進(jìn)行連鎖平衡分析。使用logistic回歸方法計算相對風(fēng)險度的比值比(oddsratio,OR)取95%可信區(qū)間(confidence interval,CI)。采用EH軟件和2LD軟件對IGFBP7基因rs11133472A/G、rs1718848A/G兩個SNPs位點進(jìn)行聯(lián)合分析,以P<0
5、.05作為有顯著性差異的標(biāo)準(zhǔn)。
結(jié)果:
1對照組中rs11133472A/G、rs1718848A/G兩個位點的基因型頻率分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。
2 rs11133472A/G基因多態(tài)性與結(jié)直腸癌發(fā)病風(fēng)險的相關(guān)性分析
IGFBP7基因rs11133472A/G位點上等位基因A和G在直腸癌組中出現(xiàn)頻率為5.9%和94.1%;在結(jié)腸癌組中出現(xiàn)頻率為6.6%和93.
6、4%;在正常對照組中的頻率為2.3%和97.8%。直腸癌組及結(jié)腸癌組分別與正常對照組相比,差異均具有統(tǒng)計學(xué)意義(P分別為0.032和0.030)。在直腸癌組中GG、AG兩種基因型出現(xiàn)的頻率分別88.1%和11.9%;結(jié)腸癌組中GG、AG兩種基因型出現(xiàn)的頻率分別86.8%和13.2%;在正常對照組中分別為95.5%和4.5%。直腸癌組及結(jié)腸癌組分別與正常對照組相比,差異均具有統(tǒng)計學(xué)意義(P分別為0.028和0.027)。與攜帶GG基因型相
7、比,攜帶AG基因型可增加結(jié)直腸癌的發(fā)病風(fēng)險(OR=2.833,95%CI=1.082-7.421; OR=3.203,95%CI=1.090-9.417)。
3 rs1718848A/G基因多態(tài)性與結(jié)直腸癌發(fā)病風(fēng)險的相關(guān)性分析
IGFBP7基因rs1718848A/G位點上等位基因A和G在直腸癌組中出現(xiàn)頻率為11.9%和88.1%;在結(jié)腸癌組中出現(xiàn)頻率為12.5%和87.5%;在正常對照組中為6.4%和93.6%。直
8、腸癌組及結(jié)腸癌組分別與正常對照組相比較,差異均具有統(tǒng)計學(xué)意義(P分別為0.028和0.040)。在直腸癌中GG、AG兩種基因型出現(xiàn)的頻率分別為76.2%和23.8%;在結(jié)腸癌中分別為75.0%和25.0%;而在正常對照組中則為87.1%和12.9%。直腸癌組及結(jié)腸癌在分別與正常對照組對比較,差異均有統(tǒng)計學(xué)意義(P分別為0.020和0.031)。與攜帶GG基因型相比,攜帶AG基因型可增加結(jié)直腸癌的發(fā)病風(fēng)險(OR=2.110,95%CI=1
9、.114-3.995; OR=2.255,95%CI=1.066-4.768)。
4采用EH軟件和2LD軟件對IGFBP7基因rs11133472A/G和rs1718848A/GSNPs位點進(jìn)行聯(lián)合分析。
4.1在直腸癌組與正常對照組中IGFBP7基因rs1133472A/G與rs1718848A/G兩位點間存在連鎖不平衡。單體型rs11133472G-rs1718848G是最多見的,在正常對照組中和直腸癌組中的頻率
10、分別為84.8%,67.8%;rs11133472G-1718848A頻率分別為10.6%,20.3%; rs11133472A-rs1718848G頻率分別為2.3%,9.8%、rs11133472A-1718848A頻率為2.3%,2.1%。通過(Table5)可以看出,人群中rs11133472G-1718848A單體型、rs11133472A-1718848G單體型、rs11133472A-171884A單體型,均可增加直腸癌的
11、發(fā)病風(fēng)險。其OR值及95%可信區(qū)間分別為:1.365(1.109~3.449)、1.250(1.092~3.075)及1.946(1.306~4.914)。rs11133472G-1718848G單體型OR值及95%可信區(qū)間為:0.735(0.416~1.820)。提示此種單體型可能與結(jié)腸癌的發(fā)病風(fēng)險無關(guān)。
4.2對于結(jié)腸癌組與正常對照組中IGFBP7基因rs1133472A/G與rs1718848A/G兩位點間存在連鎖不平衡
12、,單體型rs11133472G-rs1718848G頻率最高,在正常對照組中和結(jié)腸癌組中的頻率分別為75.0%,64.7%;其次分別為rs11133472G-1718848A(19.3%,22.1%); rs11133472A-rs1718848G(3.8%,10.3%)、rs11133472A-1718848A(1.9%,2.9%)。人群中rs11133472G-1718848A單體型、rs11133472A-1718848G單體型、
13、rs11133472A-171884A單體型,均能夠增加直腸癌的發(fā)病風(fēng)險,其OR值及95%可信區(qū)間分別為:1.261(1.142-3.062)、1.132((1.061-2.854)及1.932(1.406~4.736)。而rs11133472G-1718848G單體型OR值及95%可信區(qū)間為:0.763(0.326-1.164)。提示此單體型可能與結(jié)腸癌的發(fā)病風(fēng)險無關(guān)。
結(jié)論:
1 IGFBP7 rs1113347
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