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1、腫瘤、代謝疾病、心腦血管疾病等絕大多數(shù)復(fù)雜性疾病的的流行和發(fā)展不僅給人類帶來(lái)了漫長(zhǎng)的痛苦和折磨,也給世界各國(guó)帶來(lái)了沉重的負(fù)擔(dān),廣泛且深入地研究復(fù)雜疾病的發(fā)病機(jī)理成為現(xiàn)下最迫切的醫(yī)學(xué)難題。然而復(fù)雜疾病的診斷與研究與傳統(tǒng)的單基因遺傳疾病不同,需要綜合考慮疾病發(fā)生的環(huán)境因素和遺傳因素,從而為其診斷、藥物設(shè)計(jì)、個(gè)性化治療以及預(yù)防提供堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)和突破性思路。
轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)對(duì)于揭示疾病相關(guān)基因及其分子機(jī)制有著重要的作用,發(fā)現(xiàn)了許多在癌癥
2、發(fā)生發(fā)展過(guò)程中起到重要作用的靶點(diǎn),為后續(xù)的基因表達(dá)調(diào)控、代謝通路和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)等研究提供了有意義的啟示。然而對(duì)如此龐大數(shù)據(jù)進(jìn)行信息挖掘并不容易,我們?cè)诂F(xiàn)有方法的基礎(chǔ)上創(chuàng)建了一套完整的分析流程,注重各基因表達(dá)之間的共同合作關(guān)系,很好地彌補(bǔ)了傳統(tǒng)方法篩選核心基因時(shí)的不足。對(duì)于每一個(gè)基因給予一個(gè)分值用以評(píng)判它在整個(gè)生物學(xué)過(guò)程的各個(gè)階段下和全過(guò)程中是否穩(wěn)定地與其他基因共表達(dá)調(diào)控,并以此參數(shù)篩選參與生物學(xué)功能的核心基因。在分析前列腺癌發(fā)生發(fā)展的分子機(jī)
3、制中,運(yùn)用這套分析流程篩選核心基因,隨機(jī)檢測(cè)證實(shí)全部與人類胚胎癌干細(xì)胞、增生性疾病、慢性炎癥和DNA損傷等腫瘤發(fā)生機(jī)制相關(guān),證實(shí)了該分析流程的有效和可靠,也為進(jìn)一步的深入研究提供了分析基礎(chǔ)和數(shù)據(jù)積累。在對(duì)三種人工多能干細(xì)胞全能性的機(jī)制研究中,針對(duì)全部miRNA表達(dá)情況,創(chuàng)新性地將miRNA靶基因和印記基因信息整合在一起,為細(xì)胞全能性研究提供思路。在抗糖尿病藥物的分子機(jī)制分析中,主要關(guān)注Rosi、Pio和Met抗糖尿病藥物在肝臟、心臟和脂
4、肪組織等五種不同組織細(xì)胞中的表達(dá)差異,并且結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子和蛋白質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)庫(kù),闡述了三種藥物之間存在的相同或不同的作用機(jī)制,以及不同脂肪組織在功能與起源分化上的差異,為深入研究糖尿病的發(fā)生和抗糖尿病藥物的研制提供思路。
雖然我們的工作還不能完全揭示這些復(fù)雜疾病相關(guān)的基因群關(guān)系,但對(duì)整個(gè)基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)圖而言是很好的補(bǔ)充和完善。進(jìn)一步的研究需要我們利用更多的數(shù)據(jù)和手段整合分析才能逐漸理清多基因通過(guò)蛋白質(zhì)復(fù)合物、調(diào)控網(wǎng)絡(luò)以及互作的
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