中國女性全基因組拷貝數(shù)變異與初潮年齡的關聯(lián)研究.pdf

1、初潮年齡(AAM)是由基因因素和環(huán)境因素共同影響的復雜性狀。初潮是指青春期女生的第一次月經，通常發(fā)生在11歲至16歲之間。初潮是女生青春期的一個重要標志。青春期的發(fā)育年齡對個體在今后的生活上有很大的影響，包括對自身的，對社會的，也有對心理文化上的。由于青春期發(fā)育年齡很難準確界定，通常使用AAM來對其年齡早晚進行指示。AAM是許多病癥的風險因子，例如憂郁癥，精神障礙，骨質疏松癥以及乳腺癌。當今有一些全基因組關聯(lián)分析鑒定出一些與Adam有關

2、聯(lián)的基因和單核苷酸多態(tài)性(SNPs)。然而，這些方法得到的潛在基因還只是滄海一粟，這促使我們進一步尋找那些仍未被發(fā)現(xiàn)的，但對AAM有貢獻率的遺傳變異。隨著現(xiàn)在拷貝數(shù)變異關聯(lián)研究已經成為鑒定遺傳基因位點的熱潮，并且還沒有關于初潮年齡表型與全基因組拷貝數(shù)變異的關聯(lián)研究，因此這篇文章的主要目的是填補國內外這一學術空白。
　　 拷貝數(shù)變異(CNV)是基因變異的一種類型，片段大小從1kb至數(shù)Mb不等。而拷貝數(shù)多態(tài)性(CNP)是指頻率大于1

3、％的CNV。CNV已經被證明是與某些人類復雜疾病相關聯(lián)的。CNV在基因表達的總變異中比例占到20％。在正常健康的個體中，CNV在基因組中的廣泛分布意味著CNV可能是表型多樣性的一種驅動力。最近，我們實驗室進行了骨質疏松癥的全基因組拷貝數(shù)關聯(lián)研究，并且鑒定出兩個新的候選基因，UGT2817和VPS13B。然而，至今還沒有關于CNVs和AAM之間的關聯(lián)研究，拷貝數(shù)變異對AAM所起的作用還不清楚。此研究中，我們在825個中國漢族女性人群中做了

4、關于AAM的全基因組拷貝數(shù)變異的關聯(lián)研究。研究采用Affymetrix GeneChip Human Mapping SNP6．0的芯片，并隨后在1728個美國白種人中對顯著的結果進行了重復驗證。我們發(fā)現(xiàn)位于染色體4q21．1的CNP10744在中國和美國人群中都達到顯著水平，p值分別為0．017和0．010。在CNP10744區(qū)域有三個相關聯(lián)的基因，淋巴細胞趨化因子(CXCL13)，細胞周期蛋白G2(CCNG2)，細胞周期蛋白I(CC