脂肪細(xì)胞因子信號通路中基因本體論功能模塊與中國南方人群冠心病的關(guān)聯(lián)性分析.pdf

1、[目的]：
　　識別在脂肪因子信號通路中與冠心病顯著相關(guān)的基因本體論(GO)功能模塊，進一步探索冠心病易感性的分子機制。本項研究可為尋找冠心病新藥物作用靶點以及早期診斷模塊化標(biāo)記提供理論依據(jù)。
　　[方法]：
　　應(yīng)用SNPscanTM多重SNP分型試劑盒，在682例中國南方漢族冠心病患者和721例健康對照樣本中對脂肪因子信號通路基因進行SNP分型;通過富集分析確定與該通路相關(guān)的GO功能模塊;采用基于加權(quán)線性kerne

2、l函數(shù)和加權(quán)狀態(tài)一致性kernel函數(shù)的logistic核機器回歸模型，評估該通路GO功能模塊遺傳變異與冠心病的關(guān)聯(lián)性;采用logistic逐步回歸模型，對顯著的GO功能模塊進行風(fēng)險預(yù)測，評價其模型預(yù)測的準(zhǔn)確性。
　　[結(jié)果]：
　　1.基線資料分析:
　　經(jīng)比較發(fā)現(xiàn)，兩組人群除性別外，其他協(xié)變量（家族史、吸煙史、高血壓、糖尿病、年齡、膽固醇、甘油三酯、BMI）在兩組間的差異均有統(tǒng)計學(xué)意義(P＜0.05)。冠心病組中吸

3、煙、高血壓及糖尿病的比例均高于健康對照組，同時病例組平均年齡高于對照組。
　　2.候選GO功能模塊:
　　脂肪因子信號通路中基因GO富集分析最終共獲得31個與疾病相關(guān)的功能模塊（生物學(xué)過程、細(xì)胞組分或分子功能）。生物學(xué)過程包括:內(nèi)源性激素分泌，脂肪代謝，糖代謝、生物大分子合成的調(diào)節(jié)等。分子功能包括:絲氨酸與蘇氨酸激酶活性和損傷應(yīng)激等。細(xì)胞組分包括:細(xì)胞膜碎片和細(xì)胞質(zhì)等。
　　3.GO功能模塊遺傳變異與冠心病的關(guān)聯(lián)性

4、r>　　經(jīng)加權(quán)線性kernel函數(shù)和加權(quán)狀態(tài)一致性kernel函數(shù)的logistic核機器回歸分析（家族史、吸煙史、高血壓、糖尿病、年齡、膽固醇、甘油三酯、BMI協(xié)變量校正后），發(fā)現(xiàn)有10個GO功能模塊與冠心病顯著相關(guān)(P＜0.05)，包括蛋白絲氨酸/蘇氨酸激酶反應(yīng)、蛋白激酶酶聯(lián)反應(yīng)等分子功能，蛋白磷酸化、大分子物質(zhì)功能正反饋調(diào)節(jié)、維持內(nèi)環(huán)境穩(wěn)定等生物學(xué)過程以及細(xì)胞膜和細(xì)胞質(zhì)細(xì)胞組件。這些顯著的功能模塊可能是冠心病發(fā)病的風(fēng)險模塊，可能參

5、與了冠心病發(fā)生發(fā)展過程中分子機制的調(diào)節(jié)。
　　4.顯著功能模塊風(fēng)險預(yù)測
　　采用logistic逐步回歸模型，利用模塊內(nèi)基因多態(tài)性進行多重logistic預(yù)測模型擬合，來預(yù)測個體的患病風(fēng)險。10個顯著的功能模塊內(nèi)變異的預(yù)測模型與原假設(shè)模型的AUC相比較，具有統(tǒng)計學(xué)差異(p＜0.05)?；诠δ苣K內(nèi)的變異對個體患病風(fēng)險的預(yù)測具有一定價值。
　　[結(jié)論]：
　　本研究揭示在脂肪細(xì)胞因子信號通路中多個功能模塊遺傳學(xué)或