基于Powerplex 21檢測(cè)系統(tǒng)對(duì)福建漢族群體遺傳多態(tài)性分析及無(wú)關(guān)個(gè)體基因型比對(duì)的研究.pdf

1、目的：研究Powerplex21熒光復(fù)合擴(kuò)增體系（PP21檢測(cè)系統(tǒng)）的20個(gè)常染色體STR基因座在福建地區(qū)漢族群體的遺傳多態(tài)性，評(píng)估其法醫(yī)學(xué)應(yīng)用價(jià)值；建立常染色體STR數(shù)據(jù)庫(kù)，并對(duì)該數(shù)據(jù)庫(kù)中兩個(gè)無(wú)關(guān)個(gè)體基因型進(jìn)行比對(duì)分析，了解在具有15個(gè)STR基因座和20個(gè)STR基因座的檢測(cè)系統(tǒng)中兩個(gè)無(wú)關(guān)個(gè)體的STR基因座均符合孟德?tīng)栠z傳定律的概率，為法醫(yī)物證二聯(lián)體親權(quán)鑒定的規(guī)范化和保證親權(quán)鑒定結(jié)果的準(zhǔn)確性和科學(xué)性提供思路與依據(jù)。
　　方法:（1

2、）隨機(jī)選取福建漢族無(wú)關(guān)個(gè)體850名為研究對(duì)象，采用Powerplex21熒光復(fù)合擴(kuò)增體系，以PCR復(fù)合擴(kuò)增和毛細(xì)管電泳技術(shù)對(duì)D1S1656等20個(gè)常染色體STR基因座進(jìn)行基因分型。應(yīng)用Modified-powerstates軟件進(jìn)行Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn),計(jì)算各STR基因座等位基因頻率、雜合度（H)，個(gè)人識(shí)別力（DP)、多態(tài)性信息含量（PIC）、非父排除率（PE）、匹配概率（PM)等法醫(yī)學(xué)參數(shù)。
　?。?）基于DNA

3、盲比技術(shù)的親權(quán)鑒定家系檢索比對(duì)軟件，將13576個(gè)日常檢案的無(wú)關(guān)個(gè)體檢材信息和常染色體 STR基因座分型結(jié)果錄入該軟件，建立包含Identifiler（ID）、Sinofiler(SINO)、Powerplex16(PP16)、PP21檢測(cè)系統(tǒng)的常染色體STR數(shù)據(jù)庫(kù)。
　?。?）從上述數(shù)據(jù)庫(kù)中隨機(jī)選取721位基于PP21檢測(cè)系統(tǒng)進(jìn)行常染色體STR基因座分型的個(gè)體，運(yùn)用DNA盲比技術(shù)的親權(quán)鑒定家系檢索比對(duì)軟件，以自動(dòng)比對(duì)方式進(jìn)行無(wú)關(guān)

4、個(gè)體基因型比對(duì)。統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)庫(kù)中分別與721位個(gè)體在15個(gè)和20個(gè)STR基因座均符合孟德?tīng)栠z傳定律的無(wú)關(guān)個(gè)體的比中概率。計(jì)算其中78例假定二聯(lián)體的累計(jì)父權(quán)指數(shù)(combinedpaternity index,CPI)值與累計(jì)父權(quán)相對(duì)機(jī)會(huì)(relative chance of paternity,RCP)值。
　?。?）對(duì)15個(gè)STR基因座均符合孟德?tīng)栠z傳定律的假定二聯(lián)體增加檢測(cè)PP21檢測(cè)系統(tǒng)；仍不能排除的二聯(lián)體及在PP21檢測(cè)系統(tǒng)的

5、20個(gè)STR基因座均符合孟德?tīng)栠z傳定律的假定二聯(lián)體，進(jìn)一步增加檢測(cè)Investigator HD plex和Investigator Argus X-12檢測(cè)系統(tǒng)。
　　結(jié)果:（1）PP21檢測(cè)系統(tǒng)的20個(gè)常染色體STR基因座在福建漢族群體中發(fā)現(xiàn)257種等位基因，分布均符合Hardy-Weinberg平衡(p>O.05),等位基因頻率介于0.0006～0.5671。等位基因平均雜合度為0.797，多態(tài)性信息含（PIC）均大于0.5

6、，屬于高度多態(tài)性信息含量。除CSF1PO（0.893）、TPOX（0.772）、TH01（0.828）、D3S1358（0.873）外的個(gè)體識(shí)別能力均大于0.9，雜合度（H）除TPOX（0.594）、TH01（0.662）外均大于0.7。
　?。?）PP21檢測(cè)系統(tǒng)在福建漢族群體中共發(fā)現(xiàn)24個(gè)稀有等位基因（off-ladder，OL），出現(xiàn)次數(shù)為1～13次，出現(xiàn)頻率0.0006～0.0076，其中13個(gè)OL基因?yàn)閲?guó)內(nèi)首次報(bào)道。

7、r>　　（3）構(gòu)建了具有13576條無(wú)關(guān)個(gè)體的常染色體STR基因座分型結(jié)果的常染色體STR數(shù)據(jù)庫(kù)。在隨機(jī)選取的721位個(gè)體中，有387位比中與之具有15個(gè)基因座均符合孟德?tīng)栠z傳定律的無(wú)關(guān)個(gè)體，其中4位比中與之具有20個(gè)STR基因座均符合孟德?tīng)栠z傳定律的無(wú)關(guān)個(gè)體，比中概率分別為2.85％和0.57%。
　?。?）在上述比中的STR基因座分型結(jié)果中，隨機(jī)選取78例無(wú)關(guān)假定二聯(lián)體，計(jì)算CPI與RCP數(shù)值，CPI值最低為7.67(RCP>

8、88.46%),最高258602.95(RCP>99.99%),仍有10例假定二聯(lián)體無(wú)法排除親緣關(guān)系。對(duì)其進(jìn)一步分別以PP21、Investigator HD plex和Investigator Argus X-12檢測(cè)系統(tǒng)追加檢測(cè)STR基因座后，每例均有3～15個(gè)STR基因座不符合孟德?tīng)栠z傳定律，均排除了親緣關(guān)系。
　　結(jié)論:（1）PP21檢測(cè)系統(tǒng)的20個(gè)常染色體STR基因座在福建漢族人群中基因分布符合Hardy-Weinber

9、g平衡，提供的多態(tài)信息量大，具有較高的非父排除率和個(gè)體識(shí)別能力，具有較高法醫(yī)學(xué)應(yīng)用價(jià)值。
　?。?）建立常染色體STR數(shù)據(jù)庫(kù)，最好采用含有20個(gè)STR基因座檢測(cè)系統(tǒng)，不排除在檢測(cè)系統(tǒng)里加進(jìn)少數(shù)幾個(gè)中國(guó)人群識(shí)別能力強(qiáng)的性染色體STR基因座。
　?。?）在常染色體STR數(shù)據(jù)庫(kù)中，兩個(gè)無(wú)關(guān)個(gè)體之間15個(gè)STR基因座均符合孟德?tīng)栠z傳定律的概率較高，單純以遺傳學(xué)證據(jù)CPI和RCP數(shù)值進(jìn)行判定，容易出現(xiàn)誤判。因此進(jìn)行親權(quán)鑒定至少應(yīng)采用2