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文檔簡介
1、以大黃魚(Larimichthys crocea)性腺為材料,采用SMART(switching mechanism at 5’end of RNA transcript)技術(shù)和DSN(duplex-specific nuclease)處理構(gòu)建了大黃魚性腺線性化Cdna文庫,并從文庫中隨機挑取了3961個克隆進行測序,共獲得3535條高質(zhì)量的表達序列標(biāo)簽(Expressed Sequence Tag,EST)。序列經(jīng)聚類分析后共得到29
2、16條Unigene,包括415條contigs和2501條singletons。初步分析結(jié)果表明:該線性化文庫的庫容為4.3×106pfu/Ml,文庫重組率達95.8%,EST的非冗余率為82.49%,Unigene的平均長度為355 bp。經(jīng)生物信息學(xué)分析,1785個為已知基因占總ESTs的61.21%;其中與性腺發(fā)育相關(guān)的基因66個,占已知基因的3.70%。微衛(wèi)星分析發(fā)現(xiàn)共有129條EST序列含有149個微衛(wèi)星重復(fù)序列,包括6條與
3、性腺發(fā)育相關(guān)的ESTs。利用實時熒光定量PCR(Qrt-PCR)技術(shù)分析了11個與性腺發(fā)育相關(guān)基因在大黃魚性腺的表達情況。結(jié)果顯示精巢特異性LRR基因(testis-specific LRR)只在大黃魚精巢中表達(P<0.05);雄性特異性致死3樣1基因(MSL3L1),雄激素相互作用受體核蛋白激酶基因(ARINPK),精子發(fā)生凋亡相關(guān)蛋白基因(SARP),熱休克蛋白70(HSP70)和細胞周期蛋白A1基因(cyclin A1)在精巢中
4、的表達量高于卵巢(P<0.05);相反,組織蛋白酶C基因(Cathepsin C),核自身抗原精蛋白基因(NASP)和細胞周期蛋白B1(cyclin B1)在卵巢中的表達量高于精巢(P<0.05);促分裂原激活蛋白激酶1(MAPK1)和泛素C末端水解酶L5(UCH-L5)在精巢和卵巢中表達沒有顯著差異(P>0.05)。
在上述結(jié)果的基礎(chǔ)上,利用SMART-RACE技術(shù)或RT-PCR技術(shù)克隆了大黃魚性腺發(fā)育相關(guān)基因cyp19
5、a、cyp19b、cyclin B1、CDC2、UBE2D和UBC9全長Cdna序列,其長度分別為1805 bp、2268 bp、1882 bp、1151 bp、798 bp和846 bp,可分別編碼518、500、397、303、147和148個氨基酸的前體蛋白。利用Qrt-PCR技術(shù)分析這些基因在大黃魚各器官的表達情況,結(jié)果顯示:cyp19a在卵巢中的表達量顯著高于精巢(P<0.01),且cyp19a在精巢和卵巢中的表達均極顯著高于
6、其它各器官(P<0.01);cyp19b在端腦、中腦、下丘腦、脾和肝有較高表達量,在雄性大黃魚的血中表達量最高。在性腺表達量極低。Cyclin B1和CDC2基因在性腺中的表達量極顯著高于其它各器官(P<0.01),且在卵巢中的表達量較精巢高(P<0.05)。UBE2D在脾臟和性腺中表達量較高,其它器官表達量較低,在性腺中的表達極顯著高于其它各器官(除脾臟外)(P<0.01)。UBC9在性腺中表達量較高,且極顯著高于其它各器官(P<0.
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