大黃魚TLR5與NF-κB家族部分基因的克隆與功能研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、本研究在實(shí)驗(yàn)室前期獲得大黃魚(Larimichthys crocea)兩種類型TLR5(LcTLR5M,LcTLR5S)cDNA序列的基礎(chǔ)上,分別克隆了它們的啟動子序列,通過片段缺失,定點(diǎn)突變等技術(shù),篩選并驗(yàn)證了其啟動子結(jié)構(gòu)及轉(zhuǎn)錄結(jié)合位點(diǎn);構(gòu)建了LcTLR5M和LcTLR5S的亞細(xì)胞定位質(zhì)粒,研究了其在細(xì)胞內(nèi)的表達(dá)特征;構(gòu)建了它們的過表達(dá)質(zhì)粒,將其分別以及共同與NF-κB家族p65基因啟動子共轉(zhuǎn)染細(xì)胞系,檢測了LcTLR5M和LcTLR

2、5S過表達(dá)對NF-κB-p65啟動活性的影響??寺×舜簏S魚NF-κB家族RelB基因的全長cDNA序列,分析了它的分子結(jié)構(gòu)及組織表達(dá)譜,檢測了病原相關(guān)分子模式(PAMP)刺激后,其在細(xì)胞系內(nèi)的時(shí)空表達(dá)特征;研究了RelB亞細(xì)胞定位并分析了其過表達(dá)后對TNF-α等部分細(xì)胞因子的影響及IκB家族IκB-α對其調(diào)控機(jī)制。擴(kuò)增了NF-κB家族成員p65基因的啟動子序列,檢測了其活性,以及病原刺激后對其啟動活性的影響;研究了p65基因亞細(xì)胞定位及

3、分析了其過表達(dá)對下游細(xì)胞因子IL-1β、TNF-α和IFN-I基因的啟動子活性的影響,及IκB-α對其調(diào)控機(jī)制。結(jié)果如下:
  (1)大黃魚TLR5M啟動子區(qū)域在-1829bp至+189bp之間,無CpG島區(qū)域,轉(zhuǎn)錄結(jié)合位點(diǎn)含有CEBP、Oct-1、GA TA-1、AP1等元件,系列片段缺失分析基本啟動子活性所需的順式作用元件可能位于-417至+189之間,負(fù)調(diào)控元件可能位于-799至-417之間。大黃魚TLR5S啟動子區(qū)域在-1

4、932bp至+106bp之間,無CpG島區(qū)域,轉(zhuǎn)錄結(jié)合位點(diǎn)含有CEBP、SP1、Oct-1、AP1、NF-B等元件,片段缺失表明TLR5S基因順式作用元件可能位于-808至+106之間,Oct-1和NF-κB結(jié)合位點(diǎn)對TLR5S啟動子活性有正調(diào)控作用且大黃魚NF-κB家族亞基p65過表達(dá)可顯著上調(diào)TLR5S啟動子活性,表明預(yù)測正確。亞細(xì)胞定位分析表明,大黃魚TLR5M蛋白主要定位在細(xì)胞膜上,而TLR5S蛋白主要定位在細(xì)胞漿中。TLR5M

5、過表達(dá)對NF-κB-p65啟動子的活性無顯著影響,而TLR5S過表達(dá)可以顯著上調(diào)NF-κB-p65啟動活性。
  (2)大黃魚RelB(LcRelB)基因全長為1946bp,ORF為1788bp,編碼595個(gè)氨基酸,包含RHD-DNA-bind結(jié)構(gòu)域和IPT結(jié)構(gòu)域,等電點(diǎn)pI=5.6,分子量為66.5KDa。進(jìn)化分析表明,大黃魚RelB基因與紅鰭東方純親緣關(guān)系最近;LcRelB廣泛分布于多種組織,其中在血細(xì)胞中含量最高,其次是脾臟

6、和頭腎,皮膚中含量最低;LPS和poly I∶C刺激后,大黃魚LCK細(xì)胞系中LcRelB上調(diào)表達(dá)顯著,而PGN免疫刺激后表達(dá)下調(diào)(p<0.05)。LcRelB蛋白定位于細(xì)胞核中。LcRelB過表達(dá)后,其下游細(xì)胞因子IL-1β啟動子活性顯著下調(diào),而TNF-α和IFN-I啟動子活性顯著上調(diào)(p<0.05),而當(dāng)NF-κB家族抑制因子LcIκB-α與其共轉(zhuǎn)染后,可以顯著抑制TNF-α啟動子活性(p<0.01)。
  (3) Lcp65啟

7、動子區(qū)域?yàn)?1695bp至+111bp,預(yù)測其轉(zhuǎn)錄結(jié)合位點(diǎn)含有USF、AP1、SRF、IRF-1、NF-κB等元件,含有CpG島以及(GT)n重復(fù)區(qū)域;LPS,PGN,F(xiàn)lagellin刺激后均能夠顯著誘導(dǎo)p65啟動活性上調(diào),其中Flagellin誘導(dǎo)能力最為顯著(p<0.01);亞細(xì)胞定位表明,Lcp65蛋白主要定位于細(xì)胞核中;Lcp65過表達(dá)后能顯著上調(diào)其下游細(xì)胞因子IL-1β、TNF-α和IFN-I啟動子的活性,其中,TNF-α的

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