中國(guó)狂犬病毒P和M基因分子生物學(xué)特征研究.pdf

1、本研究從國(guó)內(nèi)外研究較少的狂犬病毒P、M基因出發(fā)，針對(duì)中國(guó)廣西、貴州、湖南、江蘇、安徽和云南六省區(qū)狂犬病人、犬陽性腦組織標(biāo)本通過RT-PCR方法擴(kuò)增目的基因來測(cè)定P、M基因編碼區(qū)全序，利用來源于GenBank中不同國(guó)家地區(qū)代表不同基因型的狂犬病毒株P(guān)、M基因序列信息在分子水平進(jìn)行P、M基因序列同源性分析、主要功能位點(diǎn)比較和種系發(fā)生分析，探討中國(guó)狂犬病毒P、M基因分子生物學(xué)特征，為進(jìn)一步研究狂犬病毒的分子結(jié)構(gòu)提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。 中國(guó)狂犬

2、病毒P基因核苷酸與氨基酸序列同源性分別為81.8～100％和82.9～99.7％；M基因核苷酸與氨基酸序列同源性分別為88.7～100％和95.0～100％。PP與胞漿動(dòng)力蛋白輕鏈(LC8)作用位點(diǎn)、PP與LP主要作用區(qū)域前19位氨基酸都高度保守，特定的蛋白激酶磷酸化絲氨酸位點(diǎn)、PP與NP相互作用主要區(qū)域第209～216位氨基酸僅個(gè)別位點(diǎn)發(fā)生變化，中部高變區(qū)第50～75位氨基酸位于核酸外導(dǎo)信號(hào)結(jié)構(gòu)域內(nèi):MP調(diào)節(jié)病毒RNA轉(zhuǎn)錄和復(fù)制功能的

3、第58位氨基酸、在病毒晚期芽生過程中起調(diào)節(jié)作用的PPxY結(jié)構(gòu)域均高度保守，高變區(qū)第17～22位氨基酸位于N末端潛在的抗原決定簇內(nèi)。P、M基因核苷酸水平的變異區(qū)存在于氨基酸水平同樣的位置，核苷酸序列的變異多為同義突變。P、M基因系統(tǒng)進(jìn)化分析顯示所有中國(guó)標(biāo)本P、M基因序列與其它基因1型序列形成獨(dú)立的進(jìn)化分支，具有中國(guó)地域特點(diǎn):來源于同一省區(qū)的標(biāo)本構(gòu)成同一亞分支，趨向于同一進(jìn)化群。 對(duì)P、M基因的研究結(jié)果表明中國(guó)狂犬病毒均屬于基因1型

4、，序列同源性都比較高，具有共同的進(jìn)化途徑和基因結(jié)構(gòu)特點(diǎn)，序列間差異規(guī)律明顯，病毒分布具有獨(dú)特的中國(guó)地域性特征，但序列的差異并不完全與病毒分離的行政地理區(qū)域相關(guān)，未嚴(yán)格按照行政地理分群。六省區(qū)狂犬病毒不但在同一省區(qū)內(nèi)循環(huán)傳播，而且在各個(gè)省區(qū)相鄰地域之間相互傳播，中國(guó)與東南亞國(guó)家的狂犬病毒株P(guān)、M基因具有較近的親緣關(guān)系，中國(guó)云南省個(gè)別毒株可能和泰國(guó)毒株來源于共同的狂犬病毒。六省區(qū)所有狂犬病毒街毒株都來源于人和犬，人、犬分離株P(guān)、M基因全序列