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文檔簡介
1、目的:研究α-1,3巖藻糖基轉(zhuǎn)移酶(α-1,3fucosyltransferase,F(xiàn)UT6)對TGF-β1誘導(dǎo)的人腎皮質(zhì)近曲腎小管上皮細(xì)胞(Human kidney-2,HK-2)在上皮-間充質(zhì)轉(zhuǎn)化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)過程中的作用,探討2型糖尿病腎病(Diabetic Nephropathy,DN)患者早期TGF-β/Smad信號通路激活的可能分子機(jī)制,為尋找與DN相關(guān)的致病基
2、因、了解DN的遺傳背景提供依據(jù)。
方法:(1)選取早期出現(xiàn)TGF-β/Smad信號通路高表達(dá)的2型糖尿病腎病患者作為研究對象,提取患者外周血全基因組 DNA,純化后華大基因 Illumina HiSeq2000高通量測序平臺測序。(2)分析處理外顯子測序信息,對所得變異進(jìn)行注釋,并與公共數(shù)據(jù)庫YH、dbSNP129、8HapMapexome和thousands genome進(jìn)行比對過濾,篩除已報(bào)道的基因多態(tài)性位點(diǎn)。對發(fā)生無義突
3、變基因的功能及在腎臟的表達(dá)情況進(jìn)行生物信息學(xué)分析。(3)根據(jù)患病基因的突變頻數(shù)、檢測SNP位點(diǎn)的質(zhì)量值、是否在腎臟表達(dá)及基因功能分析,選取FUT6作為研究對象。對該 DN患者的活檢腎組織進(jìn)行 SP(過氧化物酶標(biāo)記的鏈霉卵白素)法免疫組織化學(xué)染色,了解目的基因 FUT6的表達(dá)情況。(4)用熒光標(biāo)記的siRNA(Cy3-siRNA)瞬時(shí)轉(zhuǎn)染 HK-2細(xì)胞,倒置顯微鏡檢測轉(zhuǎn)染效率,Western blot檢測FUT6基因的沉默效率。(5)為研
4、究FUT6-siRNA干擾對EMT的影響,實(shí)驗(yàn)分為以下幾組:①正常對照組(NC組),常規(guī)培養(yǎng)細(xì)胞;②TGF-β1刺激組(TGF組),TGF-β110ng/ml刺激細(xì)胞48小時(shí);③FUT6-siRNA干擾組(RNAi組),使用 FUT6-siRNA50nM瞬時(shí)轉(zhuǎn)染細(xì)胞,沉默 HK-2細(xì)胞 FUT6的表達(dá);④FUT6-siRNA干擾+TGF-β1刺激組(iTGF組),使用FUT6-siRNA50nM瞬時(shí)轉(zhuǎn)染細(xì)胞沉默F(xiàn)UT6基因表達(dá),隨后加入
5、TGF-β110ng/ml刺激細(xì)胞48小時(shí)。相差顯微鏡觀察細(xì)胞形態(tài)學(xué)變化;Western blot檢測FUT6蛋白的表達(dá)情況,及各組TGF-β/Smad信號系統(tǒng)(TGF-βRⅠ、TGF-βRⅡ、Smad2/3和p-Smad2/3)的表達(dá);Western blot檢測EMT相關(guān)指標(biāo)(E-cadherin、N-cadherin、Snail和Vemintin)的表達(dá);另外用免疫沉淀(Immunoprecipitation,IP)結(jié)合凝集素印跡
6、(Lectin blotting analysis,IB)特異性檢測結(jié)合在TGF-βRⅠ和TGF-βRⅡ上的巖藻糖鏈的表達(dá)。(6)TGF-β1刺激不同時(shí)間的研究:TGF-β110ng/ml分別刺激細(xì)胞1d、2d和3d,分別標(biāo)記TGF D1組、D2組和D3組。相差顯微鏡觀察細(xì)胞形態(tài)變化;Western blot檢測各組細(xì)胞 FUT6、TGF-βRⅠ和TGF-βRⅡ的表達(dá)量的變化;IP結(jié)合IB特異性檢測結(jié)合在TGF-βRⅠ和TGF-βRⅡ上
7、的巖藻糖鏈的表達(dá)。
結(jié)果:(1)外顯子組測序發(fā)現(xiàn)單核苷酸變異總共38914個(gè)。通過與公共數(shù)據(jù)數(shù)據(jù)的比對過濾,共發(fā)現(xiàn)509個(gè)突變位點(diǎn),其中包括497個(gè)錯(cuò)義突變和12個(gè)無義突變。發(fā)生無義突變且在腎臟高表達(dá)的基因有ANKRD35、ACSM2A、FUT6和HAAO。其中 FUT6基因的315TAC>TAA,氨基酸殘基由酪氨酸突變?yōu)榻K止密碼子,免疫組化證實(shí)FUT6在該患者的腎活檢組織中表達(dá)量減少。(2)熒光顯微鏡和Western blo
8、t檢測結(jié)果顯示FUT6-siRNA在50nM和100nM濃度時(shí)均可成功干擾HK-2細(xì)胞FUT6表達(dá),沉默效率約為50%。(3)相差顯微鏡觀察NC組細(xì)胞呈正常上皮細(xì)胞鋪路石樣形態(tài);TGF組細(xì)胞肥大、拉長,呈梭形改變;RNAi組與NC組細(xì)胞相比,形態(tài)幾乎未發(fā)生變化;iTGF組細(xì)胞形態(tài)部分發(fā)生梭形改變,但與 TGF組細(xì)胞相比 TGF-β1誘導(dǎo)的細(xì)胞形態(tài)的梭形改變較不明顯。(4) Western blot結(jié)果顯示,與NC組相比RNAi組FUT6
9、的表達(dá)減少,而TGF組和iTGF組FUT6的表達(dá)量增加,說明TGF-β1刺激下FUT6的表達(dá)量增加,而siRNA干擾并不能抑制TGF-β1刺激引起的FUT6表達(dá)量的增加。TGF組、RNAi組和iTGF組p-Smad2/3的表達(dá)與NC組相比明顯增加;RNAi組和iTGF組Smad2/3的表達(dá)增高,而TGF組表達(dá)幾乎不發(fā)生變化。TGF組Snail、N-cadherin和Vimentin的表達(dá)與NC組相比升高,E-cadherin表達(dá)下調(diào),提
10、示HK-2細(xì)胞發(fā)生成纖維化轉(zhuǎn)變;RNAi組Snail、 E-cadherin、N-cadherin和Vimentin的表達(dá)幾乎未發(fā)生改變;iTGF組與TGF組相比,E-cadherin的表達(dá)未發(fā)生改變,而Snail、Vimentin和N-cadherin表達(dá)明顯減少,說明用 FUT6-siRNA干擾其表達(dá)后,能一定程度抑制 TGF-β1誘導(dǎo)的EMT。(5)IP結(jié)合凝集素印跡實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示特異性結(jié)合在TGF-βRⅠ的巖藻糖基鏈的表達(dá),TGF
11、組與 NC組相比基本保持不變,而 RNAi組和iTGF組與 TGF組相比表達(dá)明顯下調(diào);其變化趨勢與特異性結(jié)合在TGF-βRⅡ上的巖藻糖鏈的變化相同。(6)TGF-β1處理不同時(shí)間相差顯微鏡觀察,隨著刺激時(shí)間的延長細(xì)胞形態(tài)發(fā)生梭形改變的趨勢越明顯;FUT6的表達(dá)先增加后減少,其變化趨勢同TGF-βRⅠ和TGF-βRⅡ;IP結(jié)合IB實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示TGF-β1處理不同時(shí)間,特異性結(jié)合在 TGF-βRⅠ和TGF-βRⅡ上的巖藻糖鏈的表達(dá)并未發(fā)生改
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