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文檔簡介
1、安徽農(nóng)業(yè)大學碩士學位論文利用單酶切cDNAAFLP技術分離玉米對生性狀相關基因差異表達片段姓名:李蕾娜申請學位級別:碩士專業(yè):生物物理學指導教師:程備久朱蘇文20050601AbstractMaizewithoppositecharacterisbothagoodgermplasmresomceforhighyieldbreeding,andapreciousvariationforplantdevelopmentresearchIno
2、rdertostudythemolecularandregulationmechanismdeeply,inthisstudy,basedonconstructingsuitableNILs(nearisogeneticline)oftotalRNApoolsofoppositemaizeandmutualmaize,singleendonucleasedigestioncDNA—AFLPtechnologywasappliedtosc
3、reen,isolationandbioinformaticsanalyzethegenedifferentiallyexpressedfragmentsrelatedtotheoppositecharacterofmaizeTheresultswereasfollow1nlequalityandintegralityoftotalRNAextractedWithTrizolmethodweregoodandweresuitableto
4、constructthetotalRNApoolsofoppositemaizeandmutualmaizeequivalently2ThelengthofDouble—strandcDNAretransferedbySMARTTMPCRcDNASynthesisKitfromeachpoolwas100~1000bpItsintegralitywasfine3Thelengthofdigestedfragmentbyaendonucl
5、ease—Sau3AI,whichcanrecognizea4bpsequece,wasl00~1000bpItcouldaccordwiththeAFLPtechnology4,Theligationproductwaspre—amplifiedtogetnumbersofcopies,aftertheendonucleasedigestionfragmentwaslinkedtotheartificialadapter5Dilute
6、dpre—amplifiedproductwassystematicallyselective—amplifiedAimprovedPCRmethodTOUCHDOWNPCRprogramwasadoptedtogetpeculiarandhighdensitycopies6Combined、Ⅳithnreadenatured6%PAGEandsilverstain29differentiallyexpressedfragmentsha
7、dbeenobtained:23fragmentsenhancedexpressed,6fragmentsrestrainedexpressedinoppositemaize75enhancedexpressedfragmentsofoppositemaizewereclonedandsequenced,includingS”m、Snqc、STT《、S”《、So_‰Thehomologyanalysisshowedthatthese5f
8、ragmentshadveryhighhomologies、ⅣitllthemaizemRNAthathadebeenseparatedS丌GChad80%homologywithcytochromeb5geneofNtabacumScf1【,hadover90%homologywith5tublingeneofZmays,Eleusineindica,Hordeumvulgare,OryzasativaandSetariaviridi
9、sThisstudyfirstappliedthesingleendonucleasedigestioncDNA—AFLPtoanalyzethedifferentiallyexpressedgenesinmaize,andmadeaseriesofimprovementtothetechnologytofmdsomedifferentiallyexpressedfragmentsrelatedtooppositecharacterin
10、maizeFurtherresearchcarlbedonewiththeobtainedsequencestomakeprobesormolecularmarkerstolocate,clonetheoppositegene,andevenstudythegeneexpressioncharactersKeywords:Maizeoppositecharacterdifferentialexpressionsingleendonucl
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