不同棉花品種伸長期纖維基因表達差異的cDNA-AFLP分析.pdf

1、前人已經(jīng)獲得上萬條棉纖維發(fā)育相關的基因或基因表達序列標簽，并對少數(shù)進行了功能研究，沒有找到能解釋不同基因型間纖維品質差異的主基因，為了利用遺傳工程等手段對棉纖維強度品質進行改良，有必要繼續(xù)篩選這樣的主基因。另外，已有的棉纖維發(fā)育相關基因數(shù)據(jù)庫中的基因仍然存在遺傳基礎較窄，纖維發(fā)育時期覆蓋面不全的問題，有必要對這些數(shù)據(jù)庫進行補充。本文的實驗材料包括五個纖維高強的品種 (2001、7235、貝爾斯諾、Acala1517-77、PD5246)

2、、一個對照品種中棉所36及對照品種與五個高強材料的雜交一代，利用cDNA-AFLP技術分析這11個品種伸長期纖維基因表達的差異，建立了一套適合纖維發(fā)育各個時期的基因表達差異的研究體系，并獲得一些可能與纖維強度品質差異形成相關的基因表達序列標簽。 1.通過研究纖維發(fā)育動態(tài)，確定了11個供試品種發(fā)育時期相對一致的取樣點。 2.比較了兩套cDNA-AFLP方案，方案Ⅱ在實驗的可操作性、結果的可靠性、節(jié)約工作量與時間、RNA用量

3、等方面都優(yōu)于方案Ⅰ，確定方案Ⅱ更適合于研究次生壁增厚期纖維基因表達差異。 3.用方案ⅡI對11個品種的伸長期纖維進行了基因表達差異分析，分析了208對選擇性擴增引物，發(fā)現(xiàn)并回收了57個差異條帶，這些差異條帶表現(xiàn)為六種差異類型。 4.選取六條差異條帶進行了克隆測序，同源序列比對結果顯示：SZ5-10/13-1為棉屬LTP家族基因；SZ10-12/135-1 與擬南芥中線粒體伸長假設因子同源性達83％；SL3-14/2-1與

4、SL3-15/5-1測序結果相同，與水稻和擬南芥中的未知蛋白同源性達60％； SL13-16/q-1為未知基因；SL13-15/5-1與擬南芥中胼胝質合酶同源性達84％，與水稻中假設的胼胝質合酶同源性達80％。 5.對SL13-15/5-1 做RT-PCR 分析，結果其在PD5246品種的根、下胚軸、子葉中均不表達，在PD5246的伸長期纖維 (12DPA、19DPA)中明顯表達，但是在29DPA纖維中不表達；另外該片段在11個