中國漢族人群系統(tǒng)性硬化癥的候選基因關(guān)聯(lián)分析研究.pdf

1、目的:系統(tǒng)性硬化癥(Systemic sclerosis，SSc)是一種以纖維化為特征的自身免疫性疾病，遺傳易感性在其發(fā)病機(jī)制中發(fā)揮重要作用。全基因組關(guān)聯(lián)分析研究(genome-wide association study, GWAS)發(fā)現(xiàn)IRF5和IRF8基因均與白種人群中SSc患者相關(guān)。候選基因單核苷酸多態(tài)性(single-nucleotide polymorphisms，SNP)研究結(jié)果也顯示TNFSF4，TNFAIP3，CCR6

2、，IRF5，IRF8和ALK1基因的SNP位點(diǎn)和不同種族人群的多種自身免疫性疾病具有相關(guān)性，但其是否與中國漢族人群中的SSc患者相關(guān)目前尚未有研究報(bào)道。因此，本研究的目的是探討TNFSF4, TNFAIP3,CCR, IRF5，IRF8和ALK1基因與中國漢族人群SSc及其不同的臨床亞組之間的相關(guān)性，如SSc伴隨抗拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅰ抗體（Anti-topoisomeraseⅠ，也稱為抗Scl-70抗體）陽性組，SSc伴隨肺間質(zhì)病變(Inter

3、stitial lung disease，ILD)組和SSc伴隨肺動(dòng)脈高壓(Pulmonary hypertension, PAH)組。
　　方法:本研究納入了1030例SSc患者和1215例健康對(duì)照，采用基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜(Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time of Flight MassSpectrometry，MALDI-TOF MS)方法對(duì)如下6個(gè)基

4、因所選14個(gè)SNP位點(diǎn)進(jìn)行基因分型:TNFSF4(rs1234314,rs2205960,rs12039904和rs844648),TNFAIP3(rs5029939,rs6932056和rs5029937), CCR6(rs3093023, rs10946216和rs3093005),IRF5(rs4728142),IRF8(rs11642873和 rs11117432)和 ALK1(rs2277382)。
　　結(jié)果:TNFSF

5、4基因的位點(diǎn)rs844648等位基因和基因型頻率都與SSc相關(guān)(p=1.7×103和p=5.0×10-3)。TNFAIP3基因的位點(diǎn)rs6932056等位基因頻率在疾病組和對(duì)照組之間有顯著差異(p=5.0×10-3)。TNFSF4其他三個(gè)位點(diǎn)(rs1234314，rs2205960和rs12039904)和TNFAIP3基因的rs5029939則與SSc表現(xiàn)出相對(duì)較弱的相關(guān)性(p＜0.05)。上述六個(gè)SNP位點(diǎn)均與SSc-ILD亞組具有

6、相關(guān)性。TNFSF4基因的單體型rs1234314-rs2205960CG和GT以及rs12039904-rs844648CG和TA均與SSc具有相關(guān)性。CCR6基因的位點(diǎn)rs3093023等位基因頻率和基因型頻率均與SSc顯著相關(guān)（p=3.2×10-3和p=7.6×10-3）。CCR6基因的單體型rs3093023-rs10946216AT和GC與SSc同樣具有相關(guān)性（p=8.6×10-3和p=0.03）。IRF5基因的SNP位點(diǎn)rs

7、4728142在等位基因和基因型頻率上與SSc顯著相關(guān)（p=2.8×10-4和p=6.6×10-4），并且與抗SCL-70抗體陽性亞組和SSc-ILD亞組具有相關(guān)性(p=2.77×10-4和p=6.64×10-4)。ALK1基因的位點(diǎn)rs2277382僅與SSc-PAH亞組顯著相關(guān)(p=7.2×10-3)。
　　結(jié)論:本研究在中國漢族人群中開展，結(jié)果證實(shí)了TNFSF4，TNFAIP3，CCR6和IRF5基因與SSc具有相關(guān)性，CC