中國漢族人群FTO基因多態(tài)性與椎間盤退變關(guān)聯(lián)研究.pdf

1、椎間盤退變是一種由細(xì)胞介導(dǎo)，對進(jìn)行性結(jié)構(gòu)損傷的異常反應(yīng)。退變的椎間盤同時存在結(jié)構(gòu)性損傷和老化加速。結(jié)構(gòu)性損傷包括徑向撕裂、椎間盤突出、終板損傷、椎間隙狹窄等。多種因素與椎間盤老化和退變相關(guān)，包括遺傳因素、代謝因素、酶活力改變、細(xì)胞衰老和死亡、基質(zhì)中大分子和含水量改變、結(jié)構(gòu)性損傷和神經(jīng)血管因素。在遺傳易感性人群中，諸多危險因子作用于發(fā)生結(jié)構(gòu)性損傷的椎間盤，使椎間盤發(fā)生難以完全修復(fù)的改變，特別是老化的椎間盤，出現(xiàn)細(xì)胞介導(dǎo)的異常反應(yīng)，最終導(dǎo)致

2、椎間盤退變相關(guān)性疾病1。臨床上常導(dǎo)致頸、腰椎間盤突出癥，頸椎病，腰椎管狹窄癥，退性行腰椎不穩(wěn)，退性行腰椎滑脫、退行性脊柱側(cè)凸等。不同文獻(xiàn)報告的發(fā)生率相差較多，但通常數(shù)值都較大。在無癥狀人群中，有椎間盤膨出者占10-81％，椎間盤突出占3-63％，椎間盤脫出占0-24％，椎間盤信號強度降低(MRI)的有20-83％，3-56％出現(xiàn)椎間隙狹窄，6-56％存在纖維環(huán)撕裂，8-19％存在許莫氏結(jié)節(jié)。與之相對應(yīng)，如果包括有癥狀患者時，有椎間盤膨出

3、占22-48％，椎間盤突出占0-79％，椎間盤脫出占1-55％，椎間盤信號強度降低(MRI)的有9-86％，15-53％出現(xiàn)椎間隙狹窄，15％存在纖維環(huán)撕裂，6-79％存在許莫氏結(jié)節(jié)，6-57％存在骨贅。
　　 傳統(tǒng)觀點認(rèn)為，影響椎間盤退變疾病發(fā)生率的因素主要包括年齡、性別、職業(yè)、吸煙和行車震動，其他因素的貢獻(xiàn)率不確定，比如身高、體重和遺傳3。但是最新的研究結(jié)果表明，雖然椎間盤退變可能與環(huán)境和體質(zhì)因素有關(guān)，但是它們的貢獻(xiàn)率有限，

4、家系和孿生子研究表明遺傳因素是椎間盤退變的主要危險因素4。在同卵雙生子中貢獻(xiàn)率高達(dá)50-70％56。隨著研究逐漸深入到分子水平，公認(rèn)為IDD是一種多基因遺傳病。已經(jīng)陸續(xù)發(fā)現(xiàn)了一些與IDD相關(guān)的具有遺傳特性的特異性基因和位點，其中包括VDR、MMP3、COL1A1、COL9A1-3、COL11A2、IL1、IL6、AGC1、CILP、TIMP1、COX2、THSD2、SPARC。流行病調(diào)查發(fā)現(xiàn)IDD于體重呈正相關(guān)，而FTO基因又與肥胖明顯

5、相關(guān)，我們有必要從基因水平出發(fā)，對FTO基因與IDD的關(guān)聯(lián)性進(jìn)行研究，以明確FTO基因與IDD之間的相關(guān)性。
　　 研究目的：通過對FTO基因tagSNP的分型數(shù)據(jù)分析，探索FTO基因與漢族人群IDD之間的關(guān)聯(lián)，依據(jù)實驗結(jié)果提出可能的病因?qū)W假說研究方法本研究采用基于人群的病例一對照研究設(shè)計。
　　 研究對象:根據(jù)入選和排除標(biāo)準(zhǔn)入選2005年10月～2008年5月期間在北京協(xié)和醫(yī)院門診及住院118例IDD患者和113例非I

6、DD對照。
　　 研究方法：
　　 >QIAampDNABloodMiniKit試劑盒提取全血DNA；
　　 >根據(jù)NCBI數(shù)據(jù)庫獲得FTO基因的染色體位置，利用Haploview從國際人類基因組單體型圖計劃(HapmapPhase3)數(shù)據(jù)庫在相應(yīng)染色體區(qū)段獲取SNP數(shù)據(jù)，并選取共44個tagSNP；
　　 >所有研究對象應(yīng)用Vera Code Golden Gate Genotyping Assay對所

7、選的tagSNP進(jìn)行基因型鑒定。
　　 >擬和優(yōu)度X2檢驗(Goodness-of-fit Chi-squaretest)分析對照組基因型頻率的分布是否符合H-W平衡。
　　 >對單位點基于等位基因頻率、基因型頻率的關(guān)聯(lián)分析，評估單個位點與IDD發(fā)病風(fēng)險的相關(guān)性。
　　 >單體型關(guān)聯(lián)分析以及多因素聯(lián)合分析，評估多因素與IDD發(fā)生風(fēng)險的相關(guān)性。
　　 研究結(jié)果：我們共檢測了FTO基因的44個tagSNP位點

8、，其中有2個位點因不適于本基因芯片檢測方法。對照組中有42個tagSNP位點的H-W平衡檢驗時共3個位點P值<0.05，不符合H-W平衡，它們是rs4783818、rs6499640、rs12931934。在對病例組和對照組進(jìn)行基于等位基因和基因型的單個位點關(guān)聯(lián)分析中我們發(fā)現(xiàn)rs11076008位點等位基因頻率P＝0.0001553(FishersExact，bothsides)，多重檢驗校正后P＝0.003；基因型頻率P＝0.0003