應(yīng)用16s rRNA基因序列分析鑒定非典型細(xì)菌的實(shí)驗(yàn)研究.pdf

1、目的：建立以16SrRNA基因序列分析為基礎(chǔ)的細(xì)菌鑒定方法，并初步將其應(yīng)用于臨床微生物常規(guī)細(xì)菌鑒定，評(píng)價(jià)其在常規(guī)細(xì)菌鑒定中的鑒定效能。
　　方法：選擇臨床微生物實(shí)驗(yàn)室不能準(zhǔn)確鑒定的細(xì)菌13株，以16SrRNA為靶序列，在兩端保守區(qū)設(shè)計(jì)引物，PCR擴(kuò)增目的片段，測(cè)序后與數(shù)據(jù)庫(kù)中已知細(xì)菌的16SrRNA序列進(jìn)行序列比對(duì)。相似度大于99％的細(xì)菌判定為同種細(xì)菌，相似度介于95％～99％之間則判定為同屬，相似度在91％～95％之間判定為同科

2、。
　　結(jié)果：13株菌中，有11株菌的16srRNA基因序列與數(shù)據(jù)庫(kù)的比對(duì)結(jié)果相似性達(dá)99％以上，占84.6％，包括陰溝腸桿菌、Cowanii腸桿菌、表皮葡萄球菌、金黃色葡萄球菌、土生拉烏爾菌、鮑曼不動(dòng)桿菌、巴黎鏈球菌、鉛黃腸球菌、副血鏈球菌、Uruburuella suis、空腸彎曲菌，成功鑒定到種的水平；魯氏不動(dòng)桿菌的16SrRNA基因序列與數(shù)據(jù)庫(kù)的比對(duì)結(jié)果相似性為95％，僅能鑒定到屬的水平。
　　結(jié)論：16SrRNA基