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文檔簡介
1、四氫嘧啶及5-羥基四氫嘧啶在精細化工、生物醫(yī)藥、生物制造及生產(chǎn)、環(huán)保等領(lǐng)域有廣泛的用途及應(yīng)用前景。四氫嘧啶羥化酶能以Fe2+為輔因子、α-酮戊二酸為輔底物,催化四氫嘧啶轉(zhuǎn)化為5-羥基四氫嘧啶,是微生物發(fā)酵生產(chǎn)5-羥基四氫嘧啶過程中的關(guān)鍵酶。蛋白質(zhì)晶體學(xué)利用X射線衍射技術(shù)對蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)進行解析,使我們從原子角度了解蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)信息,結(jié)合蛋白質(zhì)的功能特性,確定在實際催化過程中的功能基團及其作用方式,為定向改造提供重要信息。
本文以
2、Bacillus pseudofirmus OF4菌株中的四氫嘧啶羥化酶EctD為研究對象,從其表達、純化以及結(jié)晶等方面展開深入研究。利用基因工程技術(shù)成功構(gòu)建了重組表達質(zhì)粒EctD-pET-22b(+),并在E.coli BL21(DE3)實現(xiàn)了高效可溶性表達,經(jīng)Ni-NTA親和層析、SuperdexTM20010/300 GL分子篩層析、Resource Q離子交換層析純化過程后,得到純度大于95%的目的蛋白。利用商業(yè)結(jié)晶試劑盒通過懸
3、滴和坐滴氣象擴散法對目的蛋白的結(jié)晶條件進行篩選。通過進一步結(jié)晶條件優(yōu)化,在0.2 mol/L MgCl2,0.1mol/L BIS-TRIS(pH6.5),25%(g/mL) PEG3,350,目的蛋白濃度為6.5 mg/ml結(jié)晶條件,運用坐滴氣象擴散法下獲得了高分辨率的目的蛋白晶體樣本。最終收集到分辨率為2.40(A)的EctD晶體的衍射數(shù)據(jù),數(shù)據(jù)處理結(jié)果顯示:EctD晶體屬于三斜晶系,空間群為P1晶胞參數(shù)為a=45.183(A),b
4、=58.871(A),c=68.812(A),α=77.478°,β=86.034°,γ=66.966°。采用原子置換法(MR),成功解析了EctD的三維結(jié)構(gòu)。一個晶胞由兩個蛋白質(zhì)分子組成,每個單體由9個α螺旋和9個β折疊通過轉(zhuǎn)角結(jié)構(gòu)和loop結(jié)構(gòu)鏈接形成。EctD晶體結(jié)構(gòu)的解析為我們深入理解四氫嘧啶羥化酶的酶結(jié)構(gòu)和生物學(xué)功能提供重要的指導(dǎo)信息。
另外,針對該蛋白與輔底物α-酮戊二酸及底物四氫嘧啶的復(fù)合物結(jié)晶工作在進一步進行中
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