影響棕色和白色脂肪分化相關(guān)長鏈非編碼RNA表達(dá)譜特征研究.pdf

1、背景：
　　長鏈非編碼RNA（LncRNAs）是參與多種生物功能普遍存在的一類重要基因，它可以作為參與轉(zhuǎn)錄調(diào)控的關(guān)鍵共活化因子。眾所周知，白色脂肪的功能是貯存能量而棕色脂肪是消耗能量。白色和棕色脂肪細(xì)胞均起源于中胚層。然而，目前尚不清楚LncRNAs是否在棕色脂肪和白色脂肪的能量代謝和成脂分化中起到作用。
　　目的：
　　研究LncRNAs在棕色和白色脂肪中表達(dá)譜的差異特征，明確LncRNAs是否參與棕色脂肪和白色脂肪

2、的能量代謝和成脂分化這一生物過程。為今后在治療肥胖提供了理論基礎(chǔ)。
　　方法：
　　首先，采用免疫組化法來鑒別棕色脂肪，隨后分別提取棕色脂肪和白色脂肪的總RNA并對(duì)總RNA的質(zhì)量鑒定;采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR，對(duì)這些差異倍數(shù)大的LncRNAs進(jìn)行驗(yàn)證;為了揭示這些LncRNAs的潛在功能，通過GO和Pathway分析方法，對(duì)這些表達(dá)差異的LncRNAs進(jìn)行了分析，并且通過斯皮爾曼相關(guān)分析和生物信息學(xué)分析對(duì)基因AK142386和

3、AK133540的潛在相關(guān)靶基因進(jìn)行了預(yù)測;
　　結(jié)果：
　　解偶聯(lián)蛋白-1（uncoupling protein-1 UCP-1）免疫組化顯示陽性著色較深的為棕色脂肪組織;利用第二代測序技術(shù)和芯片技術(shù)，通過比較棕色脂肪組織和白色脂肪組織分化相關(guān)LncRNA表達(dá)譜特征，發(fā)現(xiàn)了735個(gè)上調(diào)和877個(gè)下調(diào)的LncRNA（差異倍數(shù)大于4）。實(shí)時(shí)熒光定量PCR結(jié)果顯示所挑選出的基因差異性表達(dá)符合芯片結(jié)果;GO和Pathway分析，發(fā)

4、現(xiàn)了AK142386和AK133540影響了脂肪生成和能量代謝;斯皮爾曼和生物信息學(xué)分析，Hoxa3和Acad10分別是基因AK142386和AK133540的相關(guān)靶基因，推測可能通過其影響能量代謝。
　　結(jié)論：
　　通過實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證和生物信息學(xué)的方法，分析了棕色脂肪和白色脂肪LncRNA的差異表達(dá)譜特征，也證實(shí)本研究芯片數(shù)據(jù)有較高的可重復(fù)性，總之通過芯片結(jié)果已經(jīng)確定了大量的LncRNAs，這些LncRNAs在脂肪形成和能量代謝