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文檔簡(jiǎn)介
1、目的:
利用反向PCR(inverse-PCR)方法精確定位人結(jié)腸癌SW480細(xì)胞CD133基因啟動(dòng)子區(qū)對(duì)脫氧核糖核酸酶I(DNaseI)酶切敏感位點(diǎn),探討此方法在研究腫瘤細(xì)胞基因調(diào)控方面應(yīng)用的可行性。
方法:
以人結(jié)腸癌細(xì)胞系SW480為研究模型,細(xì)胞培養(yǎng)數(shù)量達(dá)到107時(shí)提取細(xì)胞核,10U/ml DNaseI切割SW480細(xì)胞核中的染色質(zhì)后,按照苯酚/氯仿/異戊醇(10:10:1)方法提取基因組,用限制性
2、內(nèi)切酶EcoRI和XmalI片段化基因組,通過末端補(bǔ)平、T4連接酶連接成環(huán)等過程,利用反向PCR擴(kuò)增產(chǎn)物,并將PCR產(chǎn)物經(jīng)純化后連入pMD-18 T載體,轉(zhuǎn)入到大腸桿菌TOP10株中進(jìn)行表達(dá),篩選陽性克隆進(jìn)行基因測(cè)序。
結(jié)果:
通過測(cè)序,人結(jié)腸癌SW480細(xì)胞CD133基因轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游9個(gè)DNaseI高敏感位點(diǎn)被鑒別出來,它們位于第一個(gè)外顯子-700~-300bp堿基區(qū)域內(nèi)。
結(jié)論:
應(yīng)用反向P
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