Arginine-Agmatine反向膜轉(zhuǎn)運蛋白AdiC的結(jié)構(gòu)與功能研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、生物體內(nèi)負責(zé)轉(zhuǎn)運氨基酸、多胺及金屬陽離子有機物(amino acid/polyamine/organocation,APC)的一系列膜轉(zhuǎn)運蛋白是一個超家族,AdiC是該APC超家族中的代表成員。AdiC是Arginine-Agmatine的反向膜轉(zhuǎn)運蛋白(Antipoter),它在抗酸性的過程中起著重要的作用。在極酸性環(huán)境中,AdiC會吸收環(huán)境中的Arg+進入細胞內(nèi),同時將細胞內(nèi)的Agm2+輸送到細胞外,伴隨著這個過程會釋放一個氫離子,

2、從而可以維持細胞內(nèi)正常的pH值。
   本論文主要是基于E.coli內(nèi)膜反向轉(zhuǎn)運蛋白AdiC野生型蛋白結(jié)構(gòu)的分析研究,設(shè)計不同的定點突變,通過等溫滴定量熱(ITC)技術(shù),檢測這些突變蛋白和底物結(jié)合的能力,通過底物轉(zhuǎn)運實驗,檢測這些突變蛋白轉(zhuǎn)運底物的能力。
   通過對不同AdiC突變體的生化與結(jié)構(gòu)分析,可以認為突變體蛋白AdiC-N22A既提高了蛋白與底物的結(jié)合能力又沒有太大降低蛋白的轉(zhuǎn)運活性,可以選擇其作為目的蛋白,以

3、研究其與底物Arg相結(jié)合的三維結(jié)構(gòu)。
   利用X-光衍射射線晶體學(xué)技術(shù)獲得了大腸桿菌AdiC-N22A蛋白與底物Arg結(jié)合(3.0 A)狀態(tài)下的高分辨率結(jié)構(gòu)。與野生型AdiC蛋白結(jié)構(gòu)相比,與Arg結(jié)合的AdiC呈現(xiàn)出一種緊縮的狀態(tài),這主要是由Arg與AdiC結(jié)合誘發(fā)第6個跨膜螺旋發(fā)生顯著的位置變化,同時,第2和第10個跨膜螺旋也發(fā)生位置變化。帶正電的Arg處于電負性的酸性空腔中,Arg的頭部與AdiC蛋白的主鏈原子形成氫鍵,碳

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