牛BBOX1基因選擇性多聚腺苷酸化變異體的克隆及3′UTR多態(tài)性分析.pdf

1、牛BBOX1基因定位在牛的15號染色體上，牛15號染色上存在與肉質(zhì)和胴體性狀相關(guān)的QTL。通過3’RACE的方法克隆了牛BBOX1基因的選擇性多聚腺苷酸化（alternative polyadenylation，APA)的變異體；采用RT-PCR的方法分析了BBOX1基因在牛不同組織中的表達譜；利用PCR-SSCP、PCR-RFLP和測序的方法檢測了BBOX1基因3'UTR在研究群體中的多態(tài)性，并分析了檢測到的基因多態(tài)性與牛肉質(zhì)和胴體性

2、狀的相關(guān)性。
　　本研究主要內(nèi)容包括：⑴發(fā)現(xiàn)了牛BBOX1基因的三個不同的APA變異體，它們的3'UTR長度分別為229bp，664bp和678bp，它們的GenBank登錄號分別為：KX431577，KX431578和KX431579。⑵用半定量RT-PCR的方法分析了牛BBOX1基因在不同組織中的表達情況，結(jié)果顯示BBOX1基因在所選擇的組織中都是表達的，其中瘤胃、肝臟和腎臟中的相對表達量較高。⑶在草原紅牛群體中，采用PCR-

3、SSCP和測序的方法對BBOX1基因3'UTR進了多態(tài)性檢測。共檢測到4個多態(tài)性座位，其中3個為單核苷酸多態(tài)性，1個為插入或缺失突變。而且SNP c.650T>C定位在遠端poly（A）加尾信號中，使加尾信號序列“AAUAAA”突變成“AACAAA”。在草原紅牛群體中，通過PCR-RFLP的方法對4個多態(tài)性座位進行基因分型。統(tǒng)計分析了各個多態(tài)性座位在群體中的基因頻率、基因型頻率、多態(tài)信息含量、有效等位基因數(shù)和期望雜合度等群體遺傳學(xué)參數(shù)。