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文檔簡(jiǎn)介
1、目的:
顱骨鎖骨發(fā)育不良綜合征(Cleidocranial dysplasia,CCD)是一種罕見的常染色體顯性遺傳性疾病(OMIM:119600),發(fā)病率約為1/1,000,000,性別和年齡無差異。CCD最典型的臨床特征是囟門閉合遲緩或不閉合;鎖骨發(fā)育不全;乳牙滯留、埋伏牙和多生牙。成骨細(xì)胞特異性轉(zhuǎn)錄因子(Runt-related transcription factor2,RUNX2)被確定為CCD的致病基因。該基因在成
2、骨細(xì)胞的分化和軟骨細(xì)胞的成熟過程中發(fā)揮著重要的作用。
目前,對(duì)于CCD的診斷和治療是臨床工作的難點(diǎn);利用分子生物學(xué)和生物信息學(xué)等技術(shù)深入探討CCD的發(fā)病機(jī)制是研究工作的熱點(diǎn)。近年來盡管CCD患者的RUNX2基因突變位點(diǎn)陸續(xù)被報(bào)道,但是此疾病致病基因篩選工作還遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠。本研究通過對(duì)一個(gè)CCD家系患者的顱頜面特征進(jìn)行分析,為臨床對(duì)該疾病的診斷提供幫助;并對(duì)該家系進(jìn)行RUNX2基因突變位點(diǎn)的篩查以及體外功能性研究,在分子和蛋白水平進(jìn)
3、一步探討CCD患者的發(fā)病機(jī)制,為遺傳咨詢和基因診斷的開展打下基礎(chǔ)。
方法:
1.以一個(gè)中國(guó)廣州的CCD家系成員為研究對(duì)象,對(duì)患病成員進(jìn)行病史采集和記錄(包括口腔和大體檢查以及影像學(xué)檢查),并分析患者顱面部軟硬組織特征。
2.采用酚/氯仿法提取家系成員外周血DNA,通過Sanger測(cè)序技術(shù)以及家系共分離等方法,確定致病基因與突變位點(diǎn)。
3.使用高分辨率熔煉曲線(High Resolution Mel
4、ting,HRM)技術(shù)篩查當(dāng)?shù)厝巳?00份隨機(jī)樣本,確定RUNX2基因突變位點(diǎn)的突變頻率。
4.采用Trizol法提取外周血細(xì)胞總RNA,利用qRT-PCR來檢測(cè)家系中正常人與患者外周血中RUNX2基因轉(zhuǎn)錄水平的差異。
5.使用結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)軟件SOPMA和I-TASSER分別預(yù)測(cè)RUNX2突變蛋白的二級(jí)蛋白結(jié)構(gòu)和三維構(gòu)象。
6.將人類UNX2基因正常轉(zhuǎn)錄本與異常轉(zhuǎn)錄本的cDNA克隆到載體pEGFP-C1上,利用
5、lipo2000轉(zhuǎn)染到HEK-293T細(xì)胞中后提取細(xì)胞的總RNA和總蛋白,采用qRT-PCR和Western Blot技術(shù)分別檢測(cè)野生型和突變型重組載體轉(zhuǎn)染到HEK-293T細(xì)胞后RUNX2mRNA和其蛋白表達(dá)水平的差異。
7.利用上一步中已轉(zhuǎn)染好的HEK-293T細(xì)胞,用DAPI染核技術(shù)染核,于共聚焦顯微鏡下觀察拍照,比較野生型與突變型融合蛋白在細(xì)胞中表達(dá)部位的差異。
結(jié)果:
1.該CCD家系患者臨床特征
6、
先證者表現(xiàn)出典型的CCD特征,包括口腔異常(乳牙滯留、大量埋伏牙和多生牙)和鎖骨發(fā)育不良。頜面部也表現(xiàn)出特征性改變,表現(xiàn)為眼距增寬,鼻梁塌陷,面中部發(fā)育不足;頭影測(cè)量分析表明上頜骨發(fā)育不足,下頜前突。先證者胞姐表現(xiàn)出類似的頜面部特征。
2.確定突變位點(diǎn)
Sanger測(cè)序結(jié)果顯示該家系患病成員RUNX2基因編碼區(qū)的第1271位堿基C發(fā)生了缺失(c.1271delC),該突變位點(diǎn)位于7號(hào)外顯子編碼的核基質(zhì)定位
7、信號(hào)區(qū)(NMTS,subnuclear matrix targeting signal),突變最終引起了39個(gè)氨基酸的缺失。在該家系正常成員以及當(dāng)?shù)?00份隨機(jī)外周血樣本中均未發(fā)現(xiàn)該位點(diǎn)突變。
3.體內(nèi)mRNA水平分析
qRT-PCR檢測(cè)結(jié)果顯示在患者和該家系健康人的外周血中RUNX2基因mRNA的表達(dá)水平?jīng)]有明顯的差異。
4.生物信息學(xué)預(yù)測(cè)分析
蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果顯示突變蛋白丟失了部分β轉(zhuǎn)角、
8、β折疊和無規(guī)則卷曲結(jié)構(gòu)而增加了α螺旋結(jié)構(gòu)。I-TASSER綜合建模法預(yù)測(cè)結(jié)果顯示堿基缺失突變體c.1271delC,其蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)發(fā)生明顯改變。
5.體外mRNA和蛋白表達(dá)水平分析
qRT-PCR檢測(cè)結(jié)果顯示野生型與突變型重組載體轉(zhuǎn)染到HEK-293T細(xì)胞后RUNX2基因mRNA相對(duì)表達(dá)量沒有明顯的差異;Western blot結(jié)果顯示突變型RUNX2融合蛋白表達(dá)水平高于野生型融合蛋白(p<0.001)。
9、 6.亞細(xì)胞定位功能
亞細(xì)胞定位結(jié)果顯示野生型RUNX2融合蛋白僅在胞核中表達(dá);而突變型RUNX2融合蛋白中在胞漿、胞核內(nèi)均可見綠色熒光。
結(jié)論:
1.本實(shí)驗(yàn)中先證者表現(xiàn)出CCD典型的口腔異常(乳牙滯留、埋伏牙和多生牙)和鎖骨發(fā)育不良,頜面部也具有特征性的改變,包括眼距增寬、面中部發(fā)育不足以及下頜前突等。
2.本實(shí)驗(yàn)在一個(gè)CCD家系患者的RUNX2基因上發(fā)現(xiàn)了一個(gè)新的移碼突變c.1271delC
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