靶向捕獲二代測(cè)序檢測(cè)不明原因兒童失神癲癇的致病基因分析.pdf

1、目的：
　　兒童失神癲癇（Childhood Absence Epilepsy, CAE）是一種常見的遺傳性全面性癲癇，研究表明半數(shù)以上兒童癲癇與遺傳因素相關(guān)，目前，雖報(bào)道了一系列與兒童失神癲癇相關(guān)的基因，但其發(fā)病原因和致病機(jī)制尚不明確。本研究通過靶向捕獲二代測(cè)序技術(shù)對(duì)100例兒童失神癲癇患兒進(jìn)行測(cè)序，以期發(fā)現(xiàn)新的易感基因及致病性突變，為探討兒童失神癲癇的致病機(jī)制提供依據(jù)，并有利于了解其他類型遺傳性全面性癲癇綜合征可能的發(fā)病機(jī)制。

2、此外，對(duì)遺傳性癲癇的臨床診治、遺傳咨詢及基礎(chǔ)研究也具有積極意義。
　　方法：
　　選取從北京大學(xué)第一醫(yī)院神經(jīng)科門診收集的100例不明原因CAE患兒臨床資料和外周血標(biāo)本，應(yīng)用靶向捕獲二代測(cè)序?qū)ζ溥M(jìn)行511個(gè)癲癇相關(guān)基因的突變篩查，篩選出可能的致病突變。然后，應(yīng)用一代測(cè)序（Sanger測(cè)序法）驗(yàn)證突變的父母來源，結(jié)合生物學(xué)、基因?qū)W及臨床表現(xiàn)明確其致病性，對(duì)氨基酸序列進(jìn)行保守性分析,得出致病性突變。
　　結(jié)果：
　　本

3、研究在100例兒童失神癲癇患兒中共發(fā)現(xiàn)1131個(gè)基因變異，最終從3例CAE患兒中發(fā)現(xiàn)3個(gè)變異為致病性突變，分別為SCN1A（c.5,399T>A）、SCN8A（c.2,371G>T）和CLCN2（c.481G>A），均為新生突變（de novo），Polyphen2軟件對(duì)3個(gè)突變蛋白的功能預(yù)測(cè)為很可能致?。╬robably damaged）；從1例CAE患兒中發(fā)現(xiàn)2個(gè)變異GPR98（c.5815G>A和c.16252G>T），基因變異分

4、別來自母親和父親，Polyphen2軟件對(duì)前者變異蛋白的功能預(yù)測(cè)為很可能致?。╬robably damaged），對(duì)后者的功能預(yù)測(cè)為良性(benign）。根據(jù)人類基因突變數(shù)據(jù)庫(kù)(Human Gene Mutation Database, HGMD），這5個(gè)突變均位于高度保守區(qū)域，均為未報(bào)道的突變（novel mutation）。
　　結(jié)論：
　　SCN1A、SCN8A、CLCN2和GPR98可能是兒童失神癲癇的易感基因。我們