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文檔簡(jiǎn)介
1、單核苷酸多態(tài)性(Single Nucleotide Polymorphisms, SNPs)是的一種遺傳標(biāo)記,通常位于人類基因組上,指在基因組水平上由于單個(gè)核苷酸的變異,而導(dǎo)致DNA序列的多態(tài)性。單核苷酸多態(tài)性被看作成一個(gè)新的遺傳標(biāo)志,它可以為疾病的預(yù)測(cè)、診斷、治療以及新型藥物的研制提供了可靠的有效的科學(xué)依據(jù),因此對(duì)其進(jìn)行研究具有非常重要的意義。
本文的主要工作是研究數(shù)據(jù)集中的致病因素在疾病診斷上的應(yīng)用,即致病因素對(duì)樣本的分類
2、。首先,在僅有一個(gè)致病因素的數(shù)據(jù)集上分析各自致病因素對(duì)樣本的分類性能;其次,比較不同SNP特征數(shù)目的分類性能和致病因素的分類性能;最后,對(duì)含有多個(gè)致病因素的集上設(shè)計(jì)了四個(gè)分類器對(duì)樣本進(jìn)行分類性能的研究。文章介紹了Bayes,kNN和SVM三種不同的分類算法和SNPRuler和mRMR特征選擇算法,并將它們應(yīng)用到致病因素對(duì)樣本的分類實(shí)驗(yàn)中。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明:采用致病因素對(duì)樣本進(jìn)行分類,其分類效果最好,但是并不能應(yīng)用于疾病的診斷。從中我們可得到
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