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文檔簡介
1、P-選擇素糖蛋白配體-1(PSGL-1),是一種跨膜蛋白,它在白細(xì)胞內(nèi)以二聚體的形式表達(dá)。在炎癥反應(yīng)初期,PSGL-1可以通過與血小板以及內(nèi)皮細(xì)胞上的P-selection蛋白相互作用,進(jìn)而介導(dǎo)白細(xì)胞黏附過程。相關(guān)研究已經(jīng)證實,通過PSGL-1跨膜區(qū)介導(dǎo)的二聚作用的對于實現(xiàn)其生化功能是必不可少的。目前,關(guān)于PSGL-1跨膜區(qū)相互作用的機(jī)制尚未可知。
在本論文中,我們采用TOXCAT體系,設(shè)計了7種不同序列長度的跨膜區(qū)嵌合體,證
2、實了跨膜區(qū)序列長度能夠影響跨膜蛋白的相互作用。包含320-343這24個氨基酸殘基序列的PSGL-WT跨膜螺旋二聚作用最強(qiáng),選作后續(xù)研究的野生型菌種。PSGL-WT的同源二聚能力約為陽性對照GPA的1.5倍,這表明它是一個自身相互作用非常強(qiáng)的二聚體。然后,通過亮氨酸和丙氨酸全掃描突變研究PSGL-1跨膜區(qū)相互作用機(jī)制,結(jié)果綜合表明位于(abcdefg)n七肽重復(fù)序列的a面的I324,A331,T338以及d面的C320,L327,F(xiàn)33
3、4,L341氨基酸突變體會造成PSGL-1-TM二聚能力下降,初步認(rèn)定PSGL-1的跨膜區(qū)相互作用是由a,d面組成的亮氨酸拉鏈介導(dǎo)的。
隨后,分子動力學(xué)模擬方法被用于驗證TOXCAT實驗結(jié)果,同時進(jìn)一步確認(rèn)二聚體的相互作用接觸面。對野生型序列的粗?;M中,我們得出了PSGL-WT二聚體兩個單體的主鏈之間的距離平穩(wěn),距離約7.5(A);形成了一個右手螺旋構(gòu)象,出現(xiàn)-27°的二面角。另外,通過野生型和a,d面的突變型對比發(fā)現(xiàn),二
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