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文檔簡(jiǎn)介
1、香蕉枯萎?。‵usarium wilt)是香蕉生產(chǎn)中重要的維管束系統(tǒng)性病害,其病原菌為尖孢鐮刀菌古巴?;停‵oc)。Foc有四個(gè)生理小種,其中,1號(hào)小種(Foc1)和4號(hào)小種(Foc4)在我國(guó)分布最為廣泛。目前,香蕉枯萎病的主要防治方法有抗病育種、化學(xué)防治和生物防治等,但對(duì)于該病害的防治效果并不是很理想。因此,研究Foc與香蕉互作的分子機(jī)制將為該病害的防治提供理論依據(jù)。分泌蛋白作為一類重要的致病因子,在Foc侵染香蕉過(guò)程中起著重要作用
2、,但目前對(duì)于Foc分泌蛋白質(zhì)缺乏系統(tǒng)了解。
本研究以Foc1和Foc4為研究對(duì)象,通過(guò)巴西蕉組織提取物的誘導(dǎo),采用非標(biāo)記蛋白定量技術(shù)(Label-free)分析了2個(gè)小種的菌絲分泌蛋白質(zhì)表達(dá)變化,并結(jié)合生物信息學(xué)等方法對(duì)差異表達(dá)的分泌蛋白進(jìn)行了功能預(yù)測(cè)分析。具體結(jié)果如下:
1、采用 TCA-DOC沉淀法、丙酮沉淀法和硫酸銨沉淀法三種常用方法,對(duì) Foc分泌蛋白進(jìn)行了提?。籗DS-PAGE和提取效率的比較分析表明,改良
3、的DOC-TCA沉淀法適合于Foc分泌蛋白質(zhì)的提取,能滿足基于質(zhì)譜的Foc分泌蛋白質(zhì)組分析的要求。
2、應(yīng)用基于Label-free的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)和生物信息學(xué)技術(shù),以香蕉組織誘導(dǎo)條件下生長(zhǎng)5 d的2個(gè)Foc小種菌絲為研究對(duì)象,對(duì)其分泌蛋白質(zhì)表達(dá)差異進(jìn)行了分析。結(jié)果表明,采用Label-free的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)共鑒定了2573個(gè)Foc蛋白。與Foc1對(duì)照相比,誘導(dǎo)條件下的Foc1有42個(gè)分泌蛋白質(zhì)差異表達(dá),其中經(jīng)典分泌蛋白有3
4、0個(gè),占差異蛋白總數(shù)的62.5%;非經(jīng)典分泌蛋白有12個(gè),占差異蛋白總數(shù)的25%。與Foc4對(duì)照相比,誘導(dǎo)條件下的Foc4有57個(gè)分泌蛋白質(zhì)差異表達(dá),其中經(jīng)典分泌蛋白有43個(gè),占差異蛋白總數(shù)的65.2%;非經(jīng)典分泌蛋白有14個(gè),占總差異蛋白的21.2%。與Foc1對(duì)照相比,非誘導(dǎo)條件下的Foc4有52個(gè)分泌蛋白質(zhì)差異表達(dá),其中經(jīng)典分泌蛋白有38個(gè),占總差異蛋白的64.4%;非經(jīng)典分泌蛋白有14個(gè),占總差異蛋白的23.7%;與Foc1處理
5、相比,誘導(dǎo)條件下的Foc4共有個(gè)106個(gè)分泌蛋白質(zhì)差異表達(dá),其中經(jīng)典分泌蛋白有75個(gè),占總差異蛋白的61%,非經(jīng)典分泌蛋白有31個(gè),占總差異蛋白的25.2%。
3、經(jīng)蛋白功能注釋、GO分析和KEGG功能分類,結(jié)果表明,F(xiàn)oc1中差異表達(dá)的分泌蛋白參與的分子功能主要有催化活性、結(jié)合功能和分子轉(zhuǎn)運(yùn)活性等,參與的生物過(guò)程主要有代謝過(guò)程、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和定殖過(guò)程等,參與的代謝通路主要有內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中蛋白質(zhì)合成通路、植物與病原物互作用通路、碳代謝通
6、路和 AMPK激酶信號(hào)通路等。Foc4中差異表達(dá)的分泌蛋白參與的分子功能主要有催化活性、分子轉(zhuǎn)運(yùn)活性和抗氧化活性等,參與的生物過(guò)程主要有代謝過(guò)程、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和對(duì)脅迫反應(yīng)的過(guò)程等,參與的代謝通路主要有嘌呤代謝通路、氨基酸生物合成途徑、TCA循環(huán)、煙酸鹽和煙酰胺代謝通路、植物與病原物互作通路等。
4、對(duì)誘導(dǎo)條件下Foc1和Foc4間差異表達(dá)的分泌蛋白質(zhì)進(jìn)行了比較分析,結(jié)果表明在92個(gè)差異表達(dá)的分泌蛋白中,其功能主要涉及到細(xì)胞壁降解、
7、蛋白修飾、氧化脅迫反應(yīng)過(guò)程、氧化還原過(guò)程和能量代謝等過(guò)程。其中,谷氨酰胺合成酶、絲氨酸-蘇氨酸蛋白磷酸酶等僅在Foc1中差異表達(dá);磷酸化激酶、角質(zhì)酶、1,6-β-葡糖苷酶、1,3-β葡糖苷酶、幾丁質(zhì)脫乙酰酶、羧肽酶、天冬氨酸蛋白酶等僅在Foc4中差異表達(dá);過(guò)氧化氫酶和氨肽酶等在2個(gè)小種均有表達(dá)。根據(jù)這些分泌蛋白參與的生物學(xué)功能,進(jìn)一步推測(cè)磷酸化激酶、角質(zhì)酶、1,6-β-葡糖苷酶、1,3-β葡糖苷酶、幾丁質(zhì)脫乙酰酶、羧肽酶、天冬氨酸蛋白酶
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