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1、華中科技大學(xué)博士學(xué)位論文藍(lán)藻藻藍(lán)蛋白的生物合成及裂合酶催化功能的研究姓名:張娟申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別:博士專業(yè):環(huán)境科學(xué)指導(dǎo)教師:趙開(kāi)弘20091001II華中科技大學(xué)博士學(xué)位論文華中科技大學(xué)博士學(xué)位論文結(jié)合。加入與CpeT1和CpeS1同源的裂合酶輔助催化時(shí),生成產(chǎn)物也為非天然產(chǎn)物,不能得到CpcB的天然色素蛋白。此外,在已有的體外重組條件下,摸索了pH值、二價(jià)金屬離子以及還原劑ME對(duì)CpeT1體外催化活性的影響,結(jié)果顯示,pH6.5~7.0時(shí)
2、裂合酶催化活性最好,二價(jià)金屬離子的加入并不能促進(jìn)酶反應(yīng)活性,大多數(shù)反而抑制反應(yīng),去污劑和甘油的加入也會(huì)降低酶的生物活性。因此,CpeT1體外催化最佳反應(yīng)條件為500mmolLKPB150mmolLNaClpH7.2,不需加入其他輔助因子。在最佳重組體系中,裂合酶CpeT1催化CpcB得到色素蛋白的光譜圖與體內(nèi)重組產(chǎn)物相同,多酶的協(xié)助催化仍然不能生成天然產(chǎn)物。以上重組生成的色素蛋白經(jīng)圓二色譜檢測(cè),結(jié)果顯示各色素蛋白在可見(jiàn)光區(qū)的構(gòu)象均與天然
3、色素蛋白相同,在紫外光區(qū)呈現(xiàn)天然藻膽蛋白的α螺旋結(jié)構(gòu)。裂合酶CpeT1經(jīng)特異性的化學(xué)劑修飾后,可以確定其功能氨基酸。修飾劑12環(huán)己二酮專一性修飾精氨酸,焦碳酸二乙酯修飾組氨酸,磷酸吡哆醛修飾賴氨酸,碳化二亞胺修飾羧基氨基酸?;瘜W(xué)修飾結(jié)果表明,精氨酸和組氨酸被修飾后活性降低,熒光和紫外吸收特征峰值發(fā)生改變;賴氨酸和羧基氨基酸被修飾后,重組產(chǎn)物與天然產(chǎn)物相近,沒(méi)有發(fā)生變化。證明精氨酸和組氨酸可能是與裂合酶活性相關(guān)的氨基酸。同時(shí),通過(guò)體內(nèi)重組
4、與體外重組的方法,判斷裂合酶His6CpeT1能否與藻藍(lán)色素PCB連接。體內(nèi)重組產(chǎn)物紫外吸收峰值為620nm左右,經(jīng)酸性尿素變性后變?yōu)?94nm,證明產(chǎn)物為游離色素,CpeT1在大腸桿菌體內(nèi)不連接色素PCB。體外重組產(chǎn)物紫外吸收峰值在619nm左右,變性洗脫后基本無(wú)色素產(chǎn)物,進(jìn)一步證明裂合酶CpeT1不能連接藻藍(lán)色素PCB,其酶催化機(jī)理將進(jìn)一步深入研究。CpeS1具有廣泛的催化活性,是藻藍(lán)蛋白中比較重要的裂合酶。經(jīng)過(guò)化學(xué)修飾發(fā)現(xiàn),半胱氨
5、酸和精氨酸等氨基酸能影響CpeS1的生物活性。使用定點(diǎn)突變?cè)噭┖袑peS1的51位和63位半胱氨酸突變?yōu)樘K氨酸,將18位、147位、169位分別突變?yōu)槔i氨酸、谷胺酰胺和亮氨酸。通過(guò)同源性比對(duì),此五個(gè)氨基酸在同源的十余個(gè)蛋白中具有較高的同源性。同時(shí),使用蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)分析軟件分析定點(diǎn)突變后蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)變化情況。分析結(jié)果發(fā)現(xiàn),51位和147位氨基酸的突變導(dǎo)致了蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的改變,而其余幾位定點(diǎn)突變后的結(jié)構(gòu)變化微小。在大腸桿菌體內(nèi)表達(dá)出帶有
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