部分中國黃牛BoLA-DQB、DRB-,3-基因及其上游調控區(qū)序列分析.pdf

1、MHC即主要組織相容性復合體(Major Histocompatibility Complex)是由緊密連鎖、高度多態(tài)的基因位點所組成的染色體上的一個區(qū)域,在機體的免疫應答調控和免疫識別過程中發(fā)揮著重要作用.該研究采用測序法,分別對恩施黃牛、秦川牛、皖南牛、溫嶺高峰牛、廷邊牛的MHC-Ⅱ類基因DQB和DRB<,3>及其上游調控區(qū)序列進行分析,以揭示中國黃牛MHC基因的分子遺傳多樣性,得到以下結果:(1)該研究在中國黃牛中共發(fā)現(xiàn)127種D

2、QB<'*>exon2等位基因,恩施黃牛中36個,秦川牛中42個,皖南牛中35個,溫嶺高峰牛中40個,延連牛中42個.(2)127種DQB<'*>exon2等位基因之間共存在85個(79Pi+6S)多態(tài)位點,占序列總長度的31.48﹪.在DQB<'*>exon2等位基因和DQB<,3><'*>exon2等位基因中,發(fā)生非同義替換的多態(tài)位點均主要分布在抗原結合位點對應的編碼序列中.(3)127種DQB<'*>exon2等位基因編碼的氨基酸

3、序列之間共存在41個(40Pi+1S)變異位點.按照品種劃分,恩施黃牛40個(36Pi+4S);延邊牛39個(36Pi+3S);秦川牛37個(36Pi+1S);溫嶺高峰牛37個(34Pi+3S);皖南牛最少,為36個(34Pi+2S).將各個變異位點的氨基酸組成進行品種間比較,通過卡方檢驗證明,第13、77和86位點的氨基酸組成在品種間具有顯著差異(p<0.05),第28位和第75位差異極顯著(p<0.01).其中包含了第13、28和8

4、6位共3個抗原結合位點.(4)在35種BoLA-DQB<'*>exon2等位基因上游共檢測到28種DQB-URR等位基因.DQB<'*>exon2等位基因中除了Q-19、Q-36、Q-38分別只與一種DQB-URR等位基因相對應外,其余的均分別對應兩種DQB-URR等位基因.(5)在28種BoLA-DQB-URR等位基因和12種BoLA-DRB-URR等位基因中均存在與HLA-Ⅱ類基因上游調控區(qū)中類型一致,且排列順序一致的與基因表達調控

5、有關的調控元件,包括W box、X box、Y box、CCAAT box以及類TATA box.(6)BoLA-DQB-URR等位基因中,調控元件W box、X box、Y box以及類TATA box是多態(tài)的,CCAAT box是保守的.另外,在調控元件之間也分布著多態(tài)位點.(7)對于BoLA-DQB、DRB基因,相同的結構基因都可以與不同的URR相對應,反之亦然.說明啟動子與結構基因之間并不存在嚴格的對應關系,其對應關系是可變的.