六品種小型豬SLA-DQB、DRB基因外顯子2的群體分子遺傳結(jié)構(gòu)分析.pdf

1、主要組織相容性復(fù)合體(：Majior histocopitibility complex，MHC)指集中于某一染色體、編碼與免疫應(yīng)答直接相關(guān)的一類細胞膜糖蛋白基因群。其功能不僅限于移植排斥反應(yīng)，它還與機體對外源性抗原的免疫應(yīng)答之間存在關(guān)聯(lián)。主要組織相容性復(fù)合物是目前已知多態(tài)性最豐富的基因系統(tǒng)，本研究主要對186頭6品種小型豬的SLAⅡ類基因DQB和98頭3品種小型豬的SLAⅡ類基因.DRB的外顯子2進行了PCR-RFLP酶切分型，擴增片

2、段包含部分第1內(nèi)含子、完整第2外顯子及部分第2內(nèi)含子，DQB為326b0、DRB為311bp，同時本研究對這兩個基因的擴增片段進行了克隆測序，并進行群體的遺傳結(jié)構(gòu)分析和進化分析，結(jié)果如下： 采用Rsa I和Hinf I兩種限制性內(nèi)切酶對甘孜藏豬、合作豬、滇南小耳豬、巴馬小型豬、五指山豬和荷包豬6個品種的186頭個體進行了SLA-DQB基因的PCR-RFLP分型；SLA-DQB片段經(jīng)Rsa I酶切得到5種等位基因，14種基因型(C

3、C、DD、GG、FF、CD、CG、CE、CF、DG、DE、DF、GE、GF、EF)，各個豬種中的基因型分布在5～10種之間，6個豬群的雜合度(He)在0.5384～0.7288之間，且華北型(0.7288)>華南型(0.7161)>高原型(0.6913)，巴馬小型豬的PIC值(0.4884)略小于0.5，偏向于高度多態(tài)，其它5個群體的：PIC值在0.5712～0.7285之間，均大于0.5，表現(xiàn)為高度多態(tài)；經(jīng)卡方適合性檢驗：甘孜藏豬，巴

4、馬小型豬和五指山豬的卡方適合性檢驗值均低于顯著水平(P>0.05)，達到了Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)。合作豬，滇南小耳豬和荷包豬在該位點均未達到Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)；經(jīng)Hinf I酶酶切，得到了3種等位基因，6種基因型(HH、II、JJ、HI、HJ、U)，He在不同的生態(tài)類型豬種中的分布為：華北型(0.5238)>高原型(0.4350)>華南型(0.4286)，PIC值在0.2908～0.4610之間，在該位點

5、表現(xiàn)為中度多態(tài)。在不同的生態(tài)類型中，其PIC值大小依次為：華北型>華南型>高原型，經(jīng)卡方適合性檢驗，甘孜藏豬，滇南小耳豬，巴馬小型豬，荷包豬的卡方適合性檢驗值均低于顯著水平(P>0.05)，達到了Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)。合作豬，五指山豬在該位點未達到Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)。 SLA.DRB片段經(jīng).RsaI酶酶切，得到了5種等位基因(R、S、T、U、V)，9種基因型，三個群體中，S是優(yōu)勢等位基因(0.6

6、786)，V為劣勢等位基因(0.0562)，PIC值大小依次為：合作豬(0.5875)>五指山豬(0.4780)>荷包豬(0.3314)；：He值的大小依次為：合作豬(0.6306)>五指山豬(0.5122)>荷包豬(0.3448)；經(jīng)卡方適合性檢驗，合作豬卡方值低于顯著水平(P>0.05)，達到Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)，五指山豬，荷包豬沒有達到Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)；經(jīng)MspI酶酶切，得到了兩種等位基因，3種

7、基因型(PP、QQ、PQ)，Q為優(yōu)勢等位基因(0.5918)，P為劣勢等位基因(0.4082)，PIC值大小依次為：荷包豬(0.3713)>合作者(O.3680)>五指山(0.3579)。He值的大小依次為：荷包豬(0.4927)>合作豬(0.4861)>五指山(0.4669)，經(jīng)卡方適合性檢驗，合作豬，五指山豬和整個群體的卡方檢驗值均低于顯著水平(P>0.05)，在MspI位點達到Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)，荷包豬沒有達到H