四川獼猴MHC-DQB1外顯子2的多態(tài)性和適應(yīng)性分析.pdf

1、Category$862、$863Number：$20113703SichuanAgricultureUniversityPolymorphismandadaptionanalysisofMHCDQBlgene，■neX0nZln』坦口C口CamUla以紀(jì)1rom3lCnUanDaiqiuxia(Wildlifeconservationandutilization)DirectedbyProfessorXuHuailiangJune，2

2、014摘要獼猴(Macacamulatta)作為我國(guó)二級(jí)保護(hù)動(dòng)物和重要的實(shí)驗(yàn)靈長(zhǎng)類動(dòng)物，廣泛分布于中國(guó)。但是由于受到人類活動(dòng)的影響，棲息地嚴(yán)重的碎片化，其數(shù)量也正在急劇下降。主要組織相容性復(fù)合體(Themajorhistocompatibilitycomplex，MHC)基因是脊椎動(dòng)物特有的，參與機(jī)體免疫應(yīng)答的重要多基因家族之一。由于MHCII類基因主要參與識(shí)別外界病原體，因此在其編碼的抗原結(jié)合區(qū)呈現(xiàn)出高水平的多態(tài)性。由于MHC基因在免

3、疫中的重要作用，被認(rèn)為是研究脊椎動(dòng)物適應(yīng)性機(jī)制的最佳標(biāo)記。目前，MHC基因的多態(tài)性及其進(jìn)化機(jī)制成為了保護(hù)生物學(xué)的研究熱點(diǎn)。本研究通過聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)和單鏈構(gòu)象多態(tài)分析(PolymerisechainreactionSinglestrandconformationpolymorphism，PCRsscP)pA及克隆測(cè)序技術(shù)對(duì)四川6個(gè)野生種群的142個(gè)獼猴個(gè)體的MHCDQBJ基因的多態(tài)性進(jìn)行分析，并結(jié)合了之前四川地區(qū)獼猴微衛(wèi)星的數(shù)據(jù)討論了其適

4、應(yīng)性進(jìn)化中多態(tài)性的維持機(jī)制，結(jié)果一方面對(duì)四川6個(gè)野生獼猴種群的遺傳背景及不同地理種群的遺傳結(jié)構(gòu)狀況進(jìn)行闡述，為獼猴遺傳資源保護(hù)策略提供基礎(chǔ)，另一方面也為圈養(yǎng)獼猴的利用起到一定的指導(dǎo)作用。本研究主要結(jié)果如下：(1)本研究在142個(gè)野生獼猴個(gè)體中共檢測(cè)出27條不同的MamuDQBl等位基因，其中頻率最高的等位基因?yàn)镸amu—D∞J“0614，等位基因MamuDQBl“1503和等位基因MamuD妒J車7703的頻率也超過了10％，說明這三條

5、等位基因在四川獼猴中屬于優(yōu)勢(shì)等位基因，可能和某種普遍的病原微生物相關(guān)。MamuD∞，外顯子2完整的270bp的序列中，有92個(gè)變異位點(diǎn)；推導(dǎo)的89個(gè)氨基酸殘基中，共檢測(cè)到43個(gè)氨基酸突變位點(diǎn)，說明四川獼猴在MI1CDQBl位點(diǎn)上具有較高遺傳多態(tài)性水平。(2)先前報(bào)道的獼猴MHC—D妒』六大譜系06，木15，幸16，牛17，牛18，24都在本研究中發(fā)現(xiàn)了，比較獼猴和食蟹猴MHCDQBl等位基因發(fā)現(xiàn)14條等位基因序列是完全相同的，其中有11

6、條在本研究的種群中發(fā)現(xiàn)。27條Mamu—D∞J等位基因是按照譜系與Mafa—DQBl分散聚集在一起的，表現(xiàn)了獼猴和食蟹猴高水平的跨物種多態(tài)性。這種跨物種多態(tài)性以及6個(gè)種群間等位基因的共享都表明了歷史性的平衡選擇在維持祖先等位基因起到的重要作用。然而對(duì)MamuD緲，外顯子2的選擇壓力分析顯示，編碼的抗原結(jié)合位點(diǎn)和非抗原結(jié)合位點(diǎn)的非同義替換率與同義替換率的比值(o=duIds)都是大于1的，說明都受到了平衡選擇，但是Z檢驗(yàn)卻不顯著，說明作用