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文檔簡(jiǎn)介
1、目的:
(1)采用聚合酶鏈反應(yīng)-直接測(cè)序法在在新疆漢族、維吾爾族冠心病患者中檢測(cè)C5L2基因和C5aR1基因新的突變位點(diǎn)。
(2)探討C5L2基因新的突變位點(diǎn)及標(biāo)簽SNP位點(diǎn)基因多態(tài)性與新疆漢族及維吾爾族冠心病的相關(guān)性研究及其危險(xiǎn)因素,C5L2基因不同基因型和冠心病患者預(yù)后的關(guān)系。
(3)探討C5aR1基因新的突變位點(diǎn)及標(biāo)簽SNP位點(diǎn)與新疆漢族及維吾爾族冠心病及其危險(xiǎn)因素的關(guān)系,進(jìn)一步探討C5aR1基因不同
2、基因型和冠心病患者預(yù)后的關(guān)系。
方法:
(1)采用聚合酶鏈反應(yīng)-直接測(cè)序法選擇經(jīng)冠狀動(dòng)脈造影檢查明確診斷為冠心病患者96例,其中包括維吾爾族48例和漢族48例;在C5L2基因以及C5aR1基因啟動(dòng)子區(qū)和編碼區(qū)進(jìn)行擴(kuò)增,并利用DNAMan軟件和Chromas軟件做測(cè)序結(jié)果與下砸序列的對(duì)比,將發(fā)現(xiàn)的SNP位點(diǎn)在人類(lèi)基因組數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行了比對(duì),如在HapMap數(shù)據(jù)庫(kù)、NCBI/SNP數(shù)據(jù)庫(kù)以及日本基因組數(shù)據(jù)庫(kù)中如果均沒(méi)有發(fā)現(xiàn)
3、此SNP位點(diǎn),將新發(fā)現(xiàn)的SNP位點(diǎn)認(rèn)定為新的SNP位點(diǎn)。
(2)采用病例-對(duì)照研究的方法,選擇經(jīng)冠脈造影檢查確診的冠心病患者1364例和性別、年齡、民族均匹配的正常健康對(duì)照人群1589例,采用質(zhì)譜分析技術(shù)方法對(duì)C5L2基因新的突變位點(diǎn)以及標(biāo)簽SNP進(jìn)行基因分型,分析C5L2基因新的突變位點(diǎn)以及標(biāo)簽SNPs和冠心病的相關(guān)性關(guān)系;并對(duì)冠心病患者1105例,對(duì)其進(jìn)行為期2-5年的隨訪(fǎng),觀(guān)察非致死性心肌梗死、全因死亡、腦卒中、出血事件
4、以及總major adverse cardiac events(MACE)事件的發(fā)生率之間的差異。
(3)采用病例-對(duì)照研究,對(duì)C5aR1基因進(jìn)行分型,分析C5aR1基因新的突變位點(diǎn)以及標(biāo)簽SNPs和冠心病的關(guān)系。對(duì)冠心病組不同基因型進(jìn)行為期2-5年隨訪(fǎng),觀(guān)察不同基因型與冠心病預(yù)后關(guān)系。
結(jié)果:
(1)在C5L2基因第二外顯子區(qū)發(fā)現(xiàn)新的突變位點(diǎn)2個(gè),分別是744C>A和597G>A,分別使得在248位置上的
5、CCC置換為CCA和199位置上的GCG轉(zhuǎn)變?yōu)镚CA。但是這兩個(gè)突變位點(diǎn)的改變均未引起氨基酸的改變屬于同義突變。在C5aR1基因第2外顯子區(qū)也檢測(cè)到了一個(gè)新的突變位點(diǎn),發(fā)生547G>A置換,使得在183位置上GCC置換為ACC,導(dǎo)致丙氨酸置換為蘇氨酸(A183T)屬于錯(cuò)義突變。
(2) C5L2基因597G>A位點(diǎn)的變異與新疆維吾爾族冠心病發(fā)生有關(guān)聯(lián),597G>A突變攜帶AG基因型者發(fā)生冠心病的風(fēng)險(xiǎn)增加(OR=3.028,95
6、% confidenceinterval[CI]:1.045-8.778,P=0.041)。C5L2基因的標(biāo)簽SNP位點(diǎn)(rs2972607和rs8112962)與冠心病的發(fā)病具有相關(guān)性,在漢族和維吾爾族人群中rs2972607顯性模型與冠心病具有相關(guān)性(OR=1.401,95%CI=1.026-1.914,P=0.034和OR=1.408,95%CI=1.087-1.824,P=0.01),對(duì)于rs8112962這個(gè)位點(diǎn)的顯性模型在漢
7、族人群中與冠心病的發(fā)病具有相關(guān)性(OR=1.541,95%CI=1.039~2.172,P=0.014),而在維吾爾族人群中未發(fā)現(xiàn)此位點(diǎn)與冠心病具有相關(guān)性。
(3) C5aR1基因547G>A位點(diǎn)顯性模型在與漢族和維吾爾族人群冠心病具有相關(guān)性(P<0.001,OR=0.015,95% CI:0.007-0.034和P=0.004,OR=0.691,95% CI:0.537-0.889),rs10853784位點(diǎn)多態(tài)性與新疆地區(qū)
8、漢族人群冠心病的發(fā)病存在一定的關(guān)聯(lián)性,漢族人群純合子突變CC基因型攜帶者發(fā)生冠心病的風(fēng)險(xiǎn)顯著增加(OR=1.430,95%CI:1.087~1.882,P=0.011),在維吾爾族人群中未發(fā)此位點(diǎn)的基因多態(tài)性與冠心病具有相關(guān)性。C5aR1基因3個(gè)標(biāo)簽SNPs位點(diǎn)在漢族人群中共建立4個(gè)單體型,冠心病組A-C-T單體型出現(xiàn)的頻率明顯低于對(duì)照組(0.180 vs0.238,P=0.003,OR=0.714,95%CI=0.575~0.895)
9、。A-T-C單體型在冠心病組的頻率明顯高于對(duì)照組(0.380 vs0.335,P=0.019,OR=1.251,95%CI=1.037~1.510)。在維吾爾族人群中,C5aR1基因3個(gè)SNPs位點(diǎn)也建立了4個(gè)單體型,冠心病組A-C-C單體型出現(xiàn)的頻率明顯高于對(duì)照組(0.229 vs0.199;P=0.023,OR=1.231,95%CI=1.023~1.471)。A-C-T單體型在冠心病組的頻率明顯低于對(duì)照組(0.209 vs0.26
10、5,P=0.035,OR=0.752,95%CI=0.633~0.894)。
(4)通過(guò)2-5年隨訪(fǎng),發(fā)現(xiàn)在漢族人群,C5L2基因多態(tài)位點(diǎn)rs2972607 GG基因型發(fā)生MACE事件的幾率明顯升高,GG基因型攜帶者發(fā)生MACE事件的風(fēng)險(xiǎn)較AA基因型攜帶者增加了1.122倍(HR=2.122,95%CI:1.302-6.113),但在維吾爾族患者中未發(fā)現(xiàn)。rs2972607多態(tài)性和MACE事件的發(fā)生有關(guān)。對(duì)于597G>A和rs
11、8112962兩個(gè)位點(diǎn),無(wú)論在漢族還是在維吾爾族,均未發(fā)現(xiàn)其多態(tài)性和冠心病的預(yù)后相關(guān)。對(duì)于C5aR1基因,547G>A和rs10853784基因多態(tài)性和冠心病的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)具有關(guān)聯(lián),但和冠心病的不良預(yù)后無(wú)關(guān)。
結(jié)論:
(1)直接測(cè)序法在C5L2基因和C5aR1基因第二外顯子區(qū)進(jìn)行測(cè)序,在C5L2基因位于第2外顯子區(qū)檢測(cè)到兩個(gè)新的突變位點(diǎn)和C5aR1基因1個(gè)新的突變位點(diǎn)。
(2) C5L2基因新的突變位點(diǎn)597G
12、>A多態(tài)性與新疆維吾爾族冠心病發(fā)生有關(guān)聯(lián),rs2972607在漢族和維吾爾族人群中均與冠心病具有相關(guān)性,rs8112962在漢族人群中與冠心病具有相關(guān)性。
(3) C5aR1基因547G>A與新疆漢族和維吾爾族冠心病的發(fā)病具有相關(guān)性。rs10853784位點(diǎn)多態(tài)性與新疆地區(qū)漢族人群冠心病的發(fā)病存在一定的關(guān)聯(lián)性;在漢族人群中A-C-T單體型是冠心病發(fā)病的保護(hù)因素,A-T-C單體型是冠心病發(fā)病的危險(xiǎn)因素,在維吾爾族人群中,A-C-
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