基于轉(zhuǎn)錄組測序的綠僵菌MaCdc42調(diào)控機(jī)制解析.pdf

1、綠僵菌（Metarhizium acridum）是一種數(shù)量較多的侵染性昆蟲病原真菌，具有很強(qiáng)的致病力。前期研究可知綠僵菌中類Cdc42基因被命名為MaCdc42（Metarhizium acridum Cdc42），屬于Rho家族蛋白基因。MaCdc42基因與綠僵菌的極性生長、抗逆機(jī)制和致病性密切相關(guān)。為明確MaCdc42調(diào)控機(jī)制，本研究對敲出MaCdc42基因綠僵菌菌株（△MaCdc42）進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序。分析綠僵菌 MaCdc42缺失

2、所引起的基因表達(dá)變化，以揭示 MaCdc42的相關(guān)調(diào)控機(jī)制。研究結(jié)果如下：
　　1.轉(zhuǎn)錄組測序野生型（WT）菌株的Clean Reads為45298174條，拼接后得到9316個基因；MaCdc42突變體的Clean Reads為45920260條，拼接后得到9339個基因。
　　2. MaCdc42基因敲除導(dǎo)致1512個基因的mRNA表達(dá)水平發(fā)生變化，表達(dá)量相對上調(diào)的基因為855個，相對下調(diào)的基因為657個，上調(diào)基因數(shù)較多

3、。在差異表達(dá)基因中變化倍數(shù)在32倍以上的基因中，大多包含一些未知功能的假設(shè)蛋白基因，例如假設(shè)蛋白 MAC_03232（hypothetical protein MAC_03232）假設(shè)蛋白 MAC_06508基因、假設(shè)蛋白MAC_04956基因等，為后續(xù)研究提供一定新的數(shù)據(jù)基礎(chǔ)。
　　3. GO分析結(jié)果顯示MaCdc42的調(diào)控相關(guān)的差異基因共622個得到注釋，其中47％（293個）注釋到氧化還原酶活性、水解酶活性、鐵離子結(jié)合等分子

4、功能，38%（236個）注釋到定位、陰離子運(yùn)輸?shù)壬镞^程，15%（93個）注釋到膜、膜的固有成分、膜組分等細(xì)胞組分。MaCdc42基因的敲出與綠僵菌的生長發(fā)育，細(xì)胞骨架形成具有十分重要的調(diào)控作用。
　　4. KEGG Pathway分析表明，MaCdc42基因敲除所引起的差異表達(dá)基因中，共有935個差異表達(dá)基因富集于117個生理生化條目；MaCdc42基因敲除影響 MAPK-yest信號通路通路改變，通路上18基因表達(dá)出現(xiàn)差異，其