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文檔簡介
1、人卵巢上皮性癌(Epithelial ovarian cancer, EOC,以下簡稱卵巢癌)起源于人卵巢表面上皮(ovarian surface epithelium,OSE)。本課題首先從經(jīng)典Wnt信號通路成分Wnt-1和β-catenin入手,檢測其mRNA與蛋白在卵巢癌中的表達情況,以明確在卵巢癌中是否存在Wnt信號通路的異常激活,并同時檢測間皮素基因的表達,分析二者的相關(guān)性,初步探討卵巢癌中Wnt/β-catenin信號通路調(diào)
2、控間皮素表達的可能性。進一步以SKOV-3細胞為例,探討用LiCl和Wnt-3a重組蛋白處理SKOV-3細胞模擬激活Wnt/β-catenin信號通路后,和用β-catenin靶向的RNAi慢病毒阻斷Wnt/β-catenin信號通路后,間皮素基因的表達變化,以明確在體外Wnt/β-catenin信號通路是否對間皮素的表達有調(diào)控作用。最后,我們深入探討了Wnt/β-catenin信號通路調(diào)控間皮素基因的機制,通過生物信息學預測分析間皮素
3、基因的5'調(diào)控區(qū)及可能存在的調(diào)控元件,以雙熒光酶報告基因系統(tǒng)檢測間皮素基因啟動子區(qū)的核心區(qū)域,并用電遷移率改變分析實驗驗證所預測的調(diào)控元件的作用,闡明Wnt/β-catenin信號通調(diào)控間皮素基因表達的具體機制。本文主要從以下幾部分展開論述:
第一部分 Wnt/β-catenin信號通路成分與間皮素在卵巢上皮性癌組織中的表達及相關(guān)性
目的:探討卵巢上皮性癌組織中Wnt/β-catenin信號通路成分Wnt-1和β-c
4、atenin與間皮素基因的表達,并分析其相關(guān)性。
方法:用real-time PCR方法檢測31例卵巢上皮性癌組織、20例良性卵巢上皮性腫瘤和10例正常卵巢上皮中經(jīng)典Wnt信號通路成分Wnt-1和β-catenin基因和間皮素基因的mRNA的表達,并分析其在轉(zhuǎn)錄環(huán)節(jié)的相關(guān)性。
用免疫組化EliVison法檢測57例上皮性卵巢癌組織、20例良性卵巢上皮性腫瘤和16例正常卵巢上皮中Wnt-1、β-catenin基因和間皮
5、素的蛋白表達;分析三者在不同組織類型、手術(shù)-病理分期間表達;分析間皮素與Wnt信號通路異常的相關(guān)性。
結(jié)果:
1.卵巢癌組織中Wnt-1 mRNA的表達:Wnt-1 mRNA在卵巢癌組織中陽性表達率為22.6%(7/31),陽性標本中相對表達量為0.64±0.06。卵巢良性腫瘤中有15%(3/20)為Wnt-1陽性表達,相對表達量為0.47±0.04。正常卵巢上皮組織中未檢測出Wnt-1 mRNA表達(0/10)。卵
6、巢癌與良性卵巢腫瘤間Wnt-1 mRNA陽性率無差異(x2=0.443,P>0.05)。卵巢癌與卵巢良性腫瘤間Wnt-1 mRNA陽性者表達量無差異(t=4.324,P>0.05)。因卵巢癌中Wnt-1 mRNA陽性表達例數(shù)較少,未在不同病理類型及病理分期間比較。
2.卵巢癌組織中β-cateninmRNA的表達:β-catenin mRNA表達于所有的組織標本。卵巢癌中β-catenin mRNA的相對表達量為0.77±0.
7、46,卵巢良性腫瘤中為0.70±0.46,卵巢上皮組織中相對表達量為0.71±0.45,除透明細胞癌因例數(shù)少未參加統(tǒng)計外,β-catenin在漿液性、粘液性和子宮內(nèi)膜樣癌間表達無差異(F=0.55,P>0.05)。不同病理分期間Ⅲ~Ⅳ期β-catenin mRNA相對表達量為0.96±0.06,高于Ⅰ~Ⅱ期的相對表達量0.70±0.03(t=-0.189,P<0.05)。
3.卵巢癌組織中間皮素基因mRNA表達。
4
8、.Wnt-1蛋白在卵巢癌組織中表達。
5.β-catenin在卵巢癌組織中異位表達。
6.間皮素蛋白在卵巢癌組織中表達。
7.間皮素蛋白表達與Wnt-1/β-catenin通路異常的相關(guān)性。
結(jié)論:上皮性卵巢癌中存在Wnt/β-catenin信號通路成分和間皮素的異常表達;經(jīng)典Wnt/β-catenin通路異常和間皮素表達與高手術(shù)-病理分期相關(guān);在上皮性卵巢癌中間皮素表達與經(jīng)典Wnt/β-cate
9、nin通路異常有關(guān)。
第二部分 SKOV-3細胞中Wnt/β-catenin信號通路對間皮素基因表達的調(diào)控
目的:通過體外實驗,觀察卵巢癌細胞系SKOV-3中分別激活與抑制經(jīng)典Wnt/β-catenin信號通路后,間皮素基因的表達變化,以揭示經(jīng)典Wnt/β-catenin信號通路對間皮素基因表達有無實際調(diào)控作用。
方法:
1.檢測卵巢癌細胞SKOV-3中間皮素基因的基礎表達水平。
2.L
10、iCl和Wnt-3a處理SKOV3細胞,KCl和正常培養(yǎng)基處理為對照,檢測β-catenin的表達情況。評估LiCl和Wnt-3a激活Wnt/β-catenin信號通路的細胞模型。
3.構(gòu)建針對β-catenin基因的RNAi慢病毒,空載體慢病毒為對照,轉(zhuǎn)染SKOV3細胞后,觀察其對Wnt信號通路的干擾效果。
4.Real-time PCR和westem blot方法分別檢測激活與阻斷Wnt/β-catenin信號通
11、路后間皮素基因的mRNA和蛋白水平的表達變化。
結(jié)論:在SKOV-3細胞中,經(jīng)典Wnt/β-catenin信號通路對間皮素基因的表達有調(diào)控作用,激活該信號通路可的上調(diào)間皮素基因的表達,但阻斷β-catenin不能有效下調(diào)間皮素基因的表達。
第三部分 人間皮素基因5'調(diào)控區(qū)生物信息學分析及相關(guān)調(diào)控元件初步鑒定
目的:生物信息學方法利用各種生物信息數(shù)據(jù)庫分析間皮素基因5'調(diào)控區(qū)相關(guān)信息,預測并實驗驗證間皮素基因
12、的核心啟動子區(qū);預測并實驗驗證調(diào)控間皮素基因啟動子區(qū)Wnt/β-catenin信號通路相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點,分析Wnt信號調(diào)控間皮素表達的方式。
方法:
1.綜合間皮素基因更新信息。
2.結(jié)合間皮素基因啟動子區(qū)及轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點位置的不同,構(gòu)建不同長度間皮素啟動子序列報告基因載體,轉(zhuǎn)染卵巢癌SKOV-3及3AO細胞系,用雙熒光酶報告基因系統(tǒng)檢測不同長度啟動子區(qū)活性,分析相應區(qū)域在間皮素轉(zhuǎn)錄調(diào)控中的作用。
13、r> 3.電泳遷移率改變分析試驗(electrophoretic mobility shift assay,EMSA)驗證預測轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合點的作用。
結(jié)果:
1.與原有認為轉(zhuǎn)錄本1(GenBank accession:NM_005823)編碼MPF,轉(zhuǎn)錄本2(NM_013404)編碼間皮素,轉(zhuǎn)錄本2和1相比在N端序列存在差異,這種差異有可能來自測序錯誤;轉(zhuǎn)錄本3(AF180951)為間皮素cDNA部分序列,且C端插
14、入82bp的認識不同,間皮素基因轉(zhuǎn)錄本信息已更新為:轉(zhuǎn)錄本1和3均轉(zhuǎn)錄間皮素前體蛋白亞型1,轉(zhuǎn)錄本2轉(zhuǎn)錄前體蛋白亞型2。前體蛋白亞型1和2均可加工為間皮素前體蛋白,后者被剪切為MPF與間皮素。
2.以間皮素基因翻譯起始密碼子記作+1,以上游-4Kb序列在Blast N程序內(nèi)進行對比分析,顯示間皮素基因5'端序列對應EST集中在-1900~-1850左右和-1500~1430左右區(qū)域。4Kb序列對應可翻譯為蛋白質(zhì)區(qū)位于約-270
15、0~-4000區(qū)域內(nèi),與EST區(qū)無重復,說明對應的EST序列可能為5'UTR。
3.取間皮素轉(zhuǎn)錄本2上游2Kb(-1608~-3608)序列分析可能的TCF/LEF轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點,發(fā)現(xiàn)一個LEF-1結(jié)合位點,位于-3036~-3029,和一個TCF-4結(jié)合位點位于-1935~-1926,后者位于所預測啟動子區(qū)內(nèi)。
4.結(jié)合所預測的啟動子及轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點位置,構(gòu)建含遠端LEF-1結(jié)合位點及TCF-4結(jié)合位點的預測啟
16、動子區(qū)的1764bp(-3371~-1607)片段;僅含TCF-4位點的預測啟動子區(qū)的472bp(-2079~-1607)片段;LEF-1與TCF-4結(jié)合位點均不包含的預測啟動子區(qū)的261bp(-1868~-1607)片段。測序結(jié)果顯示構(gòu)建正確。
5.電泳遷移率改變分析顯示熒光標記的TCF-4探針能與核蛋白形成復合物,而突變型探針則不能,200倍未標記的競爭探針能競爭掉生物素標記的探針與核蛋白的結(jié)合,200倍未標記的突變探針則
17、不能。且標記探針能與重組TCF-4蛋白結(jié)合。
結(jié)論:
1.間皮素基因更新的RefSeg序列已更正了以前轉(zhuǎn)錄本2、3存在的測序誤差。轉(zhuǎn)錄本1和3均轉(zhuǎn)錄間皮素前體蛋白亞型1,轉(zhuǎn)錄本2轉(zhuǎn)錄前體蛋白亞型2。間皮素前體蛋白亞型1和2均可編碼間皮素前體蛋白。
2.生物信息學綜合分析顯示,間皮素基因啟動子區(qū)可能位于2835~-1668區(qū)域。間皮素基因5'調(diào)控區(qū)內(nèi)有兩個可能的TCF/LEF轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點:一個LEF-1結(jié)
18、合位點,位于-3036~-3029,一個TCF-4結(jié)合位點位于-1935~-1926,位于所預測啟動子區(qū)內(nèi)。
3.結(jié)合啟動子區(qū)及TCF/LEF轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點位置設計、構(gòu)建了不同長度的啟動子片段,轉(zhuǎn)染卵巢癌細胞后,經(jīng)雙熒光酶報告系統(tǒng)檢測,鑒定了一個包含TCF-4結(jié)合位點的211bp間皮素核心啟動子區(qū)。
4.EMSA實驗對核心啟動子區(qū)內(nèi)預測的TCF-4結(jié)合位點進行了驗證,證明這一位點是調(diào)控間皮素基因表達的順式作用元件,
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