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文檔簡介
1、背景與目的:
哮喘是當(dāng)今世界最常見的慢性疾病之一。近20年來,哮喘發(fā)病率和死亡率持續(xù)增加,目前仍以每10年20%~50%的比例增長。哮喘是一種氣道慢性炎癥性疾病,其發(fā)生與發(fā)展主要由遺傳因素與環(huán)境因素相互作用的結(jié)果,遺傳因素對哮喘的相對作用為36~79%。目前國內(nèi)、外學(xué)者通過對人群哮喘相關(guān)基因篩選定位及其多態(tài)性的研究,結(jié)果發(fā)現(xiàn)與人類哮喘有關(guān)的候選基因有261個,分布在22對常染色體和1對性染色體上,涉及的基因及單核苷酸多態(tài)性(S
2、NPs)眾多,國內(nèi)外對相關(guān)基因的研究結(jié)果多有不一。Moffatt等人發(fā)表于自然期刊(Nature)的哮喘基因組相關(guān)研究(genome-wide associaton,GWAS)發(fā)現(xiàn)血清類粘蛋白1樣蛋白3(ORMDL3)基因是哮喘的易感基因,rs7216389基因型的多型性(polymorphism)與兒童哮喘的發(fā)作有關(guān)。目前國內(nèi)關(guān)于該基因位點單核苷酸多態(tài)性(single-nucleotide polymorphism,SNP)的相關(guān)研究
3、報道較少,迄今未見寧波地區(qū)的相關(guān)報道。
本項目擬采用聚合酶鏈反應(yīng)以及DNA測序方法,分析寧波地區(qū)哮喘兒童ORMDL3基因的SNPs,以期能夠明確該基因與寧波地區(qū)兒童哮喘發(fā)病的關(guān)聯(lián)性。主要是ORMDL3基因中rs7216389、rs4378650以及rs11650680位點SNPs與寧波地區(qū)兒童哮喘發(fā)病的關(guān)聯(lián)性。希望能夠進(jìn)一步推動寧波地區(qū)兒童哮喘的防治。
材料與方法:
從2011年10月到2012年10月共收
4、集在寧波市北侖區(qū)人民醫(yī)院就診的兒童哮喘患者150例,符合《2008中國兒童哮喘指南》臨床診斷標(biāo)準(zhǔn),包括初次診斷以及復(fù)診病例,均為寧波本地人口。其中男性82例,女性68例,平均年齡6.6±1.7歲。同期收集當(dāng)時在寧波北侖區(qū)人民醫(yī)院住院的非呼吸道疾病患兒,排除既往有反復(fù)咳嗽、喘息病史的患兒,均為寧波本地人口,作為對照組,共150例,其中男性80例,女性70例,平均年齡7.5±1.3歲。由監(jiān)護(hù)人簽署知情同意書,并報告醫(yī)院倫理委員會備案。采集血
5、液標(biāo)本,應(yīng)用DNA抽提試劑盒提取實驗對象的基因組,采用聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)技術(shù)以及DNA測序方法對150例兒童哮喘患者ORMDL3基因多態(tài)性進(jìn)行觀察,并與150例對照組進(jìn)行對比。對兩組ORMDL3基因中rs7216389、rs4378650以及rs11650680位點等位基因頻率、基因型以及等位基因分布頻率進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析比較。
本研究主要采用SPSS13.0軟件進(jìn)行分析。按照Hardy-Weiberg平衡法檢測樣本的群體代表
6、性。組間基因型及等位基因頻率等技術(shù)資料采用卡方檢驗,P<0.05為統(tǒng)計學(xué)有差異。
結(jié)果:
1.哮喘組和對照組之間的性別、年齡無統(tǒng)計學(xué)差異,具有可比性。
2.哮喘組和對照組之間ORMDL3基因中rs7216389位存在三種基因型,即TT, TC和CC。ORMDL3基因rs7216389位點各基因型頻率在哮喘組和對照組相比,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),ORMDL3基因rs7216389位點
7、C和T等位基因分布頻率存在顯著性差異(P<0.05)。
3.哮喘組和對照組之間ORMDL3基因中rs4378650位點存在三種基因型TT, TC,CC,哮喘組合對照組相比,ORMDL3基因rs4378650位點基因型分布頻率存在統(tǒng)計學(xué)差異(P<0.05)。并且此位點等位基因C和T的分布頻率存在顯著性差異(P<0.05)。
4.哮喘組和對照組之間ORMDL3基因中rs11650680位均存在TT, TC和CC三種基因型
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