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文檔簡介
1、家蠶二分濃核病毒(Bombyx mori bidensovirus,BmBDV)歸屬于新設(shè)定的二分DNA病毒科,是一類小的動物二分DNA病毒。該病毒與家蠶濃核病毒Ⅰ型相似,病毒粒子為二十面體非囊膜包裹結(jié)構(gòu),主要感染家蠶的中腸柱狀上皮細(xì)胞,并引發(fā)家蠶濃核癥。感染的幼蟲主要表現(xiàn)為厭食、空頭和下痢等癥狀。而且在感染晚期幼蟲的中腸后部顏色變?yōu)榈S色,蠶沙成串珠狀。BmBDV基因組包括兩個節(jié)段的單鏈DNA分子6.6kb(VD1)和6.0kb(VD
2、2),獨立包裝于衣殼中。VD2含有兩個ORF,分別編碼非結(jié)構(gòu)蛋白NS3及次要結(jié)構(gòu)蛋白P133,目前針對VD2啟動子活性及其基因表達調(diào)控的相關(guān)研究還未見報道,而這些工作對于全面了解BmBDV基因表達調(diào)控有著重要的意義。
P133基因5'端非編碼區(qū)UTR長度為666nt,包括524nt的基因組末端重復(fù)序列(ITR)。生物信息學(xué)分析表明,假定的轉(zhuǎn)錄起始基序Inr(TAGT)和TATA-box分別位于P133蛋白基因起始密碼子上游-8
3、nt和-33nt。在ITR區(qū)域內(nèi)還存在其他啟動子特征性序列CAAT-box、GC-box等。根據(jù)TATA-box及編碼P133的ORF的位置,p133基因的啟動子位于VD2遺傳圖距單位89位置,因此將調(diào)控p133基因表達的啟動子稱為P89。
為了分析P89的啟動活性,我們克隆了p133基因5'端非編碼區(qū)666bp的序列。將啟動子序列插入到pGL3-Basic構(gòu)建啟動子報告質(zhì)粒,并利用雙螢光素酶報告系統(tǒng)分析其啟動子活性。結(jié)果顯示
4、,P89能在昆蟲細(xì)胞Sf9、BmE、BmN和Hi5中啟動螢光素酶的表達,在Hi5細(xì)胞中P89活性高于在其他幾種細(xì)胞系中的活性。參考生物信息學(xué)分析結(jié)果,構(gòu)建了一系列含不同截短片段的重組質(zhì)粒,并通過螢光素酶活性檢測來分析活性。熒光分析的結(jié)果表明,TATA-box是維持P89基礎(chǔ)活性的必須元件;TATA-box上游存在一個沉默子元件,缺失起始密碼子上游-268nt~-195nt區(qū)域,P89活性提高至基礎(chǔ)活性的7.15倍;然而,繼續(xù)缺失至-14
5、3nt,P89活性又恢復(fù)到基礎(chǔ)活性,說明-195nt至-143nt區(qū)域賦予P89較高的啟動子活性。為了查明BmBDV編碼的非結(jié)構(gòu)蛋白是否調(diào)控P89的活性,構(gòu)建了非結(jié)構(gòu)蛋白NS1、NS2以及NS3的瞬時表達質(zhì)粒,與pGL3-P89以及內(nèi)參海參熒光素酶表達質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染。蛋白的表達通過Western blotting確定。結(jié)果表明NS1和NS2可以反式激活啟動子,分別使P89活性提高了15.5%和69.9%。本研究還比較分析了BmBDV所有基因
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