豬TLR4基因多態(tài)性及與其斷奶仔豬免疫指標(biāo)的關(guān)聯(lián)分析.pdf

1、本研究以皖南黑豬、安慶六白豬、圩豬、霍壽黑豬四個(gè)安徽地方品種及一個(gè)外來品種長白豬為材料，采用PCR-SSCP技術(shù)篩查 TLR4基因第三外顯子部分片段的單鏈核苷酸多態(tài)性（SNP），并通過 SPSS軟件分析所檢測到的SNP在安慶六白豬、圩豬、霍壽黑豬、大白豬四個(gè)品種中的多態(tài)性與斷奶仔豬部分免疫指標(biāo)的相關(guān)性，從而為尋找與豬抗病性狀相關(guān)的有效遺傳標(biāo)記奠定基礎(chǔ)，為安徽地方豬抗病育種提供理論依據(jù)。經(jīng)研究發(fā)現(xiàn)：
　?。?）檢測皖南黑豬，安慶六白

2、豬，圩豬，霍壽黑豬，長白豬5個(gè)群體的TLR4基因多態(tài)性，發(fā)現(xiàn)了位于 TLR4基因外顯子3上的3個(gè)SNPs，分別是G417A，C318A，C1027A。
　　（2）群體遺傳學(xué)分析表明 C318A位點(diǎn)，在皖南黑豬、圩豬、安慶六白豬均檢測到CC、CA兩種基因型，在皖南黑豬中的基因型頻率分別為80.95％、19.05%，在圩豬中的基因型頻率分別為70.00%、30.00%，在安慶六白豬中的基因型頻率分別為82.50%、17.50%。其中C

3、C基因型為該3個(gè)群體中優(yōu)勢基因型，AA基因型均未檢測到。該位點(diǎn)在3個(gè)群體中PIC值分別為0.1575、0.2225、0.1469，均處于低度多態(tài)；且經(jīng)過χ2適合性檢驗(yàn)，3個(gè)群體的χ2值均小于5.991，處于哈迪-溫伯格平衡狀態(tài)(P>0.05)。該位點(diǎn)在霍壽黑豬和長白豬群體中均未檢測到突變。
　　G417A位點(diǎn)，在皖南黑豬、圩豬、安慶六白豬檢測到 GG、GA兩種基因型，其中在皖南黑豬中的基因型頻率分別為80.95%、19.05%；在

4、圩豬中的基因型頻率分別為70.00%、30.00%；在安慶六白豬中的基因型頻率分別為82.50%、17.50%，GG基因型為該3個(gè)群體中優(yōu)勢基因型，AA基因型均未檢測到。該位點(diǎn)在3個(gè)群體中PIC值分別為0.1575、0.2225、0.1469，均處于低度多態(tài)；且經(jīng)過χ2適合性檢驗(yàn)，3個(gè)群體的χ2值均小于5.991，處于哈迪-溫伯格平衡狀態(tài)(P>0.05)。該位點(diǎn)在霍壽黑豬和長白豬群體中均未檢測到突變。
　　C1027A位點(diǎn)，在五個(gè)

5、豬群中均檢測到 CC、CA、AA三種基因型，其中在皖南黑豬中的基因型頻率分別為23.81%、52.38%、23.81%；在圩豬中的基因型頻率分別為40.00%、35.00%、25.00%；在安慶六白豬中的基因型頻率分別為27.50%、45.00%、27.50%；在霍壽黑豬中的基因型頻率分別為6.98%、65.12%、27.91%；在長白豬中的基因型頻率分別為59.09%、27.27%、13.64%。該位點(diǎn)在5個(gè)群體中的PIC值分別為0.

6、3750、0.3693、0.3750、0.3683、0.3180，均處于中度多態(tài)；且經(jīng)過χ2適合性檢驗(yàn)，5個(gè)群體的χ2值均小于5.991，處于哈迪-溫伯格平衡狀態(tài)(P>0.05)。
　?。?）血液免疫指標(biāo)在群體間的差異分析：
　　本試驗(yàn)采用酶聯(lián)免疫分析試劑盒測定了對(duì)安慶六白豬，圩豬，霍壽黑豬，大白豬四個(gè)豬種斷奶仔豬的白介素-6（IL-6）、白介素-10（IL-10）、白介素-12（IL-12）、γ干擾素（IFN-γ）、腫瘤壞

7、死因子α（TNF-α））五個(gè)免疫指標(biāo)，結(jié)果顯示各免疫指標(biāo)水平在不同豬種間差異較大，除 IL-6水平及 IL-10水平在圩豬和大白豬中差異不顯著、IL-12水平在霍壽黑豬和大白豬中差異不顯著外，其它各免疫指標(biāo)品種間的差異均為極顯著（P<0.01）。
　?。?）與免疫指標(biāo)的關(guān)聯(lián)分析：
　　本試驗(yàn)分別分析了 C1027A位點(diǎn)和 G417A位點(diǎn)多態(tài)性與安慶六白豬，圩豬，霍壽黑豬，大白豬四個(gè)豬種斷奶仔豬的五個(gè)免疫指標(biāo)（IL-6、IL-