TLR2和TLR4基因多態(tài)性與中國(guó)漢族人群真菌性角膜炎的相關(guān)性研究.pdf

1、T L R 2 和T L R 4 基因多態(tài)性與中國(guó)漢族人群真菌性角膜炎的相關(guān)性研究摘要目的探討T L R 2 和T L R 4 基因多態(tài)性與中國(guó)漢族人群真菌性角膜炎是否相關(guān)。方法選取2 0 1 0 年1 月至2 0 1 2 年1 1 月就診于我院的真菌性角膜炎患者1 0 9例( 病例組) 和1 6 0 例健康人( 對(duì)照組) ，分別選擇T L R 2 基因的r s 3 8 4 0 0 9 7 、r s 3 8 0 4 0 9 9 、r s

2、 2 0 8 3 2 8 7 、r s l 8 9 8 8 3 0 及T L R 4 基因的T S 4 5 4 7 8 7 9 3 、E S l 0 9 8 3 7 5 5和r s l 9 2 7 9 1 4 七個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)，采用P C R 產(chǎn)物直接測(cè)序法對(duì)這七個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行基因分型，檢測(cè)其基因型及等位基因頻率，比較不同基因型在病例組和正常對(duì)照組的分布差異，分析中國(guó)漢族人群真菌性角膜炎與T L R 2 、T L R 4 基因的多態(tài)性是否相關(guān)

3、。結(jié)果在中國(guó)漢族人群T L R 4 基因中，病例組r s l 0 9 8 3 7 5 5位點(diǎn)突變型等位基因( A 等位基因) 頻率明顯高于對(duì)照組( 3 2 ．1 1 ％：2 2 ．1 9 ％，P - - O ．0 1 ) ，^ 等位基因構(gòu)成的A A + A G 基因型在病例組中頻率明顯高于對(duì)照組( 5 4 ．1 3 ％：3 6 ．2 5 ％，P = O ．0 0 4 ) ，且使真菌性角膜炎的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)增加2 ．0 7 5 倍( O R =

4、 2 ．0 7 5 ，9 5 ％C I = 1 ．2 6 4 —3 ．4 0 7 ) 。單倍型分析顯示，包含r s l 0 9 8 3 7 5 5 突變型A 等位基因的單體型在病例組中頻率明顯高于對(duì)照組，與真菌性角膜炎的發(fā)病密切相關(guān)( 3 2 ．1 ％：2 0 ．9 ％，P = O ．0 0 3 ) 。T L R 2 基因各位點(diǎn)基因型及等位基因頻率在病例組及對(duì)照組中無(wú)明顯差異( P > 0 ．0 5 ) 。結(jié)論T L R 4 基因

5、的r s l 0 9 8 3 7 5 5 位點(diǎn)多態(tài)性與中國(guó)漢族人群真菌性角膜炎的發(fā)病密切相關(guān)，而T L R 2 基因的各位點(diǎn)多態(tài)性與中國(guó)漢族人群真菌性角膜炎的發(fā)病無(wú)明顯相關(guān)性。碩士研究生 王楠( 眼科學(xué))指導(dǎo)教師 趙桂秋教授關(guān)鍵詞：T L R 2 ；T L R 4 ；真菌性角膜炎；基因多態(tài)性目錄引言???????????????????????????????????????????1第l 章材料與方法?????????????????

6、??????????- 31 ．1 實(shí)驗(yàn)材料??????????????????????????????·31 ．1 ．1 實(shí)驗(yàn)對(duì)象?????????????????????????????31 ．1 ．2 實(shí)驗(yàn)主要儀器與設(shè)備????????????????????????31 ．1 ．3 實(shí)驗(yàn)主要試劑及耗材????????????????????????41 ．2 實(shí)驗(yàn)方法??????????????????????????

7、????41 ．2 ．1 外周血基因組D N A 的提取??????????????????????41 ．2 ．2 T o t a l D N A 含量及純度測(cè)定?????????????????????- 51 ．2 ．3 聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)( P C R ) ??????????????????????”51 ．2 ．4 瓊脂糖凝膠電泳??????????????????????????·61 ．2 ．5 目的片段D N A

8、 測(cè)序?????????????????????????·71 ．2 ．6 序列的比對(duì)分析??????????????????????????71 ．2 ．7 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析????????????????????????????7第2 章結(jié)果??????????????????????????????·82 ．1 S N P 位點(diǎn)H a r d y —w e n b e r g 平衡檢驗(yàn)及連鎖分析???????????

9、???·82 ．2 真菌性角膜炎病例組和對(duì)照組等位基因及基因型頻率???????????·82 ．3 真菌性角膜炎患者輕度、中度、重度組等位基因及基因型頻率???????1 02 ，4 真菌性角膜炎病例組組和對(duì)照組單倍型分析???????????????1 2第3 章討論??????????????????????????????1 3結(jié)論???????????????????????????????????????

10、?????··1 6參考文獻(xiàn)???????????????????????????????·1 7綜述????????????????????????????????????2 0綜述的參考文獻(xiàn)????????????????????????????- 2 8攻讀學(xué)位期問(wèn)的研究成果????????????????????????3 3附圖?????????????????????????????????．．