福瑞鯉8個家系的TRAP分析.pdf

1、福瑞鯉(FFRC strain common carp，Cyprinus carpio)是近幾年經(jīng)人工培育獲得的鯉魚新品種，因具有體型好、生長速度快、飼料轉(zhuǎn)化率高、適應(yīng)能力強(qiáng)、耐性好以及遺傳穩(wěn)定等優(yōu)點(diǎn)而深受廣大養(yǎng)殖者的喜愛，推廣面積不斷擴(kuò)大，在主要淡水養(yǎng)殖魚類中的地位也越來越重要。作為一種鯉魚新品種，需要不斷地對其進(jìn)行遺傳保護(hù)和選育保種，并在原有的基礎(chǔ)上通過遺傳改良使該品種得到新的提高。靶位區(qū)域擴(kuò)增多態(tài)性(target region a

2、mplified polymorphism，TRAP)是由Hu等提出來的一種新型分子標(biāo)記技術(shù)，通過在大量農(nóng)作物上的應(yīng)用發(fā)現(xiàn)TRAP具有簡單、高效、重復(fù)性好、易測序等優(yōu)點(diǎn)，故TRAP自開發(fā)以來得到了廣泛的關(guān)注。本研究分別從表型水平和分子水平上對8個福瑞鯉家系進(jìn)行分析，為福瑞鯉選育保種和遺傳改良工作提供了形態(tài)學(xué)和遺傳學(xué)方面的依據(jù)。同時，進(jìn)一步篩選跟福瑞鯉生長相關(guān)的TRAP標(biāo)記，為開發(fā)和利用福瑞鯉分子標(biāo)記輔助育種奠定了一定的理論基礎(chǔ)。

3、　　首先，利用相關(guān)分析、通徑分析和多元回歸分析方法對福瑞鯉生長速度差異群體不同養(yǎng)殖時間的體型性狀進(jìn)行分析。相關(guān)性分析表明:80天時，與體質(zhì)量相關(guān)性最大的形態(tài)性狀在生長速度慢的家系傾向于是體高而在生長速度快的家系中則是體厚;234天時，各家系形態(tài)性狀與體質(zhì)量的相關(guān)性趨于一致，均為體長＞體高＞體厚。8個家系不同日齡形態(tài)性狀的通徑分析結(jié)果顯示，體長、體厚以及體高對體質(zhì)量的直接作用均達(dá)到了極顯著的水平。80天時，生長速度慢家系對體質(zhì)量的直接作用

4、最大的是體長而生長速度快的家系為體厚;234天時，8個家系對體質(zhì)量直接作用最大的均為體長。對不同日齡的各家系進(jìn)行回歸分析表明，各家系在不同日齡的相關(guān)指數(shù)R2均大于0.85，回歸關(guān)系均達(dá)到了極顯著水平(P＜0.01)，說明在福瑞鯉中體長、體厚、體高均是影響體質(zhì)量的主要性狀。
　　在分子水平上，利用TRAP分子標(biāo)記對生長速度差異(4個生長速度快，4個生長速度慢)的家系進(jìn)行了遺傳多樣性分析。結(jié)果顯示:8個家系的多態(tài)性條帶在9.41～12

5、.00之間，多態(tài)性比率范圍為52.04％～66.02％，多態(tài)信息含量為0.19～0.24，Nei遺傳多樣指數(shù)和Shannon信息指數(shù)分別介于0.19～0.24和0.28～0.35之間，其中家系85＃的各遺傳參數(shù)值最高，而家系74＃的最低，且生長速度慢的四個家系51＃、56＃、74＃、85＃遺傳多樣性參數(shù)的均值與生長速度快的四個家系26＃、35＃、89＃、92＃的均值之間并沒有明顯差異。家系間的遺傳分化指數(shù)（Fst）及分子變異方差(AMO

6、VA)分析顯示，除了家系56＃與92＃(Fst=0.0516)及51＃與89＃(Fst=0.0956)這2對家系間處于中等程度的遺傳分化(0.05≤Fst≤0.15)之外，其他家系間遺傳分化水平均較低（Fst＜0.05），群體的總遺傳變異主要來源于家系內(nèi)個體間的遺傳差異，其方差分量的貢獻(xiàn)率達(dá)98.3％。遺傳距離分析結(jié)果表明，家系26＃與92＃的遺傳距離最大，家系85＃與89＃的遺傳距離最小;基于此的UPGMA聚類分析顯示，56＃家系與7

7、4＃家系以及85＃家系與89＃家系的親緣關(guān)系比較近，聚類在同一分支上，而其他家系親緣關(guān)系相對較遠(yuǎn)。研究表明8個福瑞鯉家系內(nèi)遺傳變異較大，遺傳多樣性水平較高，具有一定的育種潛力，可擴(kuò)大福瑞鯉的選育空間。
　　最后，對福瑞鯉跟生長性狀相關(guān)的TRAP分子標(biāo)記進(jìn)行關(guān)聯(lián)性分析，在生長速度慢的群體當(dāng)中發(fā)現(xiàn)引物組合IGF2a-1-Trap13-240、IGF2a-1-odd26-750與體重、體長和體高都相關(guān);在生長速度快的群體當(dāng)中除了IGF2