基于調和函數尋找AD候選基因.pdf

1、阿爾茨海默病(Alzheimer disease，AD)是癡呆癥中最常見的一種，它的發(fā)病率在逐年上升存活率卻在逐年下降。然而至今，其復雜的發(fā)病機制仍不為人知，并且也沒有找到治療AD的有效措施，但是多次研究證明AD與基因有關，因此目前已有6個基因被證實與AD相關，它們是APOE、PSEN1、PSEN2和APP基因等。為找到更多的與AD有關的基因，從根本上找到治療AD的有效辦法，研究者們開始利用基因芯片獲取基因表達數據用以研究AD。AD病是

2、由多個基因控制的疾病，要從這些數據里提取有用的信息比較困難，為了解決這一問題，越來越多研究者設計不同算法尋找候選基因。目前的算法大多數只是對不同生病程度下的數據進行差異化對比，從而找出可能與AD病相關的基因，但是這些方法的缺點是數據挖掘不完善。為了克服這個問題，本文根據AD病可能與基因表達水平過度失衡有關的思想，利用正態(tài)分布函數和以基因與基因之間的歐式距離為自變量構造出反映基因相關性的調和函數，從而計算出各基因與周圍基因的相關性表達值。

3、這樣就能避免直接把基因表達數據直接進行對比，數據挖掘更完善。通過這一算法分析基因相關性數據表達值，對比在四種不同情況下基因相關性表達值變化情況。尋找出相關性變化最劇烈的基因作為識別出來的候選基因。文章最后識別出68個相關性變化最劇烈的基因基因。由于這些基因相關性表達值變化過于劇烈，因此這一部分基因很有可能與AD有直接或間接的關系。其中APOE是其中的一個，這個基因已經被證實是AD病基因;cnr1基因在其他有關文章中提到該基因與AD病有關