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文檔簡介
1、研究背景:
順鉑是非小細胞肺癌(NSCLC)最主要的化療藥物,但易產生耐藥性,如何改變NSCLC耐藥性及耐藥逆轉機制研究是當前的熱點之一。我們前期研究表明,5-氮-2'-脫氧胞苷(5-Aza-dc)可逆轉NSCLC細胞的順鉑耐藥性,但具體機制不明。最近研究顯示,microRNA(miRNA)與腫瘤順鉑耐藥相關,而5-Aza-dc可影響腫瘤細胞的miRNA表達譜。因而我們推測:miRNA可能在5-Aza-dc誘導的NSCLC細胞
2、順鉑耐藥逆轉中發(fā)揮重要調控作用。本實驗通過檢測5-Aza-dc誘導前后的耐順鉑細胞株A549/DDP細胞中miRNA表達譜變化,及預測分析miRNA的靶基因,探討miRNA是否與5-Aza-dc誘導的NSCLC細胞順鉑耐藥逆轉相關,為深入研究5-Aza-dc逆轉順鉑耐藥的miRNA調控機制提供基礎。
研究目的:
探討miRNA是否與5-Aza-dc誘導的NSCLC細胞順鉑耐藥逆轉相關;初步篩選出調控5-Aza-dc逆
3、轉NSCLC細胞順鉑耐藥過程的相關miRNA及靶基因。
研究方法:
以MTT法檢測A549/DDP細胞對順鉑的耐藥指數及5-Aza-dc對A549/DDP細胞的耐藥逆轉作用。miRNA芯片技術檢測5-Aza-dc誘導A549/DDP細胞后miRNA表達譜差異;quantitative real-timePCR(RT-qPCR)驗證芯片結果。生物信息學方法預測miRNA的靶基因,并對靶基因進行GO分析及KEGG信號通路
4、分析。
結果:
1.A549細胞和A549/DDP細胞對順鉑的IC50分別為6.79±1.58μM,39.39±2.86μM,耐藥指數RI為5.80,該A549/DDP細胞鑒定為對順鉑耐藥的肺癌細胞株。無毒劑量20μM5-Aza-dc誘導后的A549/DDP細胞對順鉑的IC50下降為17.21±3.13μM,耐藥逆轉指數為2.29,20μM5-Aza-dc誘導對A549/DDP細胞有明顯的耐藥逆轉作用。
2
5、.總RNA質檢顯示樣本純度高,完整性好,符合miRNA芯片要求。miRNA芯片結果顯示經5-Aza-dc誘導細胞后有131條差異表達的miRNA,其中43條miRNA(27條上調,16條下調)表達差異倍數在2倍以上,兩個樣品芯片雜交信號值均在100以上。RT-qPCR結果顯示與miRNA芯片結果趨勢相似。
3.生物信息學預測了miRNA如miR-320a,let-7b,miR-548j的靶基因,并分析靶基因的生物學功能及相關信
6、號通路,從中初步篩選出可能介導5-Aza-dc逆轉NSCLC細胞順鉑耐藥的相關靶基因,如BCL2L1,SMAD2,E2F3等,并分析得到靶基因相關的MAPK信號通路,Wnt信號通路,JAK/STAT信號通路,PPAR信號通路,凋亡相關通路,藥物代謝等信號通路,提示miRNA可能通過影響這些通路活性參與調控5-Aza-dc誘導的NSCLC細胞順鉑耐藥逆轉。
結論:
miRNA可能與5-Aza-dc誘導的NSCLC細胞順
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