BRM基因啟動子區(qū)插入-缺失多態(tài)與肝細胞肝癌易感性的關聯研究及功能分析.pdf

1、碩士學位論文論文題目BRM基因啟動子區(qū)插入缺失多態(tài)與肝細胞肝癌易感性的關聯研究及功能分析研究生姓名高學仁指導教師姓名高玉振副教授專業(yè)名稱細胞生物學研究方向腫瘤分子遺傳學論文提交日期2013年4月BRM基因啟動子區(qū)插入缺失多態(tài)與肝細胞肝癌易感性的關聯研究及功能分析中文摘要I中文摘要目的：研究BRM基因啟動子區(qū)域的兩個插入缺失多態(tài)BRM1321（rs3832613）和BRM741（rs34480940）與中國人群肝細胞肝癌（HCC）易感性的

2、關聯，并利用基因型表型關聯研究及生物信息學方法探討多態(tài)參與肝細胞肝癌發(fā)生的功能及意義。方法：（1）運用生物信息學工具篩選出BRM基因啟動子區(qū)域內的多態(tài)，并從中選取兩個具有潛在功能的插入缺失(Indel)多態(tài)位點BRM1321和BRM741作為候選多態(tài)；（2）基于第一步預測結果，采用病例對照研究方法（796HCC病例和806例正常對照），PCR擴增結合聚丙烯酰胺凝膠電泳技術對候選多態(tài)進行基因分型，Logistic回歸統(tǒng)計分析基因多態(tài)位點與

3、HCC的關聯性，SHEsis軟件分析BRM1321和BRM741組成的單倍型與HCC的關聯性；（3）對發(fā)現的陽性關聯位點，運用RealtimeRTPCR和WesternBlotting方法研究肝細胞肝癌組織、癌旁組織和肝癌細胞系中BRM1321多態(tài)及其單倍型與BRM表達量的基因型表型關聯；（4）運用生物信息學的方法預測多態(tài)位點BRM1321可能結合的轉錄因子。結果：（1）基因分型結果顯示，位于BRM基因啟動子區(qū)域內的位點BRM1321和

4、BRM741具有較好的多態(tài)性。BRM1321位點6bp插入缺失(InsDel)的基因型頻率在病例組中分別為0.418（DelDel），0.451（InsDel），0.131（InsIns）；在正常組中分別為0.540（DelDel），0.395（InsDel），0.066（InsIns）。BRM741位點7bp插入缺失（InsDel）的基因型頻率在病例組中分別為0.198（DelDel），0.467（InsDel），0.334（InsI

5、ns）；在正常組中分別為0.228（DelDel），0.479（InsDel），0.293（InsIns）。BRM1321位點和BRM741位點在對照組中的基因型頻率分布均符合HardyWeinberg平衡（P0.05）；（2）調整性別、年齡、吸煙、飲酒、HBV感染等主要風險因素后，運用Logistic回歸分析的方法對實驗數據進行統(tǒng)計分析，統(tǒng)計結果顯示：與BRM1321位點DelDel基因型相比，InsDel基因型和InsIns基因型個