廣西甘薯病毒病的檢測及2種病毒(SPFMV和SPLCV)的基因組序列.pdf

1、在廣西南寧、崇左、玉林、北海、河池、桂林市進(jìn)行甘薯病毒病的調(diào)查，發(fā)現(xiàn)病害的癥狀表現(xiàn)為葉片明脈、黃脈、花葉、皺縮、葉緣下卷、褪綠斑點(diǎn)等。所調(diào)查的甘薯種植區(qū)均發(fā)現(xiàn)甘薯病毒病，發(fā)病株率10％-80％。采集127個疑似感染甘薯病毒病的甘薯植株樣品，利用12對引物通過RT-PCR或PCR檢測甘薯病毒的種類，并對擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行測序和所獲序列的Blast分析，結(jié)果表明:為害廣西甘薯的病毒種類有11種，其中包括10種RNA病毒:甘薯羽狀斑駁病毒(Swee

2、t potato feathery mottle virus，SPFMV)、甘薯G病毒（Sweet potato virusG，SPVG）、甘薯褪綠矮化病毒（Sweetpotato chlorotic stunt virus，SPCSV）、甘薯輕型斑點(diǎn)病毒（Sweet potato mild speakingvirus，SPMSV）、甘薯C病毒（Sweet potato virusC，SPVC）、甘薯褪綠斑病毒（Sweetpotato

3、chlorotic fleck virus，SPCFV）、黃瓜花葉病毒(Cucumber mosaic virus，CMV)、甘薯脈花葉病毒（Sweet potato vein mosaic virus，SPVMV）、甘薯潛隱病毒（Sweetpotato latent virus，SPLV）、甘薯輕型斑駁病毒(Sweet potato mild mottle virus，SPMMV)，和1種DNA病毒:甘薯卷葉病毒（Sweet pota

4、to leaf curl virus，SPLCV）。在127個甘薯樣品中，上述11種病毒的檢測陽性率在5.51％-37.79％之間。
　　通過RT-PCR及RACE技術(shù)克隆了甘薯羽狀斑駁病毒廣西分離物(SPFMV-GX)的全基因組，SPFMV-GX全基因組核苷酸的長度為10895nt。基因組序列分析表明，SPFMV含有一個開放閱讀框(ORF)，編碼蛋白質(zhì)的分子量為:383.4kDa。5'非編碼區(qū)116個核苷酸，3'非編碼區(qū)299個

5、核苷酸。將所獲得的SPFMV-GX全基因組核苷酸序列在NCBI進(jìn)行Blast比對，結(jié)果顯示，SPFMV分離物之間的核苷酸序列的一致性在87.9％-98.4％之間，其中SPFMV-GX與來自西班牙(Spain)的SPFMV-Spain(KU511268)全基因組核苷酸序列一致性最高，為93.3％。用BioEdit對SPFMV-GX全基因組核苷酸序列和SPFMV其他分離物及馬鈴薯Y病毒屬其他成員的全長基因組核苷酸序列共有13個序列進(jìn)行進(jìn)化樹

6、分析，結(jié)果表明SPFMV-GX與SPFMV-Spain關(guān)系較近。
　　通過PCR技術(shù)克隆了甘薯卷葉病毒廣西分離物(SPLCV-GX)全基因組，SPLCV-GX全基因組核苷酸的長度為2828nt，SPLCV含有6個開放閱讀框(ORF)，分別編碼的蛋白質(zhì)分子量為:14.5kDa、29.4kDa、40.7kDa、16.7kDa、16.8kDa、9.2kDa。將所獲得的SPLCV-GX全基因組核苷酸序列在NCBI進(jìn)行Blast比對，結(jié)果顯