菠蘿蜜EST-SSR標(biāo)記發(fā)掘利用及遺傳圖譜構(gòu)建.pdf

1、鑒于目前可用于菠蘿蜜遺傳研究的分子標(biāo)記數(shù)量少，遺傳圖譜構(gòu)建研究進(jìn)度慢，為了提高菠蘿蜜分子標(biāo)記輔助育種效率，促進(jìn)菠蘿蜜遺傳改良，本研究通過菠蘿蜜EST-SSR標(biāo)記的穩(wěn)定性和多態(tài)性揭示能力分析，嘗試將其用于菠蘿蜜種質(zhì)資源遺傳多樣性和遺傳圖譜構(gòu)建研究。主要研究結(jié)果如下:
　　(1)本研究共設(shè)計(jì)出479對EST-SSR引物，其中399對在菠蘿蜜隨機(jī)選取的8份種質(zhì)的葉片DNA上能有效擴(kuò)增，282對具有多態(tài)性，多態(tài)性擴(kuò)增引物占58.87％。<

2、br>　　(2)從中選擇60對能夠清晰擴(kuò)增的多態(tài)性引物，分析了64份菠蘿蜜種質(zhì)資源的遺傳多樣性。這60對EST-SSR引物共擴(kuò)增出188條帶，不同引物的擴(kuò)增條帶數(shù)在2～11之間，平均為3.13條;其中有168條為多態(tài)性條帶，多態(tài)性率為89.36％;每對引物的多態(tài)性信息含量(PIC)范圍為0.4077～0.9589，平均PIC值為0.7922。證實(shí)了EST-SSR標(biāo)記多態(tài)性揭示能力較強(qiáng)。
　　(3)由UPGMA聚類分析可知，在遺傳相

3、似系數(shù)0.6881處，可將64份菠蘿蜜種質(zhì)資源分成2大類群;在遺傳相似系數(shù)0.7325處，第二大類群雖又可分成4個(gè)亞群，但仍未能將干、濕苞獨(dú)立分類。
　　(4)利用有101個(gè)單株的F1代作圖群體，從399對EST-SSR引物中篩選出在雙親和6個(gè)隨機(jī)子代中存在多態(tài)性的引物有93對，占23.31％。利用93個(gè)EST-SSR標(biāo)記對F1作圖群體進(jìn)行基因分型，分別通過“一步法”和“二步法”利用JoinMap4.1軟件構(gòu)建了2張菠蘿蜜遺傳圖譜