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文檔簡介
1、慢型骨骼肌肌鈣蛋白基因主要包括肌鈣蛋白C1基因(Troponin C type1,TNNC1)、肌鈣蛋白I1基因(Troponin I type1,TNNI1)和肌鈣蛋白T1基因(Troponin T type1,TNNT1),它們對骨骼肌的收縮、骨骼肌肌肉纖維特性及多種疾病的發(fā)生有密切關系。目前,有關綿羊的TNNC1、TNNI1和TNNT1基因的全長核酸序列未見報道。本試驗采用RT-PCR、RACE、生物信息學分析、熒光定量 PCR等
2、技術方法,克隆了小尾寒羊TNNC1、TNNI1和TNNT1基因的全長序列,預測分析了其對應蛋白的序列和特性,構建了其在小尾寒羊和杜泊羊多種組織的表達譜,從分子水平上探索了小尾寒羊三個基因的主要結構和表達特性。主要結果如下:
(1)克隆測序得到了小尾寒羊TNNC1、TNNI1和TNNT1基因的cDNA序列,其中TNNI1包含兩個5′端有區(qū)別的序列,并分別命名為TNNI1a和TNNI1b。得到的TNNC1、TNNI1a和TNNT1
3、基因的全長cDNA序列及TNNI1b基因的部分cDNA序列已提交至GenBank,并分別獲得登錄號為KR153938、KT218688、KT218689及KT218690。相應的編碼氨基酸長度分別為161、187、194和263個氨基酸。
(2)cTnC蛋白為偏酸性蛋白,且結構比較穩(wěn)定,親水性比較好,流動性比較大;ssTnI蛋白兩種亞型均為偏堿性蛋白,且結構相對不穩(wěn)定,親水性比較好;ssTnT蛋白為偏酸性蛋白,流動性一般,結構
4、不是很穩(wěn)定,但親水性比較好,流動性比較大。cTnC、ssTnI和ssTnT蛋白均沒有跨膜結構域,含有多個磷酸化位點,無任何 N-糖基化位點,預測為非分泌性蛋白質。二級結構主要以α-螺旋和無規(guī)則卷曲為主。
(3)多物種氨基酸序列比對結果顯示:cTnC蛋白的氨基酸序列在本試驗分析的物種中高度保守。ssTnI兩亞型蛋白和ssTnT蛋白的氨基酸序列均與試驗中其它哺乳動物的保守性比較高,而與試驗中其它的非哺乳動物的保守性相對較差。系統(tǒng)進
5、化樹結果顯示:綿羊的cTnC蛋白最先與野豬、家牛和山羊聚到一類;綿羊的ssTnI蛋白最先與山羊和家牛聚到一類;綿羊的ssTnT蛋白最先與野豬和家牛聚到一類。上述結果表明小尾寒羊中的cTnC、ssTnI和ssTnT蛋白均與試驗中的其它哺乳動物的關系比較近。
(4)TNNC1、TNNI1和TNNT1基因在小尾寒羊和杜泊羊的多種組織中的表達情況不同,然而,這幾個基因的表達模式卻存在一定的共性。TNNC1、TNNI1和TNNT1基因均
6、在肋間肌、股二頭肌和背最長肌中高表達,且其表達量均為肋間肌>股二頭肌>背最長肌。小尾寒羊和杜泊羊中TNNI1a基因在每個組織中的表達量都高于TNNI1b基因在各組織中的表達量。此外,TNNC1、TNNI1和TNNT1基因在小尾寒羊和杜泊羊兩品種羊中的表達量也存在明顯的區(qū)別。特別的,TNNI1a在小尾寒羊肋間肌中的表達量顯著高于其在杜泊羊中的表達量(p<0.05)。三個基因對應的蛋白均在背最長肌、肋間肌、股二頭肌中存在表達,此外,在兩品種
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